Thread by @rquiroga777

Qué es la inmunidad de rebaño (IdR)?

Hay un efecto de IdR con un 20% de infectados, cómo sugieren @FernanQuirosBA y @DrDanielGollan?

Qué evidencias hay al respecto?

Hay 13% de infectados en CABA?

Cuántos fallecidos covid19 podemos esperar en Argentina?

Sale hilo.

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Empecemos por el principio. Inmunidad de rebaño significa que una población tiene suficientes inmunizados para que no haya brotes significativos de una enfermedad, aunque no hagamos nada para evitar su propagación (ni usar barbijos, ni distanciamiento, ni cuarentenas, etc).

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Qué porcentaje de la población es necesario inmunizar para que ésto ocurra? Depende de la contagiosidad del patógeno en cuestión, y se estima a través del R0 (a cuántas personas contagia en promedio cada infectado).

Para covid ese valor es 2.5-5 dependiendo del país.

3/

En general hablamos de inmunidad de rebaño cuándo pensamos en campañas de vacunación, no en inmunidad adquirida naturalmente por exposición a los patógenos.

Cuándo ésto ocurre, el % de infectados supera el % necesario para la IdR: "overshooting" cómo explica Carl Bergstrom.

4/

Para calcular el % de inmunizados necesario para alcanzar IdR calculamos: (R0-1)/R0.

Para R0 de 2.5, (2.5-1)/2.5=0.6=60%

Sin embargo, el % final de infectados dependiendo del R0 es aprox 1-e^(-R0)

1-e^(-2.5)~= 0.91~=91%!

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Ésto significa que para volver a la "normalidad" anterior a la pandemia, dependiendo de que se infecte suficiente cantidad de personas necesitamos que se infecte al menos el 60-90% de la población!

Entonces, por qué en Europa están reabriendo y no hay brotes por todos lados?

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En Europa las grandes ciudades tienen prevalencia (% de habitantes inmunizados) de ~11-18% dependiendo de la ciudad. Cómo se estima? Usando tests rápidos que detectan anticuerpos (como el de @GamarnikLab). Se estima que el que tiene anticuerpos estuvo expuesto al virus.

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Significa ésto que hay IdR con esos porcentajes tanto menores a 60%? No, porque en ningún lado se ha vuelto a la total normalidad. La gente usa barbijos, nadie saluda con besos, ni se comparten botellas o vasos cómo antes. Adicionalmente, el clima ayuda a bajar el R efectivo.

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La combinación de mantener los nuevos hábitos que disminuyen la circulación viral, junto con el clima, la menor circulación de personas, y un porcentaje de personas inmunizadas se combinan para llevar el R efectivo por debajo de 1, lo cuál hace poco probable q haya brotes.

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Sin embargo, hemos visto cómo la apertura de actividades de alto riesgo de contagio en Israel, cómo escuelas, bares, restaurantes y shoopings, generó nuevos brotes del virus y debieron volver a cuarentena estricta. Lo mismo en Cataluña, Melbourne, Berlín,etc.

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Ahora, con un alto acatamiento de cuidados q reduzcan R a 1.2, alcanza una inmunidad del 20% para frenar la circulación viral? Quizás. Pero en Europa combinaron esa inmunidad con fuertes cuarentenas para bajar muchísimo el número de casos.

Prevalencia de distintas ciudades:

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Cómo vemos, la circulación del virus se detuvo en distintas ciudades de España con distintas prevalencias, lo cuál sugiere que lo que disminuyó la circulación es la cuarentena, y no la prevalencia.

Luego, tener más inmunizados puede disminuir la probabilidad de rebrotes.

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Por otro lado, la letalidad real (IFR= fallecidos/infectados, a contraposición del CFR= fallecidos/casos_detectados) calculada por decil etario nos permite usar el número de fallecidos para estimar la prevalencia, si asumimos que el contagio es igual para todas las edades.

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Podemos ver que ésta estimación se acerca muchísimo a la prevalencia real para Ginebra, París, Londres y la villa 31.

Por otro lado, en Latinoamérica la epidemia no se detiene en 10-20% de infectados, sino q el contagio prosigue hasta al menos 30%!

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Cómo dice éste artículo que apareció en The Lancet, por investigadores del Imperial College y de Oxford, "ningún país tuvo infecciones suficientes como para evitar segundas olas si se relajan las medidas de distanciamiento o la precaución individual de la ciudadanía."

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Con respecto a la prevalencia en CABA, creo que la estimación de Quirós multiplicando casos por 10, es complicado porque aunque las infecciones reales son 1:10 en población joven, eso no ocurre en poblaciones de mayor edad, cómo vemos en España.

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Al utilizar una estimación basado en las muertes y la edad poblacional, para la villa 31 da 50,2%, muy cercano al 51.3% que midieron @FernanQuirosBA y @GamarnikLab .

Utilizando la misma estimación para CABA, me da 5.8%, muy lejos del 13% y aún más del 20%.

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Creo q los contagios, de no cambiar significativamente:

* Conducta social
* Cuarentena con alto cumplimiento * Rastreo masivo y temprano

Los casos van a seguir aumentando al menos hasta el 30% de prevalencia, lo cual implica unas 12000 muertes en el GBA y 4500 en CABA.

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Muy buen video, conciso y contundente, sobre la inmunidad de rebaño.

https://twitter.com/NicoOlsze/status/1286062438979379200?s=19

Agrego porque hay muchos repitiendo lo que suele decir Polack de 1000 infectados por fallecido.

Esa estimación de 0.1% de letalidad real (IFR) no encaja con los datos reales.

En Nueva York, si el 100% se hubiera infectado tendría letalidad del 0.22% .

Si en realidad los infectados en Nueva York son el 25%, la letalidad sería 0.88%.

Entonces, el cálculo más realista es 1 fallecido cada 100-300 infectados, dependiendo de la edad de la población. Más cerca de 1:100 para España y NY, 1:200 para CABA y 1:300 para el resto de Arg.