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#HilosMicrobiología. Finalmente, me he animado a hacer este hilo. No quería precipitarme demasiado en escribirlo hasta no saber lo suficiente como para redactarlo. Abro hilo sobre el nuevo coronavirus (COVID-19).
Bien, empecemos definiendo que son los coronavirus para entender un poco sus orígenes. Pertenecen a la familia Coronaviridae, dentro del orden Nidovirales y se dividen en 4 géneros: alfa, beta, gamma y delta. Son virus con RNA monocatenario positivo envueltos y con...
...una nucleocápside de simetría helicoidal.
El genoma codifica para cuatro o cinco proteínas estructurales: la S (espicular) que forma la corona típica de los coronavirus y que parece ser que es la que permite la unión al receptor ACE2 de las células epiteliales...
...de las vías respiratorias, la M (de membrana) que juega un papel importante en el ensamblaje celular, la N (nucleocápside) que parece que está implicado en la regulación de la síntesis del ARN viral, la E (envoltura) cuya función no se conoce con exactitud y la HE...
...(hemaglutinina-esterasa) que se encuentra solo en los betacoronavirus.

Los coronavirus que afectan a humanos están dentro de los géneros alfa (HCoV-229E y HCoV-NL63) y beta (HCoV-HKU1, HCoV-OC43, MERS-CoV, SARS-CoV y el nuevo coronavirus COVID-19).
La secuenciación completa de COVID-19 mostró que está dentro del mismo subgénero que el SARS. La estructura aparente de la región del gen de unión al receptor es muy similar a la del coronavirus del SARS, y se especula que usa el mismo receptor para la entrada celular.
El MERS otro betacoronavirus, parece estar más distantemente relacionado con este.
De los coronavirus se sabe que suelen causar infecciones agudas adquiridas en la comunidad de tipo leve en los seres humanos, de hecho, producen alrededor del 15% de los resfriados comunes...
...en el ser humano. Suelen ser epidémicas en los meses invernales.
No fueron considerados como altamente patogénicos para el ser humano hasta que ocurrieron los brotes del síndrome respiratorio agudo severo (SARS en inglés) y el síndrome respiratorio de oriente medio (MERS).
Repasemos un poco los dos:

Los primeros casos de SARS fueron detectados por primera vez en la provincia de Guangdong, China, en noviembre de 2002. El virus se propagó rápidamente desde el sur de China y Hong Kong a Vietnam, Tailandia y Singapur, y luego a Europa, Canadá...
...y Estados Unidos. Los casos de SARS ocurrieron en 29 países de Asia, Europa y América del Norte.
China, incluido Hong Kong, tuvo el 83% de todos los casos. Estados Unidos tuvo 27 casos probables sin casos secundarios y sin muertes.
La OMS y la CDC de los Estados Unidos realizaron esfuerzos extraordinarios de contención mediante la aplicación de prácticas de control de infecciones, particularmente en hospitales. En julio de 2003, no se informaron casos nuevos en todo el mundo. El brote de 2002 a 2003...
... resultó en 8096 casos con 774 muertes y una tasa de letalidad de un 9.6 por ciento. La edad avanzada se asoció con una mayor tasa de mortalidad, llegando a ser de un 43% en pacientes de 60 años o más en Hong Kong en comparación con 13 % en pacientes más jóvenes.
Del SARS se sabe que pudo ocurrir como una transmisión zoonótica desde las civetas vendidas en el mercado siendo el hospedador natural los murciélagos.

El primer caso de MERS fue aislado e identificado por primera vez en Arabia Saudí en septiembre de 2012 en un paciente...
...de 60 años que murió de una neumonía grave y un fallo multiorgánico. Desde entonces, y según la OMS, 27 países han informado casos producidos por el MERS-CoV. Se han notificado hasta noviembre de 2019 2494 casos y 858 muertes. Un 60% de los afectados son hombres...
...con un 30% de mortalidad asociada. Es probable que el número real de casos sea mayor. Los casos han ocurrido principalmente en países de la Península Arábiga; la mayoría en Arabia Saudita, incluidos algunos grupos de casos. También se han informado casos de otras regiones...
...como África del Norte, Europa, Asia y América del Norte.

El receptor celular específico de este virus es la DPP-4 (dipeptil peptidasa 4) que se encuentra en numerosas células de los pulmones, riñones y del tracto gastrointestinal, lo que explicaría en parte el fallo...
...multiorgánico que se produce en los casos más severos.
Se presume que el reservorio natural de MERS-CoV son los murciélagos, pero los eventos de transmisión humana se han atribuido principalmente a un huésped intermedio, el dromedario.
A diferencia del SARS, sigue...
...habiendo pequeños brotes producidos por este virus, por suerte, no parece que el virus se transmita fácilmente de una persona a otra a menos que haya un contacto estrecho.
En las siguientes imágenes muestro los hospedadores de los coronavirus así como la transmisión.
Bien, dicho esto vamos a entrar a hablar del nuevo coronavirus: COVID-19. Empecemos con la cronología de los hechos:
En diciembre de 2019 se detectan en Wuhan unos casos de neumonía atípica cuyo origen es desconocido, tras una investigación todo apunta a que el origen...
...se produce en un mercado mayorista de animales vivos.

El 1 de enero el mercado es cerrado y el 9 de enero las autoridades chinas confirman la presencia de un virus en 15 de los 59 casos de neumonía. Se descarta la gripe y se piensa que puede ser un nuevo tipo de coronavirus.
El 10 de enero se hace público el genoma del virus y para el 13 de enero ya está disponible el protocolo para realizar la RT-PCR para detectar el virus.

El 20 de enero se confirman casos en 4 países. La transmisión entre personas aunque limitada se confirma.
Para el 21 de enero, el virus es considerado de categoría B sujeta a cuarentena en las fronteras. China aplica medidas de prevención y control máximo.

El 23 de enero, la ciudad de Wuhan establece cuarentena total. Cierra sus aeropuertos, trenes, autobuses y metro.
A 27 de enero, se confirma que el virus es contagioso antes de presentar síntomas.

El 30 de enero la OMS establece la emergencia internacional.

El 11 de febrero, la OMS anuncia que le han puesto nombre a la enfermedad: #COVID19. El nombre oficial del virus es SARS-Cov-2.
El 21 de febrero el coronavirus llega a Italia con 16 infectados, 250 personas en cuarentena y piden a 10 municipios que no salgan de sus casas.

Un resumen de la cronología queda reflejada en esta imagen:
Si queréis ver la cronología actualizada os recomiendo este blog: microbioun.blogspot.com escrito por @microBIOblog que os animo a seguir.

Muy bien y ¿cuál es la cronología en España? Veámosla (actualizada a 26/2):
@microBIOblog El pasado 31 de enero se confirmaba el primer caso de coronavirus en España. Concretamente en La Gomera, donde las autoridades confirmaron el positivo de uno de los cinco alemanes aislados por haber estado en contacto en su país con una persona afectada por el coronavirus.
El 9 de febrero, el Centro Nacional de Microbiología confirmaba un segundo caso en Palma de Mallorca. Un paciente británico, que había estado en contacto con una persona afectada con el coronavirus.

El 24 de febrero se confirmaba el tercer caso de coronavirus en España.
Tras su rápida propagación por Italia, el virus volvía a España (Tenerife) de la mano de un ciudadano italiano natural de Lombardía que es médico de profesión.

Varias horas más tarde, las autoridades confirmaban a la mujer del médico como cuarta afectada por el coronavirus.
Debido a ello, la Dirección General de Salud Pública ordenaba el control sanitario de todos los huéspedes del mismo hotel en el que se alojaban los pacientes afectados.

El 25 de febrero se confirmaron los tres primeros casos en la península. La Generalitat de Cataluña...
...confirmaba el positivo de una mujer italiana de 36 años que vive en Barcelona y que había viajado al norte de Italia recientemente. Horas más tarde, la Conselleria de Sanitat de la Generalitat Valenciana confirmaba el sexto caso tras el positivo de un hombre en...
... el Hospital La Plana de Vila-real (Castellón). Un virus que también llegaba a Madrid de la mano de un joven de 24 años, quien había viajado al norte de Italia en las últimas semanas.

El 26 de febrero se confirman dos nuevos casos de Tenerife y horas mas tarde se confirman...
... otros tres más en Cataluña, Madrid y Sevilla. A última hora de hoy se ha confirmado otro caso en La Gomera, elevándose a 11 el número total de afectados por coronavirus en España.
Se da por hecho que se produjo una transmisión zoonótica desde algún animal a los humanos, aunque aún no ha sido identificado el animal en cuestión que funcionaría como hospedador intermediario. Han sido descartados la serpiente y el pangolín. Podéis ver más información en...
...este artículo de @emulenews:

francis.naukas.com/2020/02/24/la-…

Transmisión: Se transmite de forma limitada entre humanos, en general por vía respiratoria a través de las gotitas que producen los portadores cuando tosen, estornudan o hablan. Estas gotitas pueden llegar a la boca o...
... la nariz de las personas que se encuentren cerca o posiblemente entrar a los pulmones al respirar. Aunque también se puede transmitir por el contacto humano o por objetos o sustancias contaminadas.

Se cree que las personas son más contagiosas cuando están sintomáticas,...
...aunque podría ser posible que haya algo de propagación antes de que las personas presenten síntomas; ha habido informes sobre esto con relación a este nuevo coronavirus, aunque no se cree que esta sea la principal forma en que se propaga el virus.
El R0 de este virus no se sabe aún con seguridad, pero se calcula entre 2 y 3,77. Las características principales las podéis ver aquí:

Una revisión de la literatura sobre la persistencia de los coronavirus refleja que los coronavirus humanos, como el SARS, el MERS o los coronavirus humanos endémicos (HCoV) pueden persistir en superficies inanimadas como metal, vidrio o plástico hasta 9 días, pero se pueden...
...inactivar de manera eficiente mediante procedimientos de desinfección de superficie con etanol al 62–71%, peróxido de hidrógeno al 0.5% o hipoclorito de sodio al 0.1% en 1 minuto.

Clínica: Se cree que el período de incubación de COVID-19 está dentro de los 14 días...
...posteriores a la exposición, y la mayoría de los casos ocurren aproximadamente cinco días después de la exposición.
Tiene síntomas muy parecidos a la gripe, que incluyen fiebre, tos seca, disnea (dificultad respiratoria), congestión nasal y dolor de garganta. Además...
...se han informado síntomas gastrointestinales en algunos pacientes, pero estos son relativamente poco frecuentes.
La tasa de mortalidad ha sido establecida por la OMS entre el 2 y el 4% en la ciudad de Wuhan, epicentro del brote, y en un 0,7% fuera de ella. Por grupos de edad:
La imagen fue obtenida de @iescolar.

Y las características principales hasta la fecha de los casos en China es la siguiente:
De 44,672 infecciones confirmadas con una estimación de la gravedad de la enfermedad, el 81% fueron leves (sin neumonía o leves), el 14% fueron graves (por ejemplo, con disnea, hipoxia, o> 50 por ciento de afectación pulmonar en las imágenes dentro de las 24 a 48 horas), y 5%...
...fueron críticos.

De estas estadísticas se pueden sacar varias conclusiones: que la mortalidad va aumentando con la edad (un 0,4% hasta los 50 años), que el virus complica y acelera otros procesos patológicos previos (la preexistencia de otras enfermedades también influye...
...en la probabilidad de muerte) y que también influye el lugar geográfico y sus condiciones sanitarias siendo mayor la mortalidad en sistemas sanitarios saturados. De todas formas, quedan cosas por conocer de este virus.

Diagnóstico: el enfoque del tratamiento inicial debe...
...centrarse en el reconocimiento temprano de casos sospechosos, el aislamiento inmediato y la institución de medidas de control de infecciones. Según el procedimiento de actuación de la Comunidad de Madrid consultado el día 25 de febrero, se considerarán casos en...
...investigación de COVID-19 los que cumplan alguno de los siguientes criterios:
El procedimiento se puede encontrar aquí:
comunidad.madrid/sites/default/…

El diagnóstico se establece mediante la detección del virus mediante una RT-PCR.

Tratamiento: no hay un tratamiento antiviral específico que se recomiende para el COVID-19. Tampoco hay vacuna. Las personas con...
... el COVID-19 deben recibir cuidados de apoyo para ayudar a aliviar los síntomas. En los casos graves, el tratamiento debe incluir atención médica para apoyar el funcionamiento de los órganos vitales.
La OMS y los CDC recomiendan que los glucocorticoides no se usen en...
...pacientes con neumonía por COVID-19 a menos que haya otras indicaciones. Los glucocorticoides se han asociado con un mayor riesgo de mortalidad en pacientes con influenza y un aclaramiento viral tardío en pacientes con infección por MERS-CoV.
Se están explorando agentes de investigación para el tratamiento antiviral de COVID-19. Como ejemplo, el fabricante de remdesivir, un análogo de nucleótido novedoso que tiene actividad contra el virus COVID-19 y los coronavirus relacionados (incluyendo SARS y MERS-CoV) in vitro.
También ha habido interés en el inhibidor combinado de proteasa lopinavir-ritonavir, que se usa para el tratamiento de la infección por VIH. Este agente combinado tiene actividad in vitro contra el SARS-CoV y parece tener cierta actividad contra el MERS-CoV en estudios con...
...animales. El uso de este agente para el tratamiento de COVID-19 se ha descrito en informes de casos, pero su eficacia no está clara y se está evaluando en ensayos aleatorios más grandes.

Prevención: la CDC ha emitido una serie de recomendaciones para evitar la propagación...
...y el contagio por el virus. Las recomendaciones quedan resumidas en:
O si se prefiere en infografía:
Mi opinión personal acerca de este virus va en consonancia a lo escrito por el @drmiguelmarcos en este hilo:
Es un virus que aunque su mortalidad no parece muy elevada, sí que es problemático porque se transmite con más facilidad que la gripe. De ahí que se establezcan tantos protocolos de contención y aislamiento del virus. Cuantos más casos haya, más probabilidad de casos graves se...
...van a producir y esto es lo que se está intentando evitar a toda costa.
Mis recomendaciones son: evitar el pánico, seguir a fuentes fiables como @sanidadgob y ante caso de duda de padecer los síntomas contactar telefónicamente con los servicios de salud.
Hasta aquí el hilo. Agradecer a @joseluiscortesc prestarme algunas de sus diapositivas para este hilo.

Las fuentes consultadas han sido las siguientes:
- journalofhospitalinfection.com/article/S0195-…
- cdc.gov/coronavirus/20…
- comunidad.madrid/sites/default/…
- francis.naukas.com/2020/02/24/la-…
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