#拡散希望 🔔速報🔔 新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japan🇯🇵のプレプリント第13弾を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。本研究では、#オミクロン BA.2.75株(通称 #ケンタウロス)のウイルス学的解明を解明しました。
以下、本研究の概要です。1/11
biorxiv.org/content/10.110…
2022年5月、インド🇮🇳で、スパイクタンパク質に新たな変異を獲得した #オミクロン 系統の亜株「BA.2.75」が確認されました。BA.5による第7波真っ只中の日本においても、BA.2.75の市中感染は各所で確認されています。2/11
これまでに見られなかった変異の存在や世界各国での検出を受けて、WHOは7月7日に、BA.2.75株を「懸念される変異株(VOC)における監視下の系統(VOC-LUM; variant of concern linages under monitoring)」に分類し、注視しています。3/11
who.int/activities/tra…
BA.2.75は、「第2世代BA.2 (second-generation BA.2 subvariant)」とも呼ばれています。ちなみに、BA.2.75の #ケンタウロス という俗称は、以下のツイートが発端です(トリビア)↓ 4/11
BA.2.75は、BA.5と同様、BA.2の子孫として出現した変異株です。しかし、BA.5とBA.2.75は、系統的には異なる変異株です。つまり、BA.2.75は、BA.5とは独立に、BA.2から派生した変異株です。5/11
本研究ではまず、インド🇮🇳から報告されたウイルス配列の数理統計解析によって、BA.2.75の実行再生算数(図中「Re」)が、現在(日本🇯🇵を含む)世界で主流のBA.5よりも約1.2倍高いことを明らかにしました。つまり、BA.5よりも流行しやすいポテンシャルを持っていることを示唆します。6/11
BA.1あるいはBA.2に感染したワクチン接種者(つまり、オミクロンのブレイクスルー感染者)の血清を使った中和試験の結果、BA.2.75とBA.2の中和抗体抵抗性は同程度でした。(※BA.5はBA.2よりも約2倍抵抗性)。7/11
BA.5ブレイクスルー感染者の血清を使った中和試験はこれから実施する予定ですが、BA.2.75は、BA.5に感染して回復したハムスターの血清にはきわめて強い抵抗性を示します。つまり、BA.2.75とBA.5は、免疫原性(抗体を誘導し、抗体で認識される性質)がまったく異なることを示唆しています。8/11
3つの治療抗体薬、レムデシビル(図中「Remdesivir」)、モルヌピラビル(図中「EIDD-1931」)、パクスロビド(図中「Nirmatrelvir」;パクスロビドの成分のひとつ)は、BA.2.75にも有効でした。9/11
最後に、デルタ, BA.2, BA.5, BA.2.75の臨床分離株とハムスターを用いた感染実験を実施しました。その結果、BA.2.75とBA.5のハムスターにおける病原性は同じくらいで、デルタより低く、BA.2よりも高いことを明らかにしました。10/11
まとめ▶️ BA.2.75は、
1️⃣BA.5より流行しやすい
2️⃣BA.5の感染で獲得した免疫が効かない可能性がある
3️⃣病原性ポテンシャルはBA.2よりも高い
ことがわかりました。
BA.5による第7波の動向に加え、BA.2.75という高いリスクポテンシャルを持つ変異株が出現していることにも留意すべきと考えます。11/11
ちなみにBA.5の時もそうでしたが、「また煽りか😩」「実験動物の結果がヒトでも同じとはかぎらないでしょ🤷🏻‍♂️」と一笑に付されることがままあるので先に補足です。これは妄想や推測ではなく、科学的知見に基づいた情報です。BA.5時の経緯は↓のスレッドを参照ください。11/11+1

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Aug 8
BREAKING🔔 The 13th preprint from G2P-Japan🇯🇵 is out @biorxivpreprint. #Omicron BA.2.75 (aka #Centaurus) seems to be more contagious than BA.5 and more pathogenic than the original BA.2. Please RT. 1/7

biorxiv.org/content/10.110…
BA.2.75, emerged in India🇮🇳, is classified as VOC-LUM (variant of concern linage under monitoring) by WHO on July 7. Here we elucidated the effective reproduction number, sensitivity to antiviral immunity & drugs and intrinsic pathogenicity of BA.2.75. 2/7
who.int/activities/tra…
Both BA.2.75 and BA.5 are descendants of BA.2. However, BA.2.75 is phylogenetically different from BA.5, the currently predominant BA.2 descendant. BA.2.75 spike bears nine substitutions, but only one substitution (R493Q) is shared with BA.5 spike. 3/7
Read 7 tweets
May 26
#拡散希望 🔔速報🔔 新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japan🇯🇵のプレプリント第10弾を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。本研究では、#新しいオミクロン亜株(BA.4, BA.5, BA.2.12.1など)のウイルス学的性質(伝播力、免疫抵抗性、病原性)を解明しました。1/7

biorxiv.org/content/10.110…
1️⃣最近、スパイクタンパク質に新たな変異を獲得した #オミクロン 系統の亜株が、世界各地で出現し、流行拡大しています。具体的には、アメリカ🇺🇸のBA.2.12.1系統(+S:L452Q/S704L)、南アフリカ🇿🇦のBA.4, BA.5系統(+S:HV69-70del/L452R/F486V/R493Q)などです。2/7
2️⃣ウイルス配列の数理統計解析によって、これらの #新しいオミクロン亜株#伝播力 は、BA.2よりも約1.2倍高いことを明らかにしました。実際、南アフリカやアメリカなどの国では、すでに新しいオミクロン亜株への置き換わりが進んでいます。3/7
Read 7 tweets
May 26
BREAKING🔔 The 10th preprint from G2P-Japan🇯🇵 is out at @biorxivpreprint. #Omicron BA.4 & BA.5 variants seem to be more contagious and pathogenic than BA.2 variant. Please RT. 1/7

biorxiv.org/content/10.110…
Recently, Omicron BA.2 subvariants that bear additional mutations in the spike proteins emerged and begun outcompeting original BA.2 - e.g., BA.2.12.1 (+L452Q/S704L) in US🇺🇸 and BA.4 & BA.5 (+L452R/HV69-70del/F486V/R493Q) in South Africa🇿🇦. 2/7
1⃣ Statistical analysis shows that the effective reproduction numbers of BA.2.12.1, BA.4 & BA.5 are ~1.2-fold higher than that of BA.2. 3/7
Read 7 tweets
May 4
BREAKING🔔 The 9th preprint from G2P-Japan🇯🇵 is out at @biorxivpreprint. We evaluated the effects of 8 therapeutic monoclonal antibodies against new #Omicron subvariants such as BA.2.11, BA.2.12.1, BA.4 and BA.5. Please RT. 1/5

biorxiv.org/content/10.110…
Recently, the Omicron subvariants bearing additional mutations in the BA.2 spike emerged in multiple countries - e.g., BA.2.11 (+L452R) in France🇫🇷, BA.2.12.1 (+L452Q/S704L) in US🇺🇸, and BA.4 and BA.5 (+L452R/HV69-70del/F486V/R493Q) in South Africa🇿🇦. 2/5
In this study, we evaluated the sensitivity of these Omicron subvariants to 8 therapeutic monoclonal antibodies, bamlanivimab, bebtelovimab, casirivimab, cilgavimab, etesevimab, imdevimab, tixagevimab and sotrovimab. 3/5
Read 5 tweets
May 4
#拡散希望 新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japan🇯🇵のプレプリント第9弾「オミクロン亜株の中和抗体薬感受性」を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。

biorxiv.org/content/10.110…

以下、本研究の概要です。1/5
最近、スパイクタンパク質に新たな変異を獲得した #オミクロン 系統の亜株が、世界各地で出現し、流行拡大しています。具体的には、フランス🇫🇷のBA.2.11系統(+L452R)、アメリカ🇺🇸のBA.2.12.1系統(+L452Q/S704L)、南アフリカ🇿🇦のBA.4, BA.5系統(+L452R/HV69-70del/F486V/R493Q)です。2/5
本研究では、これらのオミクロン亜株に対する8種類の中和抗体薬(bamlanivimab, bebtelovimab, casirivimab, cilgavimab, etesevimab, imdevimab, tixagevimab and sotrovimab)の効果を評価しました。3/5
Read 5 tweets
May 2
#拡散希望 新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japan🇯🇵の論文第8弾「オミクロンBA.2」を、Cell @CellCellPress に発表しました。#ステルスオミクロン とも呼ばれたオミクロンBA.2株について、伝播力、病原性、免疫抵抗性などのさまざまなウイルス学的性状を解明しました。1/5
cell.com/cell/fulltext/…
以下、本研究の概要です。

1⃣ ウイルス配列情報の数理モデリング解析によって、BA.2(ステルスオミクロン)の #伝播力 は、BA.1(従来のオミクロン)よりも約1.4倍高いことを明らかにしました。実際、日本でも、すでにBA.1からBA.2への置き換わりが進んでいます。2/5
2⃣ BA.2(ステルスオミクロン)は、ワクチン2回接種で誘導される中和抗体にきわめて抵抗性です。BA.1感染回復者の血清にも抵抗性を示します。ただし、ブースター接種、あるいは、ワクチン2回接種+BA.1感染回復者の血清は、BA.2の感染を強く抑制します。3/5
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