טוב, פורסמו כמה עבודות על וריאנט האומיקרון. ברשותכם אצטרף לד"ר @LiorHecht ולפרופ' @erlichya בניתוח הפרסומים השונים.

אמל"ק - עדיין רב הנסתר.
חשוב לומר גם שהמאמרים עוסקים *רק* בנוגדנים, ולא בכל מע' החיסון.

אבל ראשית, בואו נדבר על מה שמשותף לנגיף ולחיסוני הקורונה: חלבון ה-SPIKE.
אנחנו כל הזמן מדברים על 'הדבקה' של נגיפים, למרות שאנחנו לא כל כך מגדירים את התהליך הזה ביום-יום. הכוונה בהדבקה היא (1) חדירת הנגיף לתוך תא, ו-(2) התחלת שכפולו.

אגב, אצל נגיף הקורונה השכפול מתחיל מיד עם החדירה לתא, ולכן viral entry = infection.
ה-Viral Entry של קורונה זה תהליך שמצריך (בגדול) 2 חלבונים:
1. חלבון ויראלי שנקרא Spike
2. חלבון אנושי שנקרא ACE2 Receptor

אפשר לחשוב על כך כאילו ה-Spike הוא מעין מפתח, שמזהה במפורש את המנעול האנושי ACE2. כאשר הם פוגשים זה את זה, 'הדלת נפתחת', ומתרחשת הדבקה.
מיד עם ההדבקה, הנגיף מתחיל להשתכפל ולהתרבות, ומנגד - מערכת החיסון מתחילה לתקוף אותו. תהליך מאוד דומה קורה כשמתחסנים בחיסוני ה-mRNA (פייזר / מודרנה) או הוקטור הויראלי (אסטרה-זניקה / ג'ונסון אנד ג'ונסון / ספוטניק): החיסון חודר לתאים בנקודת ההזרקה, מתחיל להיווצר חלבון הSpike >>>
ומערכת החיסון מתחילה לתקוף את החלבון הנ"ל. התאים ש'נדבקו' בחיסון מסולקים ומוחלפים בתאים חדשים, אך מכיוון שהחיסון לא מתרבה (בניגוד לנגיף), תוך שעות-ימים כל מה שנותר מאחור זו רק תגובה חיסונית

בשני המקרים מע' החיסון תוקפת את כלל אתרי חלבון ה-Spike: הן בבסיס והן בקודקוד, ללא אפלייה.
בתמונה הקודמת אמנם ציירתי רק נוגדנים, אבל ישנם מרכיבים נוספים של מערכת החיסון שמזהים את חלבון הספייק ותוקפים אותו (למשל, חלבוני מערכת המשלים, תאי T, ועוד).

בכל אופן, הדבקה תלויה באינטרקציה בין קצה חלבון הSPIKE לבין החלבון האנושי ACE2. במידה ונוגדן יתמקם בדיוק בנקודת המפגש הזו, >
אותו נוגדן ימנע את חדירת הנגיף לתא, ולמעשה ימנע הדבקה. נוגדנים כאלה נקראים 'נוגדנים מנטרלים'. נוגדנים אלו מופיעים כאן בירוק.

וריאנט האומיקרון מכיל יחסית הרבה שינויים (מוטציות) בקצה חלבון הספייק, ולכן עלה החשש שהחיסונים והטיפולים שיש לנו ינטרלו פחות את הנגיף.
במילים אחרות, החשש הוא שיעילות החיסון במניעת הדבקה תפחת, ואם אנשים נדבקים יותר, גם בלית ברירה תהיה עלייה בהשלכות ההידבקות (תחלואה, תחלואה קשה, ותמותה).

יחד עם זאת, עדיין יש לנו את כל הנוגדנים האחרים, תאי ה-T, ושאר מרכיבי מע' החיסון שנותרים פעילים ומגנים עלינו.
למערכת החיסון החיה יש פעילות מאוד ורסטילית, והיא מסוגלת להתאים את עצמה לשינויים. כך החיסון החזיק בעוז כנגד כל הוריאנטים הקודמים (ידועים 'רק' 1.7 מיליון וריאנטים, אבל היו הרבה יותר).

לכן בשביל לדעת עד כמה החיסון מגן עלינו מפני הוריאנט, אנחנו צריכים למדוד את התחלואה האמיתית בשטח
של מחוסנים ושל לא-מחוסנים. הבעיה היא שזה לוקח הרבה מאוד זמן, ואנחנו רוצים להקדים תרופה למכה.

לכן התחילו לחקור את ההשפעות השונות של החיסונים על וריאנט האומיקרון, כך שנדע מול מה אנחנו מתמודדים. אמל"ק - עדיין רב הנסתר.

בכל אופן, פורסמו בטוויטר 3 עבודות שניסו לבדוק את רמת הירידה >>
בנוגדנים המנטרלים כנגד הוריאנט. מבדקים כאלה (שאנחנו קוראים להם Neutralization Assays) עקרונית לוקחים וירוס (לא בהכרח קורונה, אבל חייב להיות כזה שמכיל את חלבון הספייק), ולוקחים תאים (לא בהכרח תאי ריאה, אבל כאלה שמכילים את חלבון ה-ACE2), ובודקים כמה מהנגיף מצליח להדביק תאים כאשר
מדגירים את הוירוס עם נוגדנים כנגדו. ככל שיש פחות הדבקה, ככה הנוגדנים מנטרלים טוב יותר את הנגיף.

עכשיו צריך לקחת בחשבון שהקישור בין הנוגדנים לבין חלבון ה-spike תלוי ב-2 גורמים משמעותיים:
1. אבידיות (avidity), שזו תכונה שלוקחת בחשבון את עוצמת ומספר הקשרים בין נוגדנים לבין הספייק.
2. מספר הנוגדנים הזמינים. ככל שיש יותר נוגדנים, גם אם הקישור פחות יעיל - בכל זאת יהיו יותר נוגדנים שיקשרו את חלבון הספייק. בגוף שלנו כמות הנוגדנים משתנה בהתאם לכמות ותזמון החיסונים, אבל גם כמותם עולה מאוד לאחר חשיפה לנגיף.
מחקר ראשון מדרום אפריקה מדגים ירידה פי 40 בנטרול לעומת וריאנט מאוד ישן של הקורונה (כלומר, דרוש ריכוז גבוה פי 40 של נוגדנים בשביל להגיע לאותו נטרול).

זה *לא* אומר בשום צורה שהיא שיש ירידה פי 40 ביעילות החיסון!!!!

documentcloud.org/documents/2115…
העבודה מאוד מהירה ויפה של צוות החוקרים, אבל הנה הבעיות:

1. מדובר בסך הכל ב-12 נבדקים (6 מחוסנים, ו6 מחלימים-מחוסנים). ממש לא מספיק בשביל לומר שזה מאפיין את כל האוכלוסייה.
2. מחוסנים = 2 מנות.
3. דגימות דם הגיעו גם מהאוכלוסייה הכללית, אבל גם ממטופלים שאושפזו עקב קורונה. >>
מאוד יכול להיות שאותן דגימות דם הגיעו מנבדקים שמלכתחילה יצרו תגובה חיסונית לא-אופטימלית, ולכן ייתכן שאנחנו רואים פה רגישות מוגברת לאומיקרון. אני מזכיר, בסך הכל 12 נבדקים. סטטיסטית סביר ש*אין* פה התפלגות נורמלית של תגובה חיסונית.

החדשות הטובות: עדיין נראה שיש נטרול כנגד אומיקרון.
עבודה נוספת מסטוקהולם עם 34 נבדקים (17 עובדי מע' הבריאות, 17 תורמים רנדומליים) מראה ירידה הרבה יותר צנועה בנטרול, וגם הרבה יותר מגוונת (בין 1 ל-23).

הבעיות:
1. עדיין מדגמים מאוד קטנים.
2. לא ידוע מה הרקע החיסוני של הנבדקים

החדשות הטובות: עדיין יש נטרול.

drive.google.com/file/d/1CuxmNY…
עבודה שלישית, מגרמניה, לא פורסמה במלואה אלא הסברים ותמונות בטוויטר של החוקרת. העבודה מציגה ירידה בערך פי 30 בנטרול.

הבעיות:
1. העבודה לא פורסמה, ככה שקשה להתייחס בפירוט
2. כמות הנבדקים לא ידועה, כנראה שגם כאן מעט

החדשות הטובות: עדיין יש נטרול במבוסטרים.

עבודה רביעית, הפעם בגישה של מודל חישובי, חוזה שאמנם ישנם שינויים במבנה הספייק האומיקרונלי, אבל השינויים אינם קיצוניים כך שעדיין תהיה הגנה צולבת כנגדם (בכחול וירוק - חלבון הספייק; בצבע ורוד - נוגדן).

biorxiv.org/content/10.110…
עבודה חמישית על נוגדן מונוקלונלי כנגד קורונה (למעשה חיסון פאסיבי המשמש כתרופה). הפעם מדובר על תכשיר שנקרא Sotrovimab (מיוצר על ידי GlaxoSmithKline and Vir Biotechnology).

biorxiv.org/content/10.110…
נראה שהנוגדן הנ"ל עודנו מנטרל את וריאנט האומיקרון. יתכן ונוגדנים מונוקלונליים אחרים מנטרלים פחות, אך מדובר בעבודה מעודדת.
פרסום שישי - הפעם של חברת פייזר. לא מדובר במאמר, אלא בפרסום לתקשורת, כך שקשה לנתח זאת בצורה מסודרת. לטענתם מנת החיסון השלישית משמרת היטב את יכולת הנטרול, ולכן יעילות החיסון נשמרת.

investors.biontech.de/news-releases/…
כמו שציינתי בהתחלה, כל העבודות הללו בוחנות אך ורק מרכיב בודד של מערכת החיסון: איכות וכמות נוגדנים מנטרלים כנגד הנגיף. עבודות אלו לא מדגימות בכלל את כל שאר מרכיבי מע' החיסון, כמו למשל נוגדנים לא-מנטרלים ותאי T.

נוסף על כך, המחקרים הללו (אם פורסמו) הם עדיין קטנים מאוד. אמנם נראה>
שישנה ירידה ביכולת הנטרול, אבל היא לא עקבית לחלוטין, וכמעט ולא משקפת את מה שקורה בגופם של מחוסנים במנה השלישית.

עכשיו חשוב להזכיר שגם אם הירידה אמיתית (ואני ממש לא משוכנע שאנחנו רואים ירידה של פי 30-40 בנטרול), היא מציגה רק את מה שהיה בדם של הנבדקים *לפני חשיפה לנגיף*.
כל הרעיון של החיסונים הוא ביסוס זיכרון חיסוני, כך שבמידה וישנה חשיפה קודמת - התגובה החיסונית תהיה חדה ומהירה. יש זיכרון חיסוני, ולכן אנחנו יודעים בסבירות גבוהה *מאוד* שהחיסונים עדיין מקנים הגנה מצוינת כנגד תחלואה מנגיף הקורונה, גם אם יש ירידה מסוימת בנטרול והדבקה.
המסקנה המרכזית היא שהחיסונים חשוב יותר מאי פעם, וחשוב מאוד ללכת להתחסן.

הסוף ♥️

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with Stav Kislev

Stav Kislev Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @StavKislev

6 Dec
וריאנט האומיקרון ממשיך להתפשט בעולם, ועל הדרך גם להשתנות (#אבולוציה_בלתי_נמנעת). זו כבר לא מגיפה דרום-אפריקאית, אלא הוא צץ גם בבריטניה, בארה"ב, ביפן, ברבות ממדינות מערב אירופה - ועוד.

הדרך ה*יחידה* לנצח את נגיף הקורונה, על שלל הוריאנטים שלו, היא התחסנות המונית - בארץ ובעולם. ImageImage
אלו שמציעים מבוקר עד ערב "לחסן רק את מי שבסיכון" וצועקים "עזבו את הילדים" פשוט לא מבינים ש:
1. כולם בסיכון מהנגיף. חלק מתים יותר, וחלק מתים פחות, אבל כולם בסיכון.
2. רק ככה מנצחים מגיפות - מסך ברזל של חיסונים. מה שנקרא מסלקים את הנגיפים בכוח הזרוע 💪 Image
עכשיו בנוגע ליעילות החיסון - זה בטוח שהחיסון מקנה הגנה כנגד וריאנט האומיקרון. זוהו עד כה 1.7 מיליון וריאנטים, וכנגד כולם החיסון מחזיק נפלא (היו עוד המונים, פשוט לא תועדו). וריאנט האומיקרון הוא עדיין הקורונה שלנו (sars-cov-2), פשוט וריאציה קצת שונה. מה שקשה לומר זה עד כמה *בדיוק*> Image
Read 5 tweets
27 Nov
A tiny thread about the new Omicron Variant (with lots of cool images):

TL/DR - It's way too early to panic. There are some good reasons for the health authorities to be alarmed, but it's too early for the general public to start writing wills. We should wait&see what's going on
So, what gives?

The SARS-COV-2 has distinct bulges in its outer membrane (shown in red). These bulges are made of a protein called 'Spike' (or S for short), and they're critical for the virus since they mediate the cellular entry (basically responsible for infecting us).
That's why our COVID vaccines, and lots of other therapies, were designed to attack those bulges - the spike protein.

Truth be told, the vaccines work like a charm, presenting an efficacy of ~95%.
Read 15 tweets
27 Nov
שרשורון קצרצר על הוריאנט החדש אומיקרון עם הרבה תמונות מגניבות:

אמל"ק - מוקדם להכנס לפאניקה. יש סיבות לחשוש ברמת רשויות הבריאות (ותכף נבהיר למה), אבל מוקדם לדבר על זה בקהל הרחב. אנחנו עדיין לא יודעים לאן הרוח נושבת.
אז מה הקטע?

לנגיף הקורונה יש בליטות מובחנות על פני המעטפת שלו, מה שמופיע כאן בצבע אדום. הבליטות הללו בנויות מחלבון שנקרא חלבון הספייק (או S בקיצור), וזה חלבון קריטי לנגיף כיוון שבעזרתו הוא חודר לתוך התאים שלנו ובעצם מדביק אותנו.
לכן החיסונים שלנו וחלק גדול מהטיפולים שאנחנו נותנים לקורונה תוכננו כך שיתקפו את הבליטות הללו - את חלבון הספייק.

באמת החיסונים נותנים עבודה, עם יעילות של ~95%.
Read 9 tweets
23 Oct
לאור ההצלחה של השרשור הקודם, החלטתי להקדים את השרשור הבא.

עבור מי שלא קרא את השרשור הקודם - אפשר למצוא אותו כאן:


ברוכים הבאים לשרשור "היסטוריה 2 - חיסונים במחצית הראשונה של המאה ה-20":
עצרנו את המסע בכניסה לשנת 1900. בתקופה זו היו ברשותינו 5 חיסונים פעילים (אבעועות שחורות של ג'נר, כלבת חי-מוחלש של פסטר, וחיסונים מומתים של טיפוס הבטן, כולרה ודבר). כמו כן, וון-בהרינג פיתח 2 חיסונים סבילים (נוגדנים בלבד) כנגד דיפטריה וטטנוס.
למעשה, דיפטריה וטטנוס אלו מחלות שברובן לא נובעות באופן ישיר מוירוס או חיידק, אלא מרעלנים שחיידקים מפרישים. טטנוס גורמת לפרכוסים קשים, עד כדי שוברי עצמות. דיפטריה גורמת לתחלואה נשימתית עם חום גבוה, שיעול, קוצר נשימה וכו'. התמותה מדיפטריה מגיעה עד 20%, כך שזו ללא ספק מחלה רצינית.
Read 36 tweets
22 Oct
ובכן, הבטחתי שרשור על יסודות מערכת החיסון, והגיע הזמן להתחיל. אנסה לגעת בשאלות כמו: מה רואים בתמונה? איך החיסון לקורונה עובד? איך תחום האימונולוגיה התפתח? למה נותנים את כל החיסונים בריבוי מנות? למה תמונות זרחניות הן כאלה מגניבות?

בתפריט של היום: "היסטוריה1 - מי את מע' החיסון?":
תחילתו של סיפורינו בנגיף בשם Variola Major. מדובר בנגיף שהיה מאוד נפוץ לאורך השנים, גרם להופעת שלפוחיות כאלה ברחבי הגוף, קטל כ-30-50% מהנדבקים, והותיר שליש מהשורדים עיוורים. המחלה שהנגיף עורר נקראת Smallpox (או בעברית: אבעועות שחורות).
בתחילת המאה ה-18, אצילה בריטית בשם ליידי מונטגיו שלחה מכתב ל-Royal Society באנגליה. במכתב פירטה מונטגיו על מנהג משונה שמבצעים בטורקיה; רופאים מקומיים נוטלים דגימות משלפוחיות נגועות, מייבשים אותן, ומזריקים את התכולה לאנשים בריאים כצעד מניעתי. אכן שיעור ה-smallpox היה יחסית קטן >>
Read 26 tweets
20 Oct
לבקשת @LittleMoiz, יעילות החיסון:

במניעת הדבקה:

*מנה 2 'ישנה' מפחיתה ב~50%
*מנה 3 'חדשה' מפחיתה ב~90%

במניעת תחלואה קשה (מעל גיל 40):

*מנה 2 'ישנה' מפחיתה ב~90%
*מנה 3 'חדשה' מפחיתה ב~98%

במילים אחרות, מנת הבוסטר משפרת את ההגנה בערך פי 5! ImageImage
במילים אחרות - הבוסטר מקנה הגנה מצוינת, ונכון להיום לא נראה שישנה דעיכה (נמשיך לעקוב באדיקות).

שימו לב:
אין חולים קשים מחוסנים ב-2 מנות מתחת לגיל 20
אין (כמעט) חולים קשה מחוסנים ב-3 מנות מתחת לגיל 40! ImageImage
ברמת המאקרו אפשר לראות באופן בולט שהגל דועך תודות למנה השלישית. ירוק - נדבקים, אדום - חולים קשה, שחור - מתים. שימו לב, ככל שמתחסנים יותר במנות 1+2, הגל השלישי דעך, וככל שהתחסנו במנה 3, הגל הרביעי דעך.

ה-R יציב על ~0.75, והדעיכה בהתאם. ImageImage
Read 7 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal

Or Donate anonymously using crypto!

Ethereum

0xfe58350B80634f60Fa6Dc149a72b4DFbc17D341E copy

Bitcoin

3ATGMxNzCUFzxpMCHL5sWSt4DVtS8UqXpi copy

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!

:(