La virologa cinese #LiMengYan dice che #SARSCoV2 è stato creato in un #laboratorio di #Wuhan. Senza vedere le prove (che lei sostiene di avere), mi risulta difficile credere alla sua tesi. 1/
nypost.com/2020/09/11/chi…
La scienziata, infatti, sostiene che #SARS2 sia una #chimera dei virus dei #pipistrelli ZC45 e ZXC21.

Ora, è vero che a Wuhan facevano chimere a scopi di ricerca, ma questi due virus sono troppo diversi da SARS2 per essere i suoi antenati diretti. 2/

Il nuovo #coronavirus infatti ha una similarità dell'87% con questi due virus, troppo poco per essere il risultato di una loro ricombinazione (il virus più simile a SARS2 è #RaTG13). 3/
La virologa sostiene inoltre che i cinesi avrebbero "corretto" il genoma di SARS2 caricato in database, per nascondere la somiglianza con i due virus di partenza.

A me non risulta: la seconda versione del genoma caricato in Genbank è praticamente identica alla prima. 4/
In ogni caso, anche se avessero fatto questa correzione, #SARSCoV2 ha ormai girato il mondo (ahimè) ed è stato sequenziato migliaia di volte. Se ci fosse stata una chiara somiglianza con ZC45 e ZXC21 qualcuno se ne sarebbe accorto! 5/
Sono il primo ad avere dubbi sulla Cina: temo non siano stati totalmente trasparenti e forse non ci hanno detto tutto sulle origini del virus. Ma la tesi di #LiMengYan non mi convince per niente!

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Mar 7
Breve thread per gli italiani confusi dalle dichiarazioni di #Palù, apparse negli stessi giorni in cui la stampa internazionale sta invece rilanciando l'ipotesi wet market per l'origine di SARS-CoV-2. 1/
Palù si riferisce a un suo paper pubblicato due settimane fa in cui segnalava la presenza di una particolare sequenza del virus (quella che codifica per il Furin Cleavage Site, FCS) in una vecchia sequenza brevettata da Moderna per la cura del cancro. 2/
Nella sequenza di Moderna, però, quel pezzo di DNA non codifica per il FCS. Inoltre manca tra le due sequenze la somiglianza necessaria per permettere una ricombinazione e quindi l'inserimento del frammento nel virus (scenario ipotizzato nel paper). 3/
Read 10 tweets
Mar 1
I've had a closer look at the preprint recently published by @MichaelWorobey and others. Everybody knows that I have been skeptical about the market origin hypothesis and I sympathize with many "lab leakers". However, this time I am quite impressed. 1/
zenodo.org/record/6299600…
Since the beginning of the pandemic, we have been struggling to get access to relevant data from China (both from the labs and the market). But these guys made a tremendous effort to extract as much as info as possible from imperfect data, and I think they did a good job. 2/
I mean, they pulled out the geographical coordinates of COVID cases from a low resolution map! This is not something which is frequently done in science, especially because those data must exist somewhere in China (and for some reason they were not shared). Respect for that! 3/
Read 21 tweets
Feb 22
È uscito su @FrontVirology un articolo firmato da Giorgio #Palù dove si ipotizza che il sito di taglio della #furina presente in SARS-CoV-2 possa essere stato ottenuto in laboratorio. 1/
frontiersin.org/articles/10.33…
L'ipotesi parte dalla scoperta di una sequenza brevettata da #Moderna in cui si trovano 19 nucleotidi identici a quelli che nel virus codificano per il famoso furin cleavage site (FCS). 2/ Image
La sequenza in questione è una versione ottimizzata del gene umano Msh3. Si tratta di una proteina coinvolta nella riparazione del DNA, e nell'intenzione di Moderna sarebbe una molecola da utilizzare per la terapia oncologica. 3/
Read 7 tweets
Dec 28, 2021
Mi sono divertito ad usare il tool online di @bmj_latest per calcolare la capacità predittiva di due test #antigenici disponibili in commercio: un #tampone nasale e un salivare. 1/
Il produttore dichiara per il tampone nasale una sensibilità del 95.4% e una specificità del 99.4%. I valori per il test salivare sono più bassi: rispettivamente, 90.1% e 99.3%. 2/
Il tool online di BMJ utilizza il teorema di #Bayes per calcolare la probabilità che un soggetto sia positivo quando il risultato del test è positivo, e quando invece è negativo. 3/
bmj.com/content/369/bm…
Read 10 tweets
Dec 12, 2021
Big news from China on the search of the #OriginOfCovid - Head of Chinese WHO team attacks @MichaelWorobey paper: "unscientific to conclude that some early cases living close to the market was proof that it was the origin of the community transmission." 1/
archive.md/ybb2a
"Liang said Worobey did not verify the identity of a patient featured in The Paper’s video report. He said the first identified Covid-19 case did visit the hospital between December 6-8, and was accompanying a family member for a tooth extraction." 2/
"However, he also started experiencing cold-like symptoms such as headaches and dizziness on December 8. The female vendor from Huanan Market who had symptom onset on December 11, mentioned in the Science article, was not the first known Covid-19 case."
Read 6 tweets
Dec 8, 2021
Someone found in a #Moderna patent from 2017 a short nucleotide sequence that is identical to the one encoding for the Furin Cleavage Site in SARS-CoV-2. While this may seem suspicious at first sight, I'll try to explain why there's "nothing to see here". 1/
First of all, the nucleotide sequence is really there. It is located in sequence 11652 from patent US 9587003, position 2733-2751 (revers strand). The Genbank ID is KH664781. 2/
ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KH6647…
The Moderna patent covers "modified polynucleotides for the production of oncology-related proteins and peptides". In other words, these are RNA molecules that are used in #cancer therapy, and were modified in order to improve the efficacy of treatment. 3/
lens.org/lens/patent/19…
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