Thread by @MartinaSisters

Estoy estudiando y contrastando los genomas de 2 virus. Son virus de la Pif. Y luego los he contrastado con un documento de estudios de virus de la Pif en China, en Harbin, desde 2017 a 2019. Existe unos detalles en ellos que me ha llamado la atención, incluido un autor.

Una de las tremendas dificultades de este virus es que si observáis los autores de los papers científicos de nacionalidad china aparecen muchas veces solo iniciales, de tal forma que es imposible saber qué corresponde al nombre o al apellido. Por tanto la vinculación es difícil.

¿Os acordáis de M. Rajoy y lo difícil que era saber quién era? Pues parecido.
Y al final... por sentido común, serían el mismo 😉 Aquí sucede igual. Hay un Xuwen Gao como X. Gao o Gao X., en otras publicaciones o citaciones y con labor detectivesca se ve que son la misma persona

Hay un documento publicado en febrero de 2020 que trata de un estudio de gatos con un kit de reactivos EVAGreen (verde fluorescente) para uso in vitro. Se usa como agente intercalante de ácidos nucleicos y sirvió para ensayos de química basados en RT- PCRs pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31846702/

utilizando una muestra de gato (FIPV HRB-17) con una infección de Pif húmeda. Con este estudio se determinó que el método EvaGreen basado en RT-PCR puede ser utilizado para detectar el coronavirus FCoV en gato, PERO no puede distinguir si será un FCeV o el FCoV mortal (la Pif)

Esto es importante porque viene a decir que en China ya sabían el alcance (y límite) de estas pruebas RT-PCR desde 2019.
Los aislamientos estudiados son:

FIPV isolate HRB/XF17 S gene, complete cds
GenBank: MK987175.1

FIPV isolate A N gene, complete cds
GenBank: MK840958.1

Uno de los estudios es sobre la proteína de núcleo N y el otro sobre la proteína de pico (Spike), lo que viene a confirmar que sabían bien que estas dos partes de genoma son cruciales para estudiar la respuesta viral del genoma del FCoV.

¿Y si comparamos la proteína S del MK987175.1 con uno de esos virus de la Pif tan estudiados como es el FIP14 - KJ665876?

Pues que ¡nos llevamos la sorpresa del siglo! Adivináis en qué parte grande EXACTAMENTE, ambos virus no coinciden en sus AA??

Exacto, la secuencia PRRAR 😉

Con tal “coincidencia”, lo siguiente que quise averiguar era, obviamente el grado de similitud entre la proteína Spike del genoma “consenso” del SARs- CoV-2 y la proteína Spike de la muestra del FCoV de Harbin y de nuevo la secuencia YQTQTNSPRRARSV como inserción “natural” 🤔

A modo de comentario: si tratáis de comparar ambos genomas en Blast, como al programa no le resulta interesante destacar esa inserción rara en el Spike, con solo identidad del 30% y positivos al 46% te saca mensaje de “no similitudes” y se queda tan ancho. Precisión lo llaman 🤦‍♀️

Si seguimos mirando más y vemos que en los 2 genomas aparece como autor Gao, X. ¿podría ser el Xuwen Gao del documento? He realizado una búsqueda por este nombre. Los resultados, como todo lo que viene acompañando a este maldito virus, son sorprendentes. Tiene documentos sobre👇

1) Isquemia focal en ratas.
2) Lactobacillus Casei, bacteria Gram Positiva “resistente” en intestino, boca y genitales.
3) Endocarditis por bacterias u hongos.
4) Linfopenia y alta movilidad de la proteína B1, es decir, ¡¡deficiencias de tiamina!! (HMGB1) researchgate.net/publication/23…

1) La isquemia focal en ratas estudia un modelo de infarto cerebral focalizado en la arteria cerebral media mediante embolia por coágulo de sangre.
¿Os suena relacionarlo con algún tipo de “trombo” que se esté dando con alguna de estas vacunas? 😔

Os dejo un estudio interesante sobre este tipo de isquemia focal cerebral por la introducción de agentes trombolíticos y neuroprotectores. Son modelos experimentales que quizá aporten datos.
Lo dejo por en el estudio de los microtrombos de Covid-19.
joseroda.com/documentos/Mod…

2) Lactobacillus Casei, es tipo de bacteria resistente que se encuentra en mayor proporción en boca, intestino y genitales. Escuchando un video del @DrVeller sobre las autopsias de países me llamó la atención hallazgos del virus en genitales. (Minuto10:20)

Existe un hongo dimórfico que durante la fase de levadura también se localiza en la mucosa del tracto intestinal, respiratorio de vías superiores y genital. Esto viene a plantear que ¿diferentes patógenos podrían preferir estos lugares y estos organismos ser diana del SARs-CoV-2?

Los microtrombos que ocluyen las pequeñas arterias (no pueden ser vistos a simple vista) también se hallaron en el plexo venoso prostático. En felinos existen casos documentados que asocian la orquitis a la infección/inflamación vascular que produce el coronavirus de la Pif.

Se plantea la posibilidad de una orquitis autoinmune asociada a la infección por Sars- CoV-2. Dejo documento para que pueda estudiarse si existe alguna relación entre anomalías vasculares e infección de la sangre. ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P…

En este sentido, también estoy elaborando un hilo sobre bacterias gram negativas resistentes en el que planteo la posibilidad de que estos organismos sean objetivo de infección del bacteriófago SARs-CoV-2. En cuanto esté lo enlazo a este hilo para una visión más completa.

3)La Endocarditis producida por bacterias, menos comunmente por hongos, es inflamación producida por organismos gram positivos como streptococcus y también por bacterias gram negativas como Escherichia coli/Klebsiella Pneumoniae (hospitales?) que se adhieren a válvulas cardíacas

Con todo ello lo que expongo es que desde 2017 a 2019 se realizaron estudios con gatos en el NE de China que probaron la fiabilidad de las RT- PCRs. Se extrajeron secuencias RT-PCRs para detectar FCoV pero sin poder distinguir si era FCeV (benigno) o FCoV (como sucede con Covid).

Las secuencias concretas estudiadas fueron la proteína Spike y la nucleocapside. (He dejado accessiones para poder hacer más pruebas, a mí no me ha dado tiempo a comparar más, porque quería exponerlo cuanto antes para que sea estudiado por los expertos en ello).

Y esa persona presente en los tres documentos, Xuwen Gao, (X. Gao) viene a enlazar estos ensayos con estudios de bacterias resistentes. Aún hay que estudiarlo mejor pero con este virus cualquier idea a cribar es válida por eso lo expongo en cuanto lo he relacionado. Por si ayuda.

4) La linfopenia también es un dato curioso ya que puede ser provocada por la deficiencia de Tiamina.
Sobre deficiencia de Tiamina os dejo un hilo de hace unos días que explica por qué quizá carecemos de ella y las consecuencias de tener déficit en relación al virus SARs-CoV-2.

https://twitter.com/MartinaSisters/status/1363113785708470277

Está claro, que en China conocían bien el inicio, desarrollo y resultados de la Pif. Hacían ensayos para futuras terapias, ponían a prueba alcance de RT-PCRs, sabían “cortar zonas concretas” y estudiaban bacterias resistentes que provocan cuadros de linfopenia (como en la Covid).

Añado este hilo de @masanpra que me parece muy útil para estudiar más a fondo estos microtrombos. Gracias Masanpra 🙏

https://twitter.com/masanpra/status/1379616423849394176

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