Thread by @obscovid19br

Um R para todos dominar (repostando....)

“O R caiu abaixo 1! O R subiu acima de 1!” Você já deve ter visto algumas lives, capas de jornais, threads, cards, capas de portais etc, com alguma fala nesse sentido, certo?
Bora entender!

Mas o que significa isso? E, mais importante, por que isso importa e por que não devemos nos fixar tanto em um número? Vem na thread do Observatório. 🧶😉👇

Um dos números básicos calculados numa epidemia é o R0, que informa o potencial da epidemia se espalhar em uma população que só tenha pessoas suscetíveis. O R0 expressa quantas novas infecções o primeiro caso da doença pode causar, em média.

Esse número é uma característica da doença em si, que depende do potencial infectante de um patógeno, da taxa de contatos na população e da duração da infecção, entre outras coisas.

Complicado né? Exato! Isso só é possível de ser calculado com maior precisão quando se tem todos os dados sobre a epidemia, isto é, quando os casos já cessaram.

Cada doença tem um R0 característico. Por exemplo, o sarampo tem um R0 entre 12 e 18, logo, esta é uma das doenças mais infectantes que se tem conhecimento.

Para se controlar o sarampo, é necessário que ~95% da população seja vacinada contra ele. Neste caso, a maioria dos contatos envolverá pelo menos uma pessoa vacinada portanto, não resultará em uma transmissão.

Com isso, a média de infecções secundárias por caso primário será menor que um. Ou seja, em média cada caso da doença vai gerar menos do que um novo caso e, com o tempo, o número de novos casos vai cair.

Chamamos de R efetivo (Reff) este novo valor da média de infecções secundárias por caso, quando a população não é mais formada só por pessoas suscetíveis.

A vacinação é uma das maneiras de diminuir o número de suscetíveis de uma população. Para cada valor de R0 há um proporção da população que deve ser vacinada para que o R efetivo fique abaixo de um e, assim, se evite que a doença espalhe.

Este valor é a imunidade coletiva (ou de rebanho). Este limiar de imunidade coletiva é igual a 1 – 1/R0. Faça a conta com o R0 do sarampo e verá que o seu limiar de imunidade coletiva é bem alto, da ordem de 99%, como indicamos.

Então uma pequena minoria que se recuse a tomar vacina pode causar um surto epidêmico. No ano passado houve queda na cobertura vacinal de sarampo no Brasil e tivemos surtos (bit.ly/sarampo_vac).

É por isso que vacinação não pode ser uma escolha individual, pois afeta a coletividade.

O R0 do Sars-Cov2, vírus que causa a Covid19, é, provavelmente, algo entre 2 e 6. Usando esses números, quando houver uma vacina, teremos que imunizar entre 50% e 74% da população.

Mas, como ainda não temos vacina contra ele, a contenção da epidemia depende unicamente de medidas não-farmacêuticas.

O Reff expressa a transmissão a cada momento da epidemia, e pode ser calculado à medida que se registram novos casos. Existe uma diversidade de métodos para calculá-lo, mas o Reff é sempre menor que o R0.

O R0 considera que toda a população está passível de ser infectada (chamamos de suscetíveis). No entanto, com o avanço de uma epidemia, alguns indivíduos que já foram infectados adquirem imunidade, diminuindo a fração da população que ainda pode ser infectada.

Portanto, em geral, dizemos que Reff é R0 multiplicado por x, onde x é a porcentagem de pessoas ainda suscetíveis à doença no momento.

Porém leva um tempo até que os casos de uma doença sejam detectados e notificados. Ou seja, há um atraso de notificação dos casos durante a pandemia.

Desta forma, para o cálculo do Reff na atualidade, é necessário fazer correções nas séries de casos para se estimar - por exemplo, quantos casos ainda não chegaram nas notificação, mas que já existem.

Uma das formas de se efetuar essa correção é um método chamado nowcasting (uma “previsão” da atualidade). Todos os Reff calculados em no nosso site já incluem no seu cálculo essa correção. covid19br.github.io

Tá, mas aí o valor do tal Reff do Brasil baixou de 1, o que isso significa? Bom, de modo claro, nada! O Brasil é um país muito grande e heterogêneo, com várias realidades regionais e locais.

Desta forma, o valor de Reff para um país inteiro do tamanho do Brasil não expressa bem como a epidemia está acontecendo em cada local do Brasil.

Sabemos que São Paulo e Rio Branco são cidades muito distantes e provavelmente não vivem exatamente as mesmas situações da pandemia a cada instante de tempo.

Tudo bem! se o Reff da minha cidade ficou abaixo de 1? É bom? Pode abrir tudo? Vamos com calma! É necessário ainda muito cuidado.

Para se ter o controle da epidemia e evitar novos aumentos do número de infectados (e mortos!), é necessário esperar que este valor de Reff permaneça abaixo de 1 por um período de duas semanas, de acordo com as recomendações da OMS.

Vale ressaltar que a OMS NÃO recomenda somente o acompanhamento do Reff para controlar a epidemia. Há recomendações também sobre estabelecimento de um política de rastreamento de contatos,...

... testagem ampla com o fim de se detectar casos pré e assintomáticos, adesão a medidas de distanciamento físico, entre outras, todas as medidas recomendadas podem ser acessadas aqui(paho.org/pt/covid19).

Após período prolongado de epidemia amenizada, as aberturas e relaxamentos devem ser feitos progressivamente, sempre de olho se o número de casos ainda é controlável (Reff < 1) para que se possa reagir a qualquer surgimento de um novo surto (geralmente indicado pelo Reff > 1).