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The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture
@SystemsVirology
Oct 10, 2022 • 18 tweets • 6 min read • Read on X
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#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の論文第14弾（カウントどこかでずれてました）を、Cell Host & Microbe @cellhostmicrobe に発表しました。本研究では、#オミクロン BA.2.75株（通称 #ケンタウロス）のウイルス学的性状を解明しました。
以下、本研究の概要です。1/18
cell.com/cell-host-micr…
2022年5月、インド🇮🇳で、スパイクタンパク質に新たな変異を獲得した #オミクロン 系統の亜株「BA.2.75」が確認されました。BA.5による第7波真っ只中の日本においても、BA.2.75の市中感染は各所で確認されています。2/18
これまでに見られなかった変異の出現や世界各国での検出を受けて、WHOは7月7日に、BA.2.75株を「懸念される変異株（VOC）における監視下の系統（VOC-LUM; variant of concern linages under monitoring）」に分類し、注視しています。3/18
who.int/activities/tra…
BA.2.75は、「第2世代BA.2 (second-generation BA.2 subvariant)」とも呼ばれています。ちなみに、BA.2.75株の #ケンタウロス という俗称は、以下のツイートが発端です↓ 4/18
BA.2.75は、BA.5と同様、BA.2の子孫として出現した変異株です。しかし、BA.2.75とBA.5は、系統的には異なる変異株です。つまり、BA.2.75は、BA.5とは独立に、BA.2から派生した変異株です。5/18
本研究ではまず、インド🇮🇳から報告されたウイルス配列の数理統計解析によって、BA.2.75の実行再生算数（図中「Re」）が、現在（日本🇯🇵を含む）世界で主流のBA.5よりも約1.2倍高いことを明らかにしました。つまり、BA.5よりも流行しやすいポテンシャルを持っていることを示唆します。6/18
次に、中和試験を実施しました。その結果、
1⃣ 3回ワクチン接種者の血清に対するBA.2.75の抵抗性は、親株であるBA.2と同程度でした。（※BA.5はBA.2よりも約2倍抵抗性）。7/18
2⃣ 4回ワクチン接種者の血清に対するBA.2.75の抵抗性は、親株であるBA.2の1.7倍でした。（※BA.5はBA.2よりも約1.2倍抵抗性）。8/18
3⃣ BA.1あるいはBA.2に感染したワクチン接種者（つまり、オミクロンのブレイクスルー感染者）の血清に対するBA.2.75の抵抗性は、親株であるBA.2と同程度でした。（※BA.5はBA.2よりも約2〜3倍抵抗性）。9/18
4⃣ BA.5ブレイクスルー感染者の血清に対するBA.2.75の抵抗性は、BA.5の1.7倍でした。10/18
5⃣ BA.5感染ハムスターの血清に対するBA.2.75の抵抗性は、BA.5の11倍でした。つまり、BA.2.75とBA.5は、免疫原性（抗体を誘導し、抗体で認識される性質）がまったく異なることを示唆しています。11/18
6⃣ BA.2.75とBA.5の免疫原性の違いは、BA.2.75感染ハムスターの血清を用いた中和試験の結果からも示唆されています。12/18
7⃣ そして、BA.2.75に対する10種類の中和抗体薬の効果も評価しました。この結果の詳細は、↓のG2P-Japan🇯🇵プレプリント第11弾の解説を参照ください。13/18
BA.2.75に対する3つの治療抗体薬、レムデシビル（図中「Remdesivir」）、モルヌピラビル（図中「EIDD-1931」）、パクスロビド（図中「Nirmatrelvir」；パクスロビドの成分のひとつ）の効果も評価しました。これらの薬は、BA.2.75にも有効でした。14/18
BA.2.75は、ACE2への結合力がきわめて強い株であることを実証しました。また、クライオ電子顕微鏡を用い、BA.2.75のスパイクタンパク質の構造を解明することで、ACE2への高い結合性の原理を明らかにしました。15/18
細胞融合実験の結果、BA.2.75の融合力は、BA.5と同様に、親株のBA.2よりも高いことを明らかにしました。16/18
最後に、Delta, BA.2, BA.5, BA.2.75の臨床分離株とハムスターを用いた感染実験を実施した結果、BA.2.75とBA.5のハムスターにおける病原性は、親株のBA.2よりも高いことを明らかにしました。17/18
まとめ▶️ BA.2.75は、
1. BA.5より流行しやすい
2. BA.5, BA.2とは免疫学的性質が違う
3. 病原性ポテンシャルはBA.2よりも高い
ことが明らかになりました。

↓は、本研究のまとめポンチ絵です。18/18

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Nov 21
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しいプレプリント「JN.1対応mRNAワクチンが誘導する中和抗体の効果の評価」を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。1/
biorxiv.org/content/10.110…
本研究では、#ファイザー 🇺🇸🇩🇪のワクチンと、#第一三共 🇯🇵の国産ワクチンを接種した方の、ワクチン接種前後の血清を用いた検討実験を行いました。
まず朗報として、２つのワクチンで誘導される中和抗体の活性に大差はなく、どちらの血清も、JN.1のみならずKP.3.1.1やXECの感染を強く抑制しました。2/ Image
しかし、科学的観点からは、注目すべき点がふたつ。

その１。われわれは最近、JN.1やKP.3.3の「自然感染」では、強い中和抗体活性が誘導されないことを示しました。しかし上述の通り、JN.1ワクチンでは、強い中和活性（NT50; 50%中和抗体価）が誘導されています。この違いはいったい🤔？ 3/ Image
Read 9 tweets
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Nov 21
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵, led by Keiya @Keiya717, is out at @biorxivpreprint. We assessed the humoral immunity induced by JN.1 mRNA vaccines against a broad range of SARS-CoV-2 variants including JN.1, KP.3.1.1 & XEC. Please repost🔥 1/
biorxiv.org/content/10.110…
In this study, we used 2 mRNA vaccines, one is from Pfizer/BioNTech🇺🇸🇩🇪, while another is from Daiichi-Sankyo🇯🇵. The good news is that there are no significant differences between them and both broadly neutralized a variety of SARS-CoV-2 including JN.1, KP.3.1.1 and XEC. 2/ Image
But there are two scientific interests.

First, compared to our recent study using JN.1 and KP.3.3 breakthrough (i.e. natural) infection sera, antiviral humoral immunity against KP.3 and XEC was weakly induced. However, JN.1 mNRA vaccine can. Why🤔?? 3/ Image
Read 8 tweets
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Oct 17
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵, led by Yu in my lab, is out at bioRxiv @biorxivpreprint. We elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 #XEC. Please repost🔥 1/
biorxiv.org/content/10.110…
Compared with KP.3, #XEC harbors two spike substitutions, S:T22N and S:F59S. Recombination analysis by Shusuke @KawakuboShusuke showed that XEC is a recombinant lineage of KS.1.1 (JN.13.1.1.1) and KP.3.3 (JN.1.11.1.3.3) with a breakpoint at genomic position 21,738–22,599. 2/ Image
Image
Transmissibility/fitness (Re):
Molecular phylogenetic-epidemic dynamics modeling led by Jumpei @jampei2 and Kaho showed that the Re of #XEC is greater than that of KP.3.1.1, the most predominant variant in the world. 3/ Image
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Jul 17
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しい研究成果「新型コロナウイルス変異株KP.3.1.1のウイルス学的特性の解明」について、プレプリント公開に先立って速報します。本研究では、最近いくつかの国で増加傾向にある、JN.1の子孫株である新しい変異株KP.3.1.1の特性を検証しました。1/
春になり、JN.1の子孫株が出現し、それらが優勢になり始めています。現在本邦は第11波に入っていますが、それはこれらのJN.1の子孫株によって引き起こされています。現在の流行状況などについては、本日公開の最新コラムで解説しています↓ 2/
そのひとつ、KP.2 (JN.1.11.1.2)については、すでにG2P-Japan🇯🇵が論文として報告しています。3/
Read 10 tweets
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Jul 17
BREAKING🔔 Here I want to quickly report our new results from G2P-Japan🇯🇵 before the preprint publication. We have elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 KP.3.1.1 - a progeny of JN.1. Please RT🔥 1/
Cf.1 A new one, KP.2 (JN.1.11.1.2), has been already elucidated. 2/
Cf.2 Another new ones, KP.3 (JN.1.11.1.3), LB.1 (JN.1.9.2.1) and KP.2.3 (JN.1.11.1.2.3), have also been already elucidated. 3/
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Jun 6
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しい研究成果「新型コロナウイルス変異株KP.3, LB.1, KP.2.3のウイルス学的特性の解明」について、プレプリント公開に先立って速報します。本研究では、最近いくつかの国で増加傾向にある、JN.1の子孫株である新しい3つの変異株の特性を検証しました。1/
春になり、JN.1の子孫株が出現し、それらが優勢になり始めています。そのひとつ、KP.2 (JN.1.11.1.2)の特性については、すでにG2P-Japan🇯🇵が論文として報告しています。2/
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