Thread by @koichi_kawakami

＞厚労省担当者「抗原検査の陽性判明はPCRの91・4％」

この数字はルミパルスの取説↓
info.pmda.go.jp/tgo/pack/30200…
の一致率、22/24(91.6%)、27/30(90%)に近い数字。
けれども、この数字には意味がないことをスレッドで説明します。
#空港検疫を感度のわるい抗原検査から感度のよいPCR検査に戻して下さい

https://twitter.com/mainichi/status/1473772836493930514

(承前)
ここでの問題点は、
①たった20~30の検体しか調べていないこと
②それぞれの検体のCt値を考慮していないこと
③検出限界を真摯に検討していないこと
です。
さて一致率の実態とはどういうものでしょう？↓
#空港検疫を感度のわるい抗原検査から感度のよいPCR検査に戻して下さい

↓
例えば5人の感染者がいて、その人たちからの検体のCt値が
20、22、23、26、29だったとします。PCRでも抗原定量でも検出できます。なので一致率は100%になります。
20、22、23、26、35だとしたら、PCRでは全部検出できるけど、抗原定量ではそのうち４つ、20、22、23、26しか検出できません。↓

↓
その場合、一致率は80%になります。
さらに、その5検体のCt値が20、22、23、36、35だとしたら抗原定量では、35、36を検出できない。なので一致率は60%になります。

このように、Ct値を無視した一致率は無意味なのです。
したがって、Ct値を考慮した解析、グラフが必要になります。↓

↓
このデータはさまざまなCt値の検体について、PCR(RT-qPCR)と抗原定量法で解析したものです。横軸がCt値です。
丸がそれぞれの検体です。このグラフを読むと、Ct値30以上の検体は抗原定量法では検出できないことが示されています。↓

https://twitter.com/koichi_kawakami/status/1469641628709437445?s=20

↓
こちらの図は基本的に前の図と同じものです。
唾液では55検体中21検体(38%)が偽陰性(赤丸部分)、即ち抗原定量で見逃されます。鼻咽頭ぬぐい液では40検体中8検体が偽陰性(20%)になっています。PCRとの一致率は62%、80%です。先ほどの~90%とだいぶ違いますよね。↓

https://twitter.com/koichi_kawakami/status/1469639951000403973?s=20

↓
どういうCt値のばらつきを持った検体（群）かで一致率など容易に変わります。~90%の一致率は、たまたまそうなっただけ。それよりも検出限界がCt値30程度であることが重要で問題なのです。感染者を多く見逃してしまいます。//
#空港検疫を感度のわるい抗原検査から感度のよいPCR検査に戻して下さい