Nová zpráva o sekvenacích do konce minulého týdne 18.6. z COG CZ je zde:
virus.img.cas.cz/f/report-cogcz… Takže na co jsme tentokrát přišli?
takže i nadále převažuje alfa #B117, ale taky tady máme začínající se šířící deltu #B16172 (sekvenace dobíhají postupně cca 14 dní nazad, takže poslední dva sloupečky nejsou úplné a postupně se budou doplňovat data i za dřívější odběry)
bohužel významně pokleslo množství sekvenací - a to ze dvou důvodů - jeden je dobrý - je méně pozitivních vzorků, ale druhý už tak dobrý není - nadále nejsou vysokým školám sekvenace propláceny což se odrazilo na poklesu sekvenací na BIOCEVu (fialová)
bohužel zatím nadále nemáme přístup do ISINu, abychom doplnili data ze sekvenací i genotypizačními PCR.
Další novinkou zprávy jsou interaktivní 3D vizualizace spike proteinu pomocí @molstar0
alfa #B117 - molstar.org/viewer/?snapsh…
beta #B1351 - molstar.org/viewer/?snapsh…
delta #B16172 - molstar.org/viewer/?snapsh…
thajská ex Egypt #C363 - molstar.org/viewer/?snapsh…
Na obrázku jsou mimochodem ukázky prvních ryze českých mutací S:T208M a S:D215H - obě jsou na povrchu Spike proteinu v oblasti možné interakce s některými protilátkami. Ale abych zchladil nadšení - zatím jsou to 4 vzorky.

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with Karel Berka

Karel Berka Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!

:(