Share this page!

Enter URL or ID to Unroll

You can paste full URL like: https://x.com/threadreaderapp/status/1644127596119195649
or just the ID like: 1644127596119195649

How to get URL link on X (Twitter) App

  1. On the Twitter thread, click on or icon on the bottom
  2. Click again on or Share Via icon
  3. Click on Copy Link to Tweet
  4. Paste it above and click "Unroll Thread"!
  5. More info at Twitter Help
The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture
@SystemsVirology
Dec 27, 2022 • 9 tweets • 5 min read • Read on X
Scrolly
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵のプレプリント第15弾「組換えオミクロンXBBの性状解析」を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。本研究では、#遺伝子組換え で誕生した #オミクロン XBB株（通称 #グリフォン）の性質を解明しました。
biorxiv.org/content/10.110…

以下、本研究の概要です。1/
2022年後半になり、BA.5株以降、世界を席巻する新しい変異株の出現が見られず、また逆に、世界中でさまざまな #オミクロン亜株 が出現し、多様化しています。2/
たとえば、スパイクの5つの収斂進化変異（R346T, K444T, L452R, N460K, F486V）をコンプリートしたBQ.1.1株については、我々の先行プレプリント⬇️で、その誕生原理とウイルス学的な性状を報告しています。3/
本研究ではまず、@jampei2 と@SpyrosLytrasによる分子系統学と流行ダイナミクスの学際融合解析によって、XBBは、2022年、夏、インド周辺において、BJ.1とBM.1.1.1（BA.2.75の子孫）というふたつのオミクロン亜株の組換えによって誕生したことを明らかにしました。4/
XBBの実行再生産数（Re）は、もうひとつの現在進行形流行株BQ.1.1と同程度に高いものの、流行地域が異なることを明示しました。現在までの状況としては、BQ.1.1系統では西半球で、XBB系統は東半球でそれぞれ流行拡大していることがわかります。5/
中和実験の結果、XBBはBA.2に比べ、BA.5ブレイクスルー血清に対しては13倍（❗️）、BA.2ブレイクスルー血清に対しては30倍（‼️）というきわめて顕著な抵抗性を示す株であることを明らかにしました。6/
さらに、XBB株の融合力は、BA.2.75株よりも2.2倍高いことを明らかにしました。

G2P-Japanによるデルタ株（第5弾@Nature）、オミクロンBA.1株（第7弾@Nature）、BA.5株（第12弾@CellCellPress）などの研究から、スパイクの融合力とハムスターでの病原性には正の相関があることを見出しています。7/
しかし予想に反し、オミクロンBA.2一族のもうひとつの末裔であるBQ.1.1（⬆️のプレプリント第14弾参照）と同様、XBBの病原性は、その先祖の片割れのBA.2.75と同程度か、それよりも低いことがわかりました。8/
XBBは、#組換え によって流行拡大に成功した初めての株と言えます。本邦における頻度も増えてるし、BQ系統が主流だったアメリカでも爆増してます。オミクロンの進化の方向性を予想するのは難しいですが、今後の流行動向は、やはりみなさんの感染対策次第かと思います🙏 9/9
reuters.com/business/healt…

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
　

Keep Current with The Sato Lab (Kei Sato)

The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @SystemsVirology

The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture
Nov 21
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しいプレプリント「JN.1対応mRNAワクチンが誘導する中和抗体の効果の評価」を、bioRxiv @biorxivpreprint に発表しました。1/
biorxiv.org/content/10.110…
本研究では、#ファイザー 🇺🇸🇩🇪のワクチンと、#第一三共 🇯🇵の国産ワクチンを接種した方の、ワクチン接種前後の血清を用いた検討実験を行いました。
まず朗報として、２つのワクチンで誘導される中和抗体の活性に大差はなく、どちらの血清も、JN.1のみならずKP.3.1.1やXECの感染を強く抑制しました。2/ Image
しかし、科学的観点からは、注目すべき点がふたつ。

その１。われわれは最近、JN.1やKP.3.3の「自然感染」では、強い中和抗体活性が誘導されないことを示しました。しかし上述の通り、JN.1ワクチンでは、強い中和活性（NT50; 50%中和抗体価）が誘導されています。この違いはいったい🤔？ 3/ Image
Read 9 tweets
The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture
Nov 21
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵, led by Keiya @Keiya717, is out at @biorxivpreprint. We assessed the humoral immunity induced by JN.1 mRNA vaccines against a broad range of SARS-CoV-2 variants including JN.1, KP.3.1.1 & XEC. Please repost🔥 1/
biorxiv.org/content/10.110…
In this study, we used 2 mRNA vaccines, one is from Pfizer/BioNTech🇺🇸🇩🇪, while another is from Daiichi-Sankyo🇯🇵. The good news is that there are no significant differences between them and both broadly neutralized a variety of SARS-CoV-2 including JN.1, KP.3.1.1 and XEC. 2/ Image
But there are two scientific interests.

First, compared to our recent study using JN.1 and KP.3.3 breakthrough (i.e. natural) infection sera, antiviral humoral immunity against KP.3 and XEC was weakly induced. However, JN.1 mNRA vaccine can. Why🤔?? 3/ Image
Read 8 tweets
The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture
Oct 17
BREAKING🔔 A new study from G2P-Japan🇯🇵, led by Yu in my lab, is out at bioRxiv @biorxivpreprint. We elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 #XEC. Please repost🔥 1/
biorxiv.org/content/10.110…
Compared with KP.3, #XEC harbors two spike substitutions, S:T22N and S:F59S. Recombination analysis by Shusuke @KawakuboShusuke showed that XEC is a recombinant lineage of KS.1.1 (JN.13.1.1.1) and KP.3.3 (JN.1.11.1.3.3) with a breakpoint at genomic position 21,738–22,599. 2/ Image
Image
Transmissibility/fitness (Re):
Molecular phylogenetic-epidemic dynamics modeling led by Jumpei @jampei2 and Kaho showed that the Re of #XEC is greater than that of KP.3.1.1, the most predominant variant in the world. 3/ Image
Read 7 tweets
The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture
Jul 17
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しい研究成果「新型コロナウイルス変異株KP.3.1.1のウイルス学的特性の解明」について、プレプリント公開に先立って速報します。本研究では、最近いくつかの国で増加傾向にある、JN.1の子孫株である新しい変異株KP.3.1.1の特性を検証しました。1/
春になり、JN.1の子孫株が出現し、それらが優勢になり始めています。現在本邦は第11波に入っていますが、それはこれらのJN.1の子孫株によって引き起こされています。現在の流行状況などについては、本日公開の最新コラムで解説しています↓ 2/
そのひとつ、KP.2 (JN.1.11.1.2)については、すでにG2P-Japan🇯🇵が論文として報告しています。3/
Read 10 tweets
The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture
Jul 17
BREAKING🔔 Here I want to quickly report our new results from G2P-Japan🇯🇵 before the preprint publication. We have elucidated the virological characteristics of SARS-CoV-2 KP.3.1.1 - a progeny of JN.1. Please RT🔥 1/
Cf.1 A new one, KP.2 (JN.1.11.1.2), has been already elucidated. 2/
Cf.2 Another new ones, KP.3 (JN.1.11.1.3), LB.1 (JN.1.9.2.1) and KP.2.3 (JN.1.11.1.2.3), have also been already elucidated. 3/
Read 8 tweets
The Sato Lab (Kei Sato) Profile picture
Jun 6
#拡散希望 速報🔔 G2P-Japan🇯🇵の新しい研究成果「新型コロナウイルス変異株KP.3, LB.1, KP.2.3のウイルス学的特性の解明」について、プレプリント公開に先立って速報します。本研究では、最近いくつかの国で増加傾向にある、JN.1の子孫株である新しい3つの変異株の特性を検証しました。1/
春になり、JN.1の子孫株が出現し、それらが優勢になり始めています。そのひとつ、KP.2 (JN.1.11.1.2)の特性については、すでにG2P-Japan🇯🇵が論文として報告しています。2/
今回着目したのは、KP.2にやや遅れて出現した3つの株、KP.3 (JN.1.11.1.3)、LB.1 (JN.1.9.2.1)、KP.2.3 (JN.1.11.1.2.3)です。それぞれ、こんな変異を持っています。
（＊参考まで、JN.1=BA.2.86.1.1で、BA.2.86系統の子孫株）3/ Image
Read 8 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!

This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Don't want to be a Premium member but still want to support us?

Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal

Or Donate anonymously using crypto!

Ethereum

0xfe58350B80634f60Fa6Dc149a72b4DFbc17D341E copy

Bitcoin

3ATGMxNzCUFzxpMCHL5sWSt4DVtS8UqXpi copy

Thank you for your support!

Follow Us!

Send Email!

:(