BREAKING🔔 The 13th preprint from G2P-Japan🇯🇵 is out @biorxivpreprint. #Omicron BA.2.75 (aka #Centaurus) seems to be more contagious than BA.5 and more pathogenic than the original BA.2. Please RT. 1/7

biorxiv.org/content/10.110…
BA.2.75, emerged in India🇮🇳, is classified as VOC-LUM (variant of concern linage under monitoring) by WHO on July 7. Here we elucidated the effective reproduction number, sensitivity to antiviral immunity & drugs and intrinsic pathogenicity of BA.2.75. 2/7
who.int/activities/tra…
Both BA.2.75 and BA.5 are descendants of BA.2. However, BA.2.75 is phylogenetically different from BA.5, the currently predominant BA.2 descendant. BA.2.75 spike bears nine substitutions, but only one substitution (R493Q) is shared with BA.5 spike. 3/7
First, our mathematical/statistical analysis revealed that the effective reproduction number ("Re" in the figure) of BA.2.75 is greater than that of BA.5, suggesting that BA.2.75 is more contagious than BA.5. 4/7
While the sensitivity of BA.2.75 to vaccine- & BA.1/2 breakthrough infection-induced immunity was comparable to that of BA.2, the BA.5-induced immunity (*in hamsters) was ineffective against BA.2.75. Three clinically-available antiviral drugs were effective against BA.2.75. 5/7
Using clinical isolates of BA.2, BA.2.75, BA.2 & Delta and a hamster model, we demonstrated that the intrinsic pathogenicity of BA.2.75 is comparable to that of BA.5 but is greater than that of the original BA.2. 6/7
▶️ Our multiscale investigations suggest that BA.2.75 acquired virological properties independently of BA.5, and the potential risk of BA.2.75 to global health is greater than that of BA.5. 7/7

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Aug 8
#拡散希望 🔔速報🔔 新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japan🇯🇵のプレプリント第13弾を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。本研究では、#オミクロン BA.2.75株(通称 #ケンタウロス)のウイルス学的解明を解明しました。
以下、本研究の概要です。1/11
biorxiv.org/content/10.110…
2022年5月、インド🇮🇳で、スパイクタンパク質に新たな変異を獲得した #オミクロン 系統の亜株「BA.2.75」が確認されました。BA.5による第7波真っ只中の日本においても、BA.2.75の市中感染は各所で確認されています。2/11
これまでに見られなかった変異の存在や世界各国での検出を受けて、WHOは7月7日に、BA.2.75株を「懸念される変異株(VOC)における監視下の系統(VOC-LUM; variant of concern linages under monitoring)」に分類し、注視しています。3/11
who.int/activities/tra…
Read 12 tweets
May 26
#拡散希望 🔔速報🔔 新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japan🇯🇵のプレプリント第10弾を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。本研究では、#新しいオミクロン亜株(BA.4, BA.5, BA.2.12.1など)のウイルス学的性質(伝播力、免疫抵抗性、病原性)を解明しました。1/7

biorxiv.org/content/10.110…
1️⃣最近、スパイクタンパク質に新たな変異を獲得した #オミクロン 系統の亜株が、世界各地で出現し、流行拡大しています。具体的には、アメリカ🇺🇸のBA.2.12.1系統(+S:L452Q/S704L)、南アフリカ🇿🇦のBA.4, BA.5系統(+S:HV69-70del/L452R/F486V/R493Q)などです。2/7
2️⃣ウイルス配列の数理統計解析によって、これらの #新しいオミクロン亜株#伝播力 は、BA.2よりも約1.2倍高いことを明らかにしました。実際、南アフリカやアメリカなどの国では、すでに新しいオミクロン亜株への置き換わりが進んでいます。3/7
Read 7 tweets
May 26
BREAKING🔔 The 10th preprint from G2P-Japan🇯🇵 is out at @biorxivpreprint. #Omicron BA.4 & BA.5 variants seem to be more contagious and pathogenic than BA.2 variant. Please RT. 1/7

biorxiv.org/content/10.110…
Recently, Omicron BA.2 subvariants that bear additional mutations in the spike proteins emerged and begun outcompeting original BA.2 - e.g., BA.2.12.1 (+L452Q/S704L) in US🇺🇸 and BA.4 & BA.5 (+L452R/HV69-70del/F486V/R493Q) in South Africa🇿🇦. 2/7
1⃣ Statistical analysis shows that the effective reproduction numbers of BA.2.12.1, BA.4 & BA.5 are ~1.2-fold higher than that of BA.2. 3/7
Read 7 tweets
May 4
BREAKING🔔 The 9th preprint from G2P-Japan🇯🇵 is out at @biorxivpreprint. We evaluated the effects of 8 therapeutic monoclonal antibodies against new #Omicron subvariants such as BA.2.11, BA.2.12.1, BA.4 and BA.5. Please RT. 1/5

biorxiv.org/content/10.110…
Recently, the Omicron subvariants bearing additional mutations in the BA.2 spike emerged in multiple countries - e.g., BA.2.11 (+L452R) in France🇫🇷, BA.2.12.1 (+L452Q/S704L) in US🇺🇸, and BA.4 and BA.5 (+L452R/HV69-70del/F486V/R493Q) in South Africa🇿🇦. 2/5
In this study, we evaluated the sensitivity of these Omicron subvariants to 8 therapeutic monoclonal antibodies, bamlanivimab, bebtelovimab, casirivimab, cilgavimab, etesevimab, imdevimab, tixagevimab and sotrovimab. 3/5
Read 5 tweets
May 4
#拡散希望 新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japan🇯🇵のプレプリント第9弾「オミクロン亜株の中和抗体薬感受性」を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。

biorxiv.org/content/10.110…

以下、本研究の概要です。1/5
最近、スパイクタンパク質に新たな変異を獲得した #オミクロン 系統の亜株が、世界各地で出現し、流行拡大しています。具体的には、フランス🇫🇷のBA.2.11系統(+L452R)、アメリカ🇺🇸のBA.2.12.1系統(+L452Q/S704L)、南アフリカ🇿🇦のBA.4, BA.5系統(+L452R/HV69-70del/F486V/R493Q)です。2/5
本研究では、これらのオミクロン亜株に対する8種類の中和抗体薬(bamlanivimab, bebtelovimab, casirivimab, cilgavimab, etesevimab, imdevimab, tixagevimab and sotrovimab)の効果を評価しました。3/5
Read 5 tweets
May 2
#拡散希望 新型コロナ研究コンソーシアムG2P-Japan🇯🇵の論文第8弾「オミクロンBA.2」を、Cell @CellCellPress に発表しました。#ステルスオミクロン とも呼ばれたオミクロンBA.2株について、伝播力、病原性、免疫抵抗性などのさまざまなウイルス学的性状を解明しました。1/5
cell.com/cell/fulltext/…
以下、本研究の概要です。

1⃣ ウイルス配列情報の数理モデリング解析によって、BA.2(ステルスオミクロン)の #伝播力 は、BA.1(従来のオミクロン)よりも約1.4倍高いことを明らかにしました。実際、日本でも、すでにBA.1からBA.2への置き換わりが進んでいます。2/5
2⃣ BA.2(ステルスオミクロン)は、ワクチン2回接種で誘導される中和抗体にきわめて抵抗性です。BA.1感染回復者の血清にも抵抗性を示します。ただし、ブースター接種、あるいは、ワクチン2回接種+BA.1感染回復者の血清は、BA.2の感染を強く抑制します。3/5
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