[1] Un tema que merece ser aclarado hasta el cansancio y más allá. Las respuestas a este tuit de @rburhum muestran que a pesar de la debacle vivida, mucha gente toma las versiones del MINSA como hechos incuestionables. Sin espíritu crítico es fácil caer en falacias de autoridad
[2] El MINSA se resiste a dejar de usar pruebas diagnósticas y medicamentos que nos trajeron más problemas que soluciones. Tantear con medicamentos quizás fue admisible los primeros dos meses pero no sin ensayos clínicos, y hoy de ninguna manera. NO HAY CURA CONTRA EL COVID-19
[3] Lo de las pruebas rápidas serológicas es indefendible. Decir que no había pruebas moleculares en el mercado ni laboratorios para procesarlas son a lo mucho medias verdades para justificar la pobre capacidad de respuesta y el poco sentido de urgencia con que se actuó
[4] Derribemos el primer mito. Diversos reportes periodísticos han demostrado que sí había pruebas moleculares RT PCR en el mercado. Es más, la gran mayoría de países vecinos las consiguió e implementó. En Colombia, la jefa del INS sí se compró el pleito: lasillavacia.com/marta-ospina-c…
[5] Eso sólo considerando la tecnología estándar RT-PCR. Aún si efectivamente Trump hubiese vaciado el mercado d estas pruebas, había otras tecnologías disponibles que ameritaban consideración dada la emergencia sanitaria y la urgente necesidad d cercar al virus con tests masivos
[6] Por ejemplo, todo biólogo molecular sabe que la PCR convencional y análisis electroforético son opciones básicas de amplia disponibilidad en laboratorios académicos. Algo más lentas pero efectivas y de bajo costo, y hubieran sumado mucho si hubiésemos pensado fuera de la caja
[7] Tb había otras tecnologías moleculares de detección como amplificaciones isotérmicas, detección colorimétrica o CRISPR, tamizajes genómicos, etc. Estas alternativas no tenían aún aprobación internacional pero eran factibles utilizando criterios de ciencia y tecnología propios
[8] Como ya quedó demostrado, había suficiente know-how en Universidades para hacerlo pero el @Minsa_Peru trabajó exclusivamente con el @INS_Peru y de espaldas al sector académico. La infame fractura entre Estado y Sociedad Civil, la desconfianza y el afán de protagonismo estatal
[9] En medio d tanta muerte, era necesario actuar rápido y con sentido de urgencia, cambiar normas e implementar nuevas salidas. Para un funcionario público del @Minsa_Peru eso equivalía a arriesgarse a una fiscalización d @ContraloriaPeru o a perder su trabajo. No se atrevieron
[10] Ahora el segundo mito. Ciertamente, al principio había solo un laboratorio acreditado por el INS para hacer diagnóstico molecular de COVID-19: el del propio INS, oh sorpresa. Sin embargo, ya habían laboratorios en el país con la capacidad e infraestructura mínimas
[11] Los requisitos exigidos por el INS para la acreditación eran excesivos y propios de “tiempos de paz”. Desde una comisión de expertos del MINSA recomendamos reducir los cerca de 100 requisitos a 10 (otros países los redujeron a 5 o 6). Luego de meses, se redujeron a “sólo” 50
[12] Estos criterios poco realistas hicieron extremadamente lenta y difícil la acreditación de laboratorios que hubiesen podido ayudar desde un primer momento, como labs académicos y privados. Mientras nosotros acreditábamos de uno en uno, nuestros vecinos acreditaban por decenas
[13] Un caso revelador es el del prestigioso Instituto de Medicina Tropical Alexander von Humboldt, de los más reputados del continente y casa de notables infectólogos y epidemiólogos. Fue el primero en ofrecer sus labs, equipos y personal pero su acreditación tardó medio año
[14] Similar suerte corrieron otros labs universitarios y privados. Algunos tenían capacidad para hacer miles de diagnósticos al día. En vez de facilitar y acelerar su acreditación, se les descartó y más bien se destinó fondos a aumentar la capacidad diagnóstica del INS/MINSA
[15] Tercer mito: “la acreditación fue lenta porque los labs deben cumplir con niveles de bioseguridad BSL2 (materiales infecciosos) para todo el proceso de diagnóstico”. Esto se basó en RECOMENDACIONES internacionales (no obligatorias) para tiempos de paz, se pudo flexibilizar
[16] Hacer esto requería usar nuestro know-how y expertise con una libertad de criterio que no tuvimos. El primer paso del diagnóstico es inactivar el virus para extraer su material genético y hacer la PCR. Luego de este primer y sencillo paso, la muestra deja de ser infecciosa
[17] Por eso se propuso hacer solo el primer paso en laboratorios BSL2 que no requieren estar equipados para biología molecular (hay varios) y luego distribuir el material genético no infeccioso a los muchos labs BSL1 (académicos y privados) que podían ser acreditados fácilmente
[18] Si el Estado insiste en las normativas actuales, no podremos hacer tests masivos. Si quería más labs acreditados, debió invertir también en acondicionar los labs existentes y no sólo exigirles requisitos o construir nuevos labs desde cero. Había que usar TODO el arsenal.
[19] Cuarto mito: “hemos acreditado 10, 20, 30, 40, etc labs diagnósticos a nivel nacional”. Otra media verdad; basta con preguntar cuántos y cuáles de ellos han hecho efectivamente cuántos tests x día y a partir de cuándo. Son menos. Requerimos cientos, se pudo en países vecinos
[20] También desde la comisión de asesores recomendamos crear una red de laboratorios académicos liderados por científicos de reconocida trayectoria para asistir al INS con las acreditaciones, evaluación e implementación de nuevas tecnologías. Nunca ocurrió.
[21] En su defecto, se anunció una red de labs académicos para investigación genómica, “liderados” por el INS. Otra media verdad, no es igual ni es lo mismo. Es más un gesto que no recoge el enorme potencial de la comunidad científica para aportar a la lucha contra la pandemia.
[22] Cuarto mito: “podríamos hacer muchos tests moleculares pero hacemos muy pocos porque no hay demanda”. No necesito decir mucho al respecto, solo que el mundo entero nos da la contra y que resulta obvio que aquí el testeo molecular masivo NUNCA FUE ni es política d Estado
[23] Quinto mito: “las pruebas serológicas también tienen una función y son importantes para estudiar la pandemia”. Otra media verdad. Claro que sirven para estudiar la seroprevalencia, pero no para detectar y reducir los contagios, algo que era y sigue siendo prioridad absoluta
[24] Sexto mito: “no se necesita pruebas moleculares para diagnosticar enfermedad porque lo que manda es el diagnóstico clínico“. Otra media verdad. Claro que no necesitas una prueba molecular cuando tienes un paciente con neumonía atípica, baja oxigenación, tomografía +, etc
[25] El uso más importante de las pruebas moleculares no es diagnosticar enfermedad. Con la ventana presintomática y un porcentaje tan alto de asintomáticos, lo que se busca es detectar al VIRUS, con o sin síntomas, para cercarlo y reducir contagios

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17 Aug
Con gran satisfacción comparto el último avance de nuestro proyecto de pruebas moleculares rápidas UPCH/UPC. Luego de confirmar el funcionamiento exitoso del prototipo el 18.06 nos abocamos a:

-iniciar su validación analítica (fase 1)

-planificar la validación clínica (fase 2)
Estas fases se llevan a cabo usando muestras clínicas de pacientes, a fin de obtener cuantitativamente el límite de detección del método y con que eficiencia reconoce el material genético viral
La madrugada de ayer superamos con éxito la fase 1. La data completa y análisis se presentarán en breve al INS. Junto con la data de fase 2, se incluirán en un preprint que someteremos a revisión por pares en una revista internacional indexada. Mientras tanto un breve adelanto:
Read 22 tweets
19 Jun
[1] 18 de Junio: EUREKA! Comparto con gran satisfacción este video de nuestra prueba rápida MOLECULAR en acción, detectando la presencia del nuevo coronavirus en un paciente COVID-19 peruano. Dos líneas reactivas en una tira de papel, formato portátil y de bajo costo, made in 🇵🇪
[2] Luego de 2 interminables meses sorteando obstáculos de todo tipo, este es el fruto de 2 semanas de arduo trabajo de laboratorio con un talentoso equipo de jóvenes biólogos moleculares que dejaron sus hogares para dedicarse a esto. Ni la burocracia ni el virus lo impidieron!
[3] El proyecto, que combina mejoras en la obtención de muestras, con métodos de amplificación isotérmica y detección enzimática CRISPR-Cas, se tradujo diariamente en pizarras atiborradas de planes experimentales y discusiones técnicas, troubleshooting e interpretación de datos
Read 11 tweets
11 Jun
Siempre es fascinante copiar fragmentos d ADN en el lab y verlos con luz UV. Más aún si se trata de genes del nuevo 👑 🦠 detectados con alta precisión en un paciente COVID-19. Buen trabajo, @JoAbugattas @renzogutlol @Juanblat camino a nuevos tests d diagnóstico molecular, vamos!
Usualmente la detección del SARS-CoV-2 requiere personal altamente especializado, insumos de disponibilidad limitada y equipos costosos como este qPCR de más de 50 mil USD, que más parece un monolito salido de Odisea en el Espacio.
Sin embargo, en casos urgentes como la pandemia actual, se puede hacer el diagnóstico con equipos de PCR estándar de menos de 5 mil USD y algo más de trabajo manual. Esto sería factible en muchas universidades e institutos del país, si el INS y el MINSA lo permitieran
Read 4 tweets
2 May
Una vez más, muchas gracias a quienes siguen aportando valiosa información, comentarios y sugerencias al hashtag #COVIDtestsPERU. Aquí un resumen general de los avances del grupo asesor del MINSA en CTI para el manejo de la pandemia, 18 días después de su instalación (1)
Lo positivo: se identificó rápidamente los vacíos científico-tecnológicos en la estrategia del INS/MINSA contra COVID-19, se formuló recomendaciones concretas y con ayuda de CONCYTEC, se "mapeó" los cuellos de botella que bloquean su implementación, casi todos normativos 😩(2)
Lo menos alentador: cómo lograr que estas recomendaciones técnicas se hagan realidad. Varios pensamos que lo ideal sería presentarle el reporte detallado y sin anestesia al ministro, y que él disponga su ejecución ASAP. Sin embargo, como ya adelanté, no sesionamos con él... (3)
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