1/n Des virologues de l'Institut Pasteur ont tenté de reconstituer l'origine et l'évolution des SARS-CoV-2 en France en séquençant 97 virus isolés de patients français et en les comparant aux séquences de 338 virus disponibles pour d'autres pays.biorxiv.org/content/10.110…
2/n Ils en concluent principalement deux choses 1- Les mesures pour contenir les contaminations venues de Chine semblent avoir été efficaces puisqu'il n'y a pas de descendants des souches identifiés chez les cas d'origine chinoise identifiés en France.
3/n 2-La majeure partie des cas identifiés en France pourrait avoir dérivé de quelques cas dont un sans contact avec des étrangers (cas autochtone) dans les Hauts de France et appartiennent tous au même clade G (d'autres clades V, S circulent dns le monde)
4/n Cette circulation qui concerne le Nord de la France et les zones les plus touchées d'ïle de France et du Grand Est, pourrait être passée inaperçue car provoquant des infections pue ou asymptomatiques alors que la surveillance se focalisait sur les cas sévères.
5/n Voici des aperçus de la zone de circulation des virus identifiés par l'Institut Pasteur, travaillant sur les virus isolés au Nord de la France 
6/n Voici l'arbre phylogénétique. Le premier virus isolé, dont dérivent les autres virus identifiés peut correspondre à une mutation qui se serait produite entre le 18/12 et le 25/01. Carte phylogénétique interactive avec les données individuelles nextstrain.org/community/Simo…
