Què haurien evitat les vacunes administrades fins ara, si haguéssim tingut la mateixa dinàmica epidemiològica? Fem una estimació del seu efecte directe sobre les persones vacunades, sense incloure els efectes de protecció col·lectiva. Gràfica clau: defuncions evitades. /1 Assumint dades mitjanes d’efectivitat de les vacunes publicades i un retard de 3 setmanes en l’efecte complet de la vacunació, amb la mateixa dinàmica epidemiològica s’haurien evitat més de 4500 morts. Corba negra: dades reals. Corba blava: estimació si no haguéssim vacunat. /2

Finalment, sembla que tots els indicadors importants han iniciat la baixada. El que s’ha fet esperar més, l’ocupació a les UCIs. Després de 10 dies fluctuant al voltant de 570-600 llits ocupats, el valor baixa a 559. Cal esperar consolidació de la baixada. Gràfica @AQuAScat /1 Les defuncions setmanals baixen gairebé un 20 %, de les 222 a les 180 (#dadescovid, @opendatacat). També sembla que el pic de mortalitat ha quedat enrere i s’inicia una baixada lenta però sostinguda. Gràfica @AQuAScat /2

Con comparativa internacional @ECDC_EU por fin podemos mostrar que España se encuentra en estancamiento. Han dejado de bajar los casos. En estos momentos casi todo el continente en amarillo (1-estancamiento) o creciendo (rho7>1). Imagen clave 1/ Polonia, Bulgaria y especialmente Francia en situación y crecimiento preocupante. Estonia, Chequia controladas, pero con incidencias elevadas (IA14 1.5% potencialmente contagioso) que llevan al sistema hospitalario cerca de la saturación en algunas zonas. Tabla clave 2/

Informe de mobilitat Catalunya gràcies a dades de mostreig a voluntaris anonimitzats de @Facebook Data For Good i @biocomsc1 per demarcacions. Mínims històrics en caps de setmana a partir de mesures de gener. Pujada forta aquest cap de setmana d'obertura. Primera figura clau 1/ Aquest índex s'elabora amb col·laboració amb Facebook però comprova variacions amb dades @mitmagob. Com es veu, els canvis es corresponen a mesures preses des de PROCICAT. El compliment en línies generals és molt bo. Especialment durant gener. 2/

La situación en España parece estancarse. Lamentablemente los datos aportados desde España a @ECDC_EU @WHO dejan de realizarse el fin de semana (puente largo en Madrid) y no se puede hacer comparativa. Situación más preocupante en Estonia, Francia y Polonia. Tabla 1/ En esta tabla vemos que la incidencia en España es comparativamente baja. No podemos evaluar crecimiento debido a los 0 casos incorrectamente comunicados. Grave crecimiento empírico observado en Polonia y Francia. Aquí evolución del crecimiento empírico de países clave 2/

Last friday we sent to @ECDC_EU and @EU_Commission our report on the subsitution process of B.1.1.7 in Catalonia. An increase in transmissibility of around 50% is not translated into an important increase in the effective reproductive number. Open thread with ideas of report. 1/ The previous graph shows how B.1.1.7 went from being a low fraction of the cases to reaching 80% of the cases. During January and February important restrictions were in place in Catalonia. Rt went from roughly 0.8 to 0.9 during most of the substitution process 2/

Informe clave ayer a la Comisión Europea. Analizamos efectos vacunación #covid19 por edades con perfil de hospitalizaciones y muertos de España. Mayores de 80 años representan 2/3 de defunciones. Esperable orden de magnitud de reducción de mortalidad en mayo del 60% Perfil: 1/ En este análisis no se tienen en cuenta los posibles efectos beneficiosos en transmisión, simplemente la protección individual que ofrece la vacuna. Suponiendo una eficiencia del 100% con un rechazo del 10% (o una eficiencia del 90% con nulo rechazo), gráfica clave por edades 2/

Avui Catalunya arriba al mig milió de primeres dosis! Gran dia. Inaugurem mapa @argenbi amb dades @opendatacat per tal que puguis saber la situació de la vacunació al teu CAP. Útil si tens familiars d'edat avançada. Mapa de vacunació per ABS: biocomsc.upc.edu/en/covid-19/va… 1/ Si feu clic al teu CAP, hi ha les pestanyes amb tota la informació. Una clau és Edat amb % sobre població. Si tens familiars de més de 75 anys, és especialment interessant saber quin percentatge de la població del teu CAP de +75 anys ja està vacunada. 2/

Preocupación por la evolución #covid19 en #Europa en las últimas semanas de febrero. Estancamiento generalizado con algunos países en subida. Del informe corto de ayer a la Comisión Europea destacamos imagen de crecimiento en el centro del continente (rho>1) En la tabla de países, la peor situación nominalmente es la de Chequia con incidencia a dos semanas cercanas al 1.5% y enorme mortalidad #covid19. Sigue creciendo, pero en proceso de control a partir de las medidas tomadas hace dos semanas. 2/

Los indicadores que llegan de Lisboa son devastadores. Lisboa se acerca al 3% de incidencia a 14 días, y creciendo (Rt 1.1-1.2). Estos valores indican completo colapso del sistema hospitalario con triaje de guerra en la capital. EPG apunta a posible colapso en algunas morgues 1/ El triaje puntual en la capital, tal como pasó en Londres, ya se puede ver en las colas de ambulancias vía @elconfidencial en entrada hospitales. Dicho triaje será generalizado en breve en la capital distribuyendo casos a todo el sistema elconfidencial.com/mundo/europa/2… 2/

La comarca en aquest moment amb incidència més elevada és l'Aran. Incidència a 14 dies del 2% de forma sostinguda. En aquests moments pràcticament tothom a l'Aran coneix a una persona contagiosa. Similar a Cerdanya fa un mes. Incidència setmanal via @AQuAScat. Obrim fil 1/ Comarques poc poblades poden tenir brots puntuals forts que fan pujar puntualment la incidència. Aquests brots, si es controlen, porten a baixada ràpida. No va ser el cas de Cerdanya ni ara Aran. Mapa biocomsc.upc.edu/en/covid-19/ca… @argenbi mostra persistència. 2/

Importante actualización de situación Europea. Núcleo de países persisten con incidencias muy elevadas y la mejora se ralentiza en países clave. Especialmente dramática la situación de Eslovenia, Croacia y Lituania: incidencia muy elevada (>1%) y crecimiento persistente 1/ Aquí tabla completa de situación europea. Suiza también entre países con situación complicada y crecimiento persistente. Por suerte, Suecia y Hungría ya tienden a la baja (rho7 <1). Los países en situación epidemiológica razonable son apenas cuatro. 2/

Group news: After half a year under revision, our article on the use of the Gompertz Function for short-time predictions of #COVID-19 spreading has just appeared in #PLOSCompBio: Empirical model for short-time prediction of COVID-19 spreading dx.plos.org/10.1371/journa… 1/ We are happy it sees the light. It was a huge effort to set up the method for all of us: @CatalaMarti @kilocurie @CodinaLopez @pjcardona14 @prats_clara with the impressive push of Sergio Alonso @SergioAlonsoMun at the beginning of the pandemia. 2/

Many EU+EFTA+UK countries are currently improving. Key table of how different countries have indeed reduced strongly its incidence. We can see that empiric reproductive numbers are around 0.75 and 0.85 even without total lockdowns. Control can be achieved clearly without it 1/ We note that an improvement process can be maintained for a long time. So far, Belgium has maintained a ρ below 1 for 36 consecutive days, Czech Republic for 35, Spain 34, Switzerland 26, France 24 and Poland 21 2/

Aquests darrers deu dies hi ha hagut una pujada forta en els casos a Catalunya. Gràcies a col·laboració amb anonimització prèvia de dades amb @salutcat hem pogut realitzar anàlisi detallada del creixement. Fil demostrant homogeneïtat en creixement espacial però no per edats 1/ Mostrem IA7 d'una setmana respecte a l'anterior per les diferents AGAs (Àrees de Gestió de Salut). Es pot veure que el creixement és generalitzat i no hi ha un únic focus infecciós, sinó que totes les AGAs empitjoren de forma sistèmica. Pujada doncs, homogènia al territori 2/

Per què tenim més casos que ningú si tothom porta mascareta? Hem intentat contestar a aquesta pregunta en el darrer informe a la CE amb estudi de camp sobre el comportament a Barcelona. Obrim fil amb gràfica clau i amb petició final a tots el que en seguiu #portembémascareta 1/ Hem classificat el comportament d'uns 3100 ciutadans de Barcelona en termes de si portaven la mascareta ben posada o no (sense cobrir nas i boca). Portar malament mascareta és com no portar-ne. Hem classificat comportament per entorns i districtes 2/

1/ Como hemos explicado esta tarde, con los últimos datos de @isciii España entra en la zona roja de riesgo de transmisión comunitaria. Aquí el detalle de algunas provincias y CCAA. Cada punto un día. Eje X, casos activos por 100000. Eje Y, num reproductivo empírico. 2/ Baleares lleva una semana en zona roja, con un número reproductivo empírico (promedio de nuevas infecciones por caso) bajando de 2.5 a 2, aún lejos del 1. Cantabria entra también en zona roja, con un número reproductivo empírico de 2.5.

1/ Amb @opendatacat, confirmem que Barcelona va entrar en zona vermella del diagrama de risc el 12 de juliol i s'ha consolidat els darrers dies, seguint els mateixos passos que l'Hospitalet i Lleida. 2/ En aquests moments, es necessita una reducció forta de contactes i mantenir estrictament distàncies i portar mascaretes. Si us plau, si ets de qualsevol zona afectada (Barcelona, l'Hospitalet,..) cal evitar trobades a bars, festes privades, familiars en interiors i exteriors.

1/ Diagrama de risc Regió Sanitària de #Lleida amb dades obertes @opendatacat. Fiable fins a 8 juliol. Recordem: hi ha retard 5-7 dies entre la presa de mesures i efectes. Es veu com, abans que les mesures del 4 de juliol tinguessin efecte, la situació va empitjorar molt. 2/ El DR de @BIOCOMSC1 té zones de color verd, groc i vermell, en funció de casos actius (eix X) que depenen dels casos diaris, i del creixement (eix Y). Quan entra en groc cal incrementar vigilància. Quan entra en vermell no és suficient vigilància epidemiològica. DR #elSegrià

1/ Utilització de mascaretes serà obligatòria. En els darrers mesos s'ha fet un esforç enorme per entendre com funciona la dinàmica de fluids de gotes que surten de boca i nas amb/sense mascaretes. Fil de @kilocurie: aip.scitation.org/doi/pdf/10.106… 2/ Aquest darrer article mostra clarament que mascaretes protegeixen però no del tot. Personal sanitari necessita més que mascaretes. I aquest segon sobre evaporació, disseminació i cristal·lització de gotes.. Una joia per la gent del camp @pino_in_bcn aip.scitation.org/doi/pdf/10.106…

1/La població d'Arizona és aproximadament la mateixa que la de Catalunya. Temperatures a Arizona arriben als 40 ºC. Tot i així creixement #covid19 molt fort. 400 casos actius per 100.000 habitants. Zona vermella del diagrama de risc. Fil @kilocurie @ConesaJR 2/ La situació és molt pitjor que la que va tenir mai Catalunya. Recordem diagrama de risc. Eix X: casos reportats darrers 14 dies (actius). Eix Y: Creixement empíric epidèmia. Vermell impossibilita fer control per contactes.