Quando juntam negacionismo e desapreço pela Ciência temos essa realidade: um laboratório natural de evolução viral.

Brasil tem mais de 10,5 milhões de casos, e só ~3500 genomas do vírus sequenciados. Mal sabemos que inimigos enfrentamos, nem onde estão.
nytimes.com/2021/03/03/wor…
É sempre importante lembrar:

1️⃣ Seja lá qual variante do coronavírus esteja circulando, a transmissão viral depende de contato próximo entre pessoas.

2️⃣ Usar variantes para justificar aumento de casos significa ignorar que no Brasil faltam políticas efetivas de combate à COVID.
Diante de variantes mais transmissíveis (seja por maior carga viral, por terem período infeccioso mais longo, etc), medidas de prevenção precisam ser ainda mais duras

Mas não é o que vemos no Brasil, com estabelecimentos e ônibus lotados, festas clandestinas, fiscalização frouxa
Bater o chicote no chão e dizer "vamos fechar tudo" não faz mágica. É preciso dar condições para as pessoas evitarem ter que se expor.

A atual ajuda financeira é insuficiente: auxílio emergencial de R$ 250 é uma piada, e pequenos negócios precisam de crédito para manter empregos
Quando são implementados de fato, os lockdowns têm por objetivo primário reduzir o número de casos e a demanda por leitos, de forma a preservar um sistema de saúde a beira de um colapso.

É uma medida emergencial, e extrema, porém necessária.
A solução virá com a vacinação. Vacinas nos protegem de formas graves da doença, e ajudam a evitar hospitais cheios de pacientes necessitando UTI.

Deveríamos vacinar ~1 milhão de pessoas ao dia.
A realidade é: até hoje menos 9 milhões foram vacinadas.

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12 Jan
The amino acid deletion ∆69/70 has been used as a proxy for detecting viruses from B.1.1.7 ('UK variant'). The same marker has been used in the US, but we caution against its use. We identified a new SARS-CoV-2 lineage (B.1.375) with that same feature.

virological.org/t/detection-of…
A new lineage circulating in the US (B.1.375, arrow) shows the same deletion ∆69/70 in the spike protein, and a set of unique amino acid substitutions were found in this lineage: ORF1a T1828A, ORF1b E1264D, ORF3a T151I, and M I48V. Image
Viruses in the lineage B.1.375 have been identified in all regions of the US, specially in states where genomic surveillance of SARS-CoV-2 has been done frequently, such as: Connecticut, Florida, California and Wisconsin. Image
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23 Dec 20
A evolução, seja de vírus ou de qualquer organismo, não segue uma caminho linear, mas sim caminhos que se dividem, onde diferentes linhagens seguem rotas evolutivas independentes. Ao longo dessas rotas, cada (população de) coronavírus acumula cerca ~2 mutações por mês

Explico 🧶
Estas são árvores filogenéticas do SARS-CoV-2, do @nextstrain
1️⃣ com escala de tempo
2️⃣ com escala de mutações

Na árvore 2: cada círculo nas pontas representa um vírus, e se partirmos da raiz da árvore (no zero), várias rotas nos levam até 3.000+ vírus: nextstrain.org/ncov/global
As rotas evolutivas que cada (população de) vírus segue é praticamente única. Assim, ao longo de cada rota, cerca de 22 mutações ocorrem por ano, mas se somarmos as mutações acumuladas por CADA rota, chegamos a centenas de milhares de mutações.⚡️🧬
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19 Dec 20
Sobre novos variantes virais, 3 pontos:

1️⃣ Mutações virais ocorrem com frequência (para SARS-CoV-2, vemos ~2 mutações por mês)
2️⃣ A grande maioria das mutações NÃO são vantajosas ao vírus.
3️⃣ Esqueçam a ideia de "mutantes superpoderosos". Não é assim. Não são X-Men 🚫

Explico👇🏽
Vírus com genoma de RNA utilizam uma enzima chamada RNA polimerase dependente de RNA: é uma pequena 'máquina' de copiar RNA com base em outras moléculas de RNA.

Essa 'máquina', no entanto, é falha, e durante o processo de cópia, geram erros (etapa 5 acima): estas são as mutações
Mutações em genomas virais acontecem o tempo todo. Porém, grande parte delas não chegamos nem a ver: são danosas ao vírus, e os mutantes não prosperam.

As poucas mutações que vemos são mantidas por mera chance (pois são neutras), e uma rara minoria oferece alguma vantagem.
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18 Dec 20
Vacina obrigatória NÃO significa imunizar pessoas a força. Estamos no século 21.

Existem meios de estimular a vacinação num cenário de obrigatoriedade, onde a vacinação passa a ser condicionante.

Abaixo, alguns exemplos. ⬇️ #EuVouTomarVacina
Antes da pandemia já se discutia a obrigatoriedade de outras vacinas. A da COVID deve ser mais uma na lista.

www12.senado.leg.br/noticias/mater…
A cobertura vacinal no Brasil vem caindo desde 2015, e em 2019 a queda foi ainda mais brusca. Isso é lamentável, pois surtos de Sarampo têm voltado com força. Já fomos melhores no quesito imunização.

Para não cairmos em crises de saúde pública maiores, vacinação é essencial.
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11 Oct 20
Medidas como os lockdowns têm por objetivo primário reduzir o número de casos a níveis baixos o suficiente para tornar possível o *rastreamento de contatos*, baseado num sistema eficaz de *testagem por RT-PCR*

Lockdowns, sozinhos, não resolvem o problema.
ft.com/content/0143a8…
É essencial que se aumente a capacidade de testagem por RT-PCR, com acesso gratuito a quem precisa de teste. Resultados devem ser liberados em até 48h, para que o infectado seja notificado sobre como se isolar e evitar novas transmissões, e p/ permitir o rastreamento de contatos
Sem saber quantos casos ativos tinham, por falta de testes RT-PCR, muitos municípios se fecharam sem olhar para os dados da epidemia.

Fechamentos prolongados são impraticáveis. Logo, identificar o melhor momento de iniciá-los é ponto chave.
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12 Aug 20
Every year Brazil faces a constant threat: dengue virus

After #Zika virus caused major outbreaks in 2016, cases of #dengue declined in 2017-2018, but then resurged in 2019. In this study we investigated the reasons for such fluctuations 📉📈

Thread👇

🔗 medrxiv.org/content/10.110… Dengue virus (DENV) is the most important and widespread mos
Something 'flattened' the dengue curve in 2017-2018. Every year in Brazil, cases of #dengue rise around March, when conditions are favourable (mosquitoes, rain, temperature). But, for some reason, in those two years, dengue cases were low in all regions of the country. 📉🦠
Infectious diseases are transmitted in a population of susceptible hosts following a rate called Force of Infection (FOI).

@RJOidtman, @guido_camargo and @TAlexPerkins estimated dengue FOI for each region in Brazil, and found viral transmission was indeed quite low in 2017-2018.
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