BIOCOMSC Profile picture
11 Dec, 4 tweets, 3 min read
Group news: After half a year under revision, our article on the use of the Gompertz Function for short-time predictions of #COVID-19 spreading has just appeared in #PLOSCompBio: Empirical model for short-time prediction of COVID-19 spreading dx.plos.org/10.1371/journa… 1/
We are happy it sees the light. It was a huge effort to set up the method for all of us: @CatalaMarti @kilocurie @CodinaLopez @pjcardona14 @prats_clara with the impressive push of Sergio Alonso @SergioAlonsoMun at the beginning of the pandemia. 2/
We had calibrated the method with the available data form Chinese provinces and applied to a large set of countries around the world, where we have regularly added in our web page the predictions at different levels. 3/
And even more important, we conveniently calculated the confidence interval for all the short-time predictions. The data employed in the article is right now outdated, however, we still use the method in our daily studies given its large one-week accuracy. Happy it is out!! 4/

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with BIOCOMSC

BIOCOMSC Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @BIOCOMSC1

12 Dec
Importante actualización de situación Europea. Núcleo de países persisten con incidencias muy elevadas y la mejora se ralentiza en países clave. Especialmente dramática la situación de Eslovenia, Croacia y Lituania: incidencia muy elevada (>1%) y crecimiento persistente 1/
Aquí tabla completa de situación europea. Suiza también entre países con situación complicada y crecimiento persistente. Por suerte, Suecia y Hungría ya tienden a la baja (rho7 <1). Los países en situación epidemiológica razonable son apenas cuatro. 2/
Irlanda muestra que medidas sostenidas en tiempo, sin necesidad de ser un cierre completo, pueden llevar a incidencias muy bajas. Aquí imagen con la situación del crecimiento de la epidemia. El repunte de rho7 en Alemania y Francia tremendamente preocupantes. 3/
Read 4 tweets
10 Dec
Many EU+EFTA+UK countries are currently improving. Key table of how different countries have indeed reduced strongly its incidence. We can see that empiric reproductive numbers are around 0.75 and 0.85 even without total lockdowns. Control can be achieved clearly without it 1/
We note that an improvement process can be maintained for a long time. So far, Belgium has maintained a ρ below 1 for 36 consecutive days, Czech Republic for 35, Spain 34, Switzerland 26, France 24 and Poland 21 2/
When the incidences are very low it may seem more difficult to maintain a ρ <1. Ireland contradicts this hypothesis. The last Irish ρ we calculated is greater than 1, but since 10/19/2020 it has been less than 1 for a long time (37 days less than 1, 5 days greater than 1). 3/
Read 4 tweets
14 Oct
Aquests darrers deu dies hi ha hagut una pujada forta en els casos a Catalunya. Gràcies a col·laboració amb anonimització prèvia de dades amb @salutcat hem pogut realitzar anàlisi detallada del creixement. Fil demostrant homogeneïtat en creixement espacial però no per edats 1/
Mostrem IA7 d'una setmana respecte a l'anterior per les diferents AGAs (Àrees de Gestió de Salut). Es pot veure que el creixement és generalitzat i no hi ha un únic focus infecciós, sinó que totes les AGAs empitjoren de forma sistèmica. Pujada doncs, homogènia al territori 2/
A continuació investiguem si pujades s'estan produint de forma homogènia a totes les edats. Si fos homogeni indicaria que tant entorn escolar com universitari/cicles superiors com de feina o de gent retirada/jubilada es veu igualment afectat. Aquí taula mostrant que no és així 3/
Read 12 tweets
14 Aug
1/ Como hemos explicado esta tarde, con los últimos datos de @isciii España entra en la zona roja de riesgo de transmisión comunitaria. Aquí el detalle de algunas provincias y CCAA. Cada punto un día. Eje X, casos activos por 100000. Eje Y, num reproductivo empírico.
2/ Baleares lleva una semana en zona roja, con un número reproductivo empírico (promedio de nuevas infecciones por caso) bajando de 2.5 a 2, aún lejos del 1. Cantabria entra también en zona roja, con un número reproductivo empírico de 2.5. ImageImage
3/ Burgos entrando en zona roja con un gran crecimiento los últimos días y un número reproductivo en ascenso. Álava, en rojo también, con tendencia a una disminución del número reproductivo empírico. ImageImage
Read 10 tweets
18 Jul
1/ Amb @opendatacat, confirmem que Barcelona va entrar en zona vermella del diagrama de risc el 12 de juliol i s'ha consolidat els darrers dies, seguint els mateixos passos que l'Hospitalet i Lleida.
2/ En aquests moments, es necessita una reducció forta de contactes i mantenir estrictament distàncies i portar mascaretes. Si us plau, si ets de qualsevol zona afectada (Barcelona, l'Hospitalet,..) cal evitar trobades a bars, festes privades, familiars en interiors i exteriors.
3/ Es produeixen agrupacions de casos en exteriors. Una festa a la platja o terrassa també és de risc. Gràcies al fet que ara detectem molt abans, hi ha marge de temps entre pujada de casos i augment d'hospitalitzacions. No ho desaprofitem!
Read 4 tweets
12 Jul
1/ Diagrama de risc Regió Sanitària de #Lleida amb dades obertes @opendatacat. Fiable fins a 8 juliol. Recordem: hi ha retard 5-7 dies entre la presa de mesures i efectes. Es veu com, abans que les mesures del 4 de juliol tinguessin efecte, la situació va empitjorar molt.
2/ El DR de @BIOCOMSC1 té zones de color verd, groc i vermell, en funció de casos actius (eix X) que depenen dels casos diaris, i del creixement (eix Y). Quan entra en groc cal incrementar vigilància. Quan entra en vermell no és suficient vigilància epidemiològica. DR #elSegrià
3/ En vermell cal disminuir l'expansió de forma més important. No és gens senzill saber com s'ha d'actuar, però els retards entre presa de mesures i els seus efectes fa que quan els casos nous diaris creixen cal actuar per reduir el nombre de contactes.
Read 6 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!