İngiltere'de saptanan ve temkinli olarak yaklaşılıp önlem alınan mutasyonlar için, daha önce de belirttiğim gibi net çıkarımlar yapılacak bir verimiz yok. Ancak bu mutasyonlarla ilgili olarak Eylül ayında yayınlanmış iki çalışmayı destekler nitelikte sonuçlar çıkarılabilir.
Bu çalışmalardan ilki, Eylül başında yapılan "deneysel" bir çalışmada, özellikle virüsün diken proteininin hücreye bağlanma bölgesine (RBD) dair mutasyonlarda dahil olacak bir çalışmada, RBD bölgesinde yer alan bir aminoasitin (arjinin)- aromatik halka sciencedirect.com/science/articl…
içeren bir aminoasidi dönüşme durumu inclendiğinde, bunun hücreye virüsün bağlanmasını artırdığı (hücre dışında bir deneyde) olasılığından bahsedilmiş. Ancak, şu anda varolan ve İngiltere'de saptanan N501Y mutasyonu insanda taranmamış ona çok benzer olan yukarıdakiler taranmış.
Ancak, İngiltere'deki bu mutasyonda virüsün hücreye bağlanma etkinliğinin artırması beklenebilir (verisi yok). Bu durumda dahi hastalığın daha kötü seyredeceğine, ölümcül olacağına ya da daha hızlı yayılacağına dair bir veri hala yok. Etrafta gördükleriniz hipotez.
İkinci çalışma aslında umut verici bir veriye işaret ediyor. Bu çalışmada, farelerde ardışık bulaşlar yapıldığında bugün insalardakine benzer şekilde RBD proteini üzerinde N501Y mutasyonu oluşmuş. İnsanlardaki gibi sürekli bulaş olduğunda, farede virüsler science.sciencemag.org/content/369/65…
İngiltere'de ortaya çıkana benzer bir mutasyon geliştirmişler. Yani aslında görüldüğü gibi "sürpriz" bir mutasyon durumu yok. Bu çalışma diyor ki, bugün İngiltere'de ortaya çıkan mutasyon; farelerde bulaş oluşturan virüslerde ortaya çıktığında, ve farelerde aşılama yapıldığında
-ki bu aşı virüs mutasyon geçirmeden önceki formuna yönelik hazırlanmış- farelerin dirençli oldukları gözlenmiş. Yani bu bahsedilen N501Y mutasyonunun aşı etkinliğini farelerde olumsuz etkilemediği saptanmış. Yani ortada paniğe kapılacak, öldük bittik bir durum yok
ancak tabi ki, her zaman temkinli olmakta fayda var. Yani virüsün sürekli birilerine bulaşmasını engellemek için ne gerekli ise o yapılmalı. Bu nedenle Ingiltere bu önlemleri alıyor. Bu sayede virüsün sürekli mutasyon geçirmesinin de önüne geçilebilir.
Bu arada tüm olan bitenler Sars-CoV-2'nin nasıl doğada gerekli mutasyonları geçirdiğini ve insana adapte aldığının göstermesi açısından muhteşeme bir kanıt. Ama insan akıllanmamakla lanetlidir. Zira bu veri yani Sars-CoV'un nasıl çok daha tehlikeli hale gelebileceği
gösterilmişti ama bundan ders almak yerin saçma sapan komplo teorilerinin peşinde koşanlar çok oldu,o çalışma da burada: nature.com/articles/nm.39…
• • •
Missing some Tweet in this thread? You can try to
force a refresh
Görüldüğü gibi Sinovac şirketinin aşısı 16 Eylül'de faz çalışmalarına Türkiye'de Hacettepe Üniversitesi'nde başladı, Faz çalışmalarına bir kural olarak sağlık çalışanlarından başlanıyor, etik kurul onayı ile. Bu sürecin nasıl işleyeceği, bbc.com/turkce/haberle…
aşılamada önce hangi testlerin yapılıp/yapılmayacağı gibi ayrıntıları etik kurul belirliyor, ve bir protokol oluşturuluyor. Yani, hadi bismillah deyip hastanede tuttuklarına aşı yapmıyorlar. Şimdi Sinovac protokolünde her gönüllüden PCR negatifliği, antikor negatifliği testleri
isteniyor. Ancak bu durum Pfizer'da nasıldı bilmiyorum. Erdal Hoca @qujunil gönüllü idi belki ekleme yapabilir. Pfizer da faz çalışmalarının bir kısmını Türkiye'de yaptı, ve yine sağlık çalışanlarında dw.com/tr/almanyanın-…
Sars-CoV-2 labda üretildi geyikleri yeniden başlamış, bu sefer virüs üretim şeması bile var. Bu komplo teoricileri neden böyle biraz şey oluyorlar. Bari bilen birine hazırlatsaydınız, "structure guided design" yapıp reseptöre bağlanacak süper bölge bulacak kadar zekiyiz+
ama klonlamayı antika kes/yapıştır ile yapıyoruz. Çifte kesim yapınca geni tek yönde sokarsınız diye okumuşlar wikipediadan, iki restriksyon enzimi koyalım o zaman. Bu arada araya Furin enzimi kesim alanı koymamız lazım, salak olduğumuz için onu Desgined RBM'e baştan koymuyoruz
sonra aklımıza geliyor koyuyoruz, hem bu sayede QuickChange PCR'ıda bir şenlik olsun diye ekliyoruz, bir nevi küsuratlı vereyimde salladığım anlaşılmasın. Sonra kocaman genom birleştireceğiz, nasıl yapsak, literatür search hooop Gibson Assembly (Golden Gate daha şık dururdu).