Share this page!

Dvir Aran Profile picture
Twitter logo
21 Mar, 7 tweets, 3 min read
האם חיסוניות-עדר אפשרית? לפני כחודש רואינתי לכתבה הזו ב-@Nature. מסקנת הכתבת היא שחיסויות-עדר אינה סבירה. לדעתי, העדויות המצטברות דווקא מעידות שאנחנו כבר חצינו את החסם של חסינות עדר. (פוסט בעברית לבקשת @Meir_Rubin) --> nature.com/articles/d4158…
הכתבת מזכירה 5 סיבות: 1. לא ברור עם החיסון מונע העברה. אני חושב שיש כבר מספיק עדויות לכך שהחיסון כן מונע העברה, וברמה גבוה מאוד, כנראה באיזור ה-90%. 2. יש מדינות מחוסנות יותר ויש פחות ולכן לא ניתן להשיג שליטה גלובלית. תודה לאל, אנחנו ביותר.
3. הוריאנטים החדשים - בישראל כבר השתלט לחלוטין הוריאנט הבריטי, כך שמה שאנחנו רואים כבר כולל את השינויים שהוא מביא איתו (והוריאנטים האחרים כנראה לא מדבקים יותר, אפשר לדון בכך בנפרד).
4. ההגנה היא זמנית. סביר, אבל בניהול נכון נגיע למצב שרמת הוירוס באוכלוסיה כ״כ נמוכה (או אפסית) שזה יאפשר לנו להגיב לפני שתהיה התפרצות. 5. החיסונים משנים את ההתנהגות. בודאי, אבל בישראל פתחנו לגמרי וה-R מתרסק. ה-R בלי חיסונים סביר שבאיזור ה-4, אבל אנחנו רואים 0.66.
לפני קצת יותר מחודש פרסמתי יחד עם @geller_mic מודל שמציג כמה מחוסנים צריך בשביל חסינות עדר בישראל. הטעות שלנו במודל היתה בפרמטר של מניעת ההעברה. אם הערך הזה הוא 90%, אז מספיקים 55% מחוסנים + מבריאים, ואת זה כבר עברנו.
אז המסקנה שלי היא שכן - חסינות עדר אפשרית. צריך לשמור על הגבולות ולמנוע כניסה בלתי מבוקרת של חולים, וחוץ מזה, זה אמור להספיק. הלוואי.
@BejaLab נייצ׳ר שני שלי תוך חודש. אני מקבל קביעות?

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
　

Keep Current with Dvir Aran

Dvir Aran Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @dvir_a

Dvir Aran Profile picture
21 Mar
Is herd-immunity probable? I was interviewed a month ago for this piece in @Nature. The conclusion of the reporter is that the answer is no. IMHO, with the emerging evidence coming from Israel the answer is YES!
nature.com/articles/d4158…
Why? First, empirically, Israel opened almost everything and R is at ~0.66. Second, more evidence suggests that transmission-blocking is high (~90%). Third, immunization in Israel is already after the B.1.1.7 variant is dominating (>90%).
About a month ago @geller_mic posted this model on what vaccination rate required for herd-immunity. With no restrictions and R~4, we estimated it at 90%. Our mistake was that vaccines are probably highly protective against transmission.
Read 4 tweets
Dvir Aran Profile picture
22 Feb
My thoughts on the @Pfizer+@Israel_MoH vaccine effectiveness study (you can call it open peer-review if you like). In the study, they show vaccine effectiveness (VE) of >90% for infection, symptomatic, hospitalization and severe disease by comparing to non-vaccinated. =>
1. Control – we know very well that those vaccinated (especially early) are from different socioeconomic groups. @MDCaspi showed it nicely. Those same groups also have higher infection rates. So, naively comparing to non-vaccinated is highly biased.
medrxiv.org/content/10.110…
In my analyses, I estimate this bias at 20-30%. Correcting for this is possible and will reduce a VE of 90% to ~87%. Not such a big deal. However, I really don’t understand why in the study they chose not to control for it.
medrxiv.org/content/10.110…
Read 12 tweets
Dvir Aran Profile picture
18 Feb
Estimating the vaccine effectiveness. Take 4.
A bit late to the party, after Clalit, Maccabi, and the MoH+Pfizer all show cased their results of the vaccine effectiveness. Yet, I am happy to present an updated version of my aggregate-level analysis.
1st draft preprint available on #medRxiv and hope to replace it with a new version soon.
medrxiv.org/content/10.110…
The main difference is an improved formula to calculate expected daily incidence of cases. The problem is that cases are “eliminated” because of the vaccine, causing underestimation of expected daily cases. After hard work, with help from @geller_mic we can now correct for it.
Read 11 tweets
Dvir Aran Profile picture
11 Feb
איך יוצאים מהבלאגן? כולנו כבר מכירים את ה-R החמקמק ויודעים שהמטרה היא להוריד אותו מתחת ל-1. בעקבות המחקרים של @erlichya ו-@RoyKishony שמספקים עדות שהחיסון מקטין את ההעברה של הנגיף רצינו לבדוק בתרחישים שונים כמה אחוז צריכים להיות מחוסנים כדי שR ירד מ1. פוסט משותף עם @geller_mic
בנינו מודל פשוט שמחשב את ה-R האפקטיבי כפונקציה של מספר המחוסנים. בהינתן R התחלתי של 1.86 (לפני הסגר היינו על 1.24 ועם הוריאנט הבריטי שמדבר ב-50% יותר מגיעים לערך הזה) וערכים שונים לסיכויי ההעברה של הנגיף (t) אפשר לראות מה יהיה ה-R החדש באחוזים שונים של מחוסנים.
לפני המודל הזה אנחנו כבר היום מתקרבים מאוד ל-R=1 במצב של משק חצי פתוח כמו שהיה לפני הסגר האחרון. נראה שמספיקים 40-60% מהאוכלוסיה מחוסנים בשביל זה. זה מעודד.
Read 5 tweets
Dvir Aran Profile picture
10 Feb
עדכון שלישי שלי של הערכת יעילות החיסון. לא אופטימי כמו הפוסטים הקודמים. הנתונים מבוססים על מידע עד ה-9 לפברואר. ממצאים:
1.אין הגנה עד יום 21. רואים הגנה רק מהיום ה-21 (או המנה השניה).
==>
2.הגנה מפני אימות אחרי המנה השניה (לא להתבלבל עם הדבקה או עברה): 60-74% לבני 60+, 75-78% לבני 60-.
3.הגנה מפני אשפוז אחרי המנה השניה: 71-82%. הגנה מפני מחלה קשה: 69-77%.
להסבר על המתודולוגיה - github.com/dviraran/covid…
(מעודכן בנתונים עד ה-5 בפברואר)
Read 7 tweets
Dvir Aran Profile picture
10 Feb
Third update of my estimations of vaccination effectiveness. Not as optimistic as my previous posts. Data is based on cases of vaccinated individuals up to February 9th. Findings:
1. No protection up to day 21. We only see protection from day 0 of the 2nd dose. ==>
2. Protection after 2nd dose from being positive (not to be confused by transmission): 60-74% for ages 60+, 75-78% for ages 60-.
3. Protection after 2nd dose from hospitalization: 71-82%. From severe case 69-77%.
For an explanation of the methodology please take a look at github.com/dviraran/covid…
(updated with data up to Feb 5th)
Read 7 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!

This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!

Like this author's thread?

Get emails when @dvir_a has new unrolls!

Check out other threads from @dvir_a!

Read all threads by @dvir_a