Um grupo de pesquisadores internacionais empenhou esforços para desenvolver um sistema de nomenclatura de linhagens do vírus da dengue (DENV), essencial para facilitar a comunicação e a pesquisa sobre o vírus.

Quer saber mais? Segue o fio. 🧵👇🏾 O DENV possui quatro sorotipos (DENV-1 a DENV-4), cada um com múltiplos genótipos. A evolução do vírus envolve mutações frequentes durante as infecções, traços genéticos que são monitoráveis quase em tempo real. O vírus acumula cerca de ~7 mutações por ano​​.

Programo em Python. Adoro resolver problemas que envolvem programação. Mas se tem uma coisa que detesto é gastar horas tentando entender falhas (bugs) nos códigos. As vezes perco a esperança de achar a causa do problema, e no fim descubro que foi um 'espaço' fora do lugar. 😵‍💫💢🪲 Comecei a programar no mestrado em Microbiologia na USP. Queria tentar MSc em Bioinformática, mas o programa exigia alto nível de conhecimento em computação.

Hoje programo por que aprendi durante o PhD no Reino Unido, onde eu NÃO precisava chegar sendo especialista em computação

"Flurona": importante esclarecer sobre esse termo (inadequado) usado para designar coinfecções pelos vírus Influenza e SARS-CoV-2

1⃣ Não, não existe um vírus híbrido da gripe/COVID
2⃣ Infecções simultâneas por vírus que se disseminam juntos acontecem: é normal, porém indesejável É importante ter muito cuidado ao inventar termos não-oficiais para designar doenças ou patógenos. Termos como "flurona", "Delta plus" só geram confusão e ansiedade desnecessárias: "vírus híbrido", "super doença", "vírus mais agressivo".

Usem conceitos, não termos "criativos".

O cenário atual da pandemia na Europa, revelado com dados do @ECDC_EU, serve de alerta:

→ A desigualdade da cobertura vacinal é um problema global. Países com baixa cobertura têm sido duramente afetados com aumento de casos E óbitos.👇🏾🧵 A baixa cobertura vacinal em alguns países da Ásia, América Latina, Leste Europeu e em especial no continente africano tem que ser vista como um problema de todos nós.

Enquanto tivermos populações não vacinadas, o SARS-CoV-2 seguirá se disseminando mundialmente e causando danos.

Vigilância genômica no Brasil: semanas 31 a 38 🧬🇧🇷

Variantes detectadas nas 5 regiões brasileiras, de 1/8/2021 a 25/9/2021, com 7.150 genomas sequenciados por laboratórios independentes:

🔹Delta = 5.210 (72.9%)
🔹Gamma = 1.909 (26.7%)
🔹Outras = 31 (0.4%) Nos painéis abaixo, vemos as proporções de cada sublinhagem das principais variantes em circulação no Brasil. Tais proporções devem ser avaliadas com cautela, pois não sabemos ao certo quais estratégias de amostragem foram usadas. Logo, existem vieses.

Matéria do @correio24horas destaca o trabalho de perfis que divulgam ciência no Twitter.

▶️ correio24horas.com.br/noticia/nid/en… @oatila @dogarrett @dadourado @DhiordanLove @EthelMaciel @geisa_ponte @CienciaeSocied1 @schrarstzhaupt @luizacaires3

Gente maluca de verde e amarelo na Paulista sempre me lembra as artes de @vitorcartum. Retratam bem como o Brasil chegou nesse nível de insanidade de 2013 para cá.

Facebook: facebook.com/vitorcartum/ph…
#ForaBolsonaro #7SForaBolsonaro #JailBolsonaro Essas charges nunca envelhecem. #ForaBolsonaro 🇧🇷

Arte: @vitorcartum

Uma portaria da @anvisa_oficial impõe restrições a viajantes que vêm de Reino Unido, África do Sul e Índia.



Por que esses países?
R: São os países de origem das variantes Alpha 🇬🇧, Beta 🇿🇦, Delta 🇮🇳

Mas essa medida é ilógica, já que as variantes estão em mais de 100 países. Por semanas eu não queria crer que a @anvisa_oficial escolheu países alvo de restrições com base em locais de origem das variantes, e não com base em parâmetros de incidência da COVID-19 ou distribuição geográfica das variantes

Mas é isso mesmo. É uma regra ilógica, quase inócua

Entre as sugestões do Nextflix que recebi, já assisti ou comecei a assistir algumas: Atypical, Unorthodox, Sweet Tooth.

Agora estou assistindo o anime #Evangelion, é interessante. É uma produção bem anos 90: algumas cenas me remetem à banheira do Gugu.

https://twitter.com/AndersonBrito_/status/1414035665814228993?s=20

A nova abertura de #Evangelion é sensacional.

https://twitter.com/ddrodriguex/status/1433134150517673994?s=20

Do you know that only ~6% of the SARS-CoV-2 genomes submitted to GISAID (up to July 20th) came from low- and middle-income countries? 🌎🧬



In this study we discuss the causes, consequences and possible solutions for disparities in SARS-CoV-2 genomic surveillance. 🧵👇 The emergence of VOCs and VOIs (Variants of Concern/Interest) in late 2020 led countries to intensify genomic surveillance, especially high income countries, which sequence >5% of reported cases each week.

This threshold, however, cannot be achieve by most countries (see below)

Any virus in circulation accumulates mutations over time. Evolution never stops. It works just like a construction of roadways: it starts small, it grows, splits…but also shrinks, gets extinct.

The Pango system of SARS-CoV-2 nomenclature aims at tracking these changes.🧵👇 When SARS-CoV-2 emerged, and caused large outbreaks in early 2020, the Pango system started by classifying the virus into two lineages: A and B.

This paper explains how this dynamic system works: nature.com/articles/s4156…

Qualquer vírus em circulação acumula mutações. A evolução nunca para. É como a construção de uma via: começa pequena, se subdivide, aumenta de tamanho… mas também diminui, e se extingue.

O sistema Pango de nomenclatura do SARS-CoV-2 visa acompanhar essas mudanças. 🧵👇 Quando o SARS-CoV-2 emergiu, gerando grandes surtos no início de 2020, o sistema começou classificando o vírus em duas linhagens ('ruas'): A e B.

Este artigo explica como o sistema dinâmico funciona: nature.com/articles/s4156…

A variante Delta (B.1.617.2, identificada na Índia) ainda levanta muitas questões sobre transmissão, gravidade da doença, impacto sobre vacinas e no controle da pandemia.

Abaixo explico um pouco do que sabemos sobre a Delta.🦠 ✹ Primeiro, o que é uma variante?

No fim de 2019 existia um SARS-CoV-2 ancestral. Os coronavírus acumulam de 2 a 3 mutações por mês quando infectam seus hospedeiros. Qualquer vírus com variações genéticas em relação àqueles ancestrais é uma variante.

https://twitter.com/AndersonBrito_/status/1340424821029675009?s=20

Ilustrando a importância que o Brasil dá à Ciência: cortes constantes de verbas, pesquisadores com doutorado e desempregados.

CAPES e CNPq exigem que ex-bolsistas do Ciência sem Fronteiras retornem ao país, para retribuir o investimento.

Como? Desempregados? Vendendo doces? Sem garantia nem de emprego, quem dirá de verba para pesquisa em níveis similares às experiências internacionais que tiveram, ex-bolsistas Ciência sem Fronteiras tem poucas opções:

- Retornar ao país para o subemprego/desemprego
- Devolver o valor investido

Mas há outras saídas

Tem circulado um texto intitulado "Origin of Covid — Following the Clues", que alega que o SARS-CoV-2 escapou de um laboratório.
Ele levanta questionamentos importantes, mas se apoia em conjecturas, ad hominem, e numa clara incompreensão de como evolução viral ocorre.

Explico ⬇️ Entre uma origem natural ou "artificial", o texto afirma que "It’s important to note that so far there is *no direct evidence* for either theory"
Mas após longa argumentação, afirma que "the *available evidence* leans more strongly in one direction than the other"

Há evidências?

Como a Maré controlou surtos de COVID-19?

“Kit-COVID”?!
Não!

“O Conexão Saúde atua em quatro frentes: testagem gratuita para covid, comunicação, atendimento médico e psicológico por telefone e auxílio para garantir o isolamento de infectados.”

bbc.com/portuguese/bra… “Ao longo de um ano de pandemia a ciência e a sociedade já sabem o que funciona contra a covid. Mas o país perdeu tempo falando de cloroquina" - Bozza

Com medidas de controle da COVID, milhares de mortes seriam evitadas. Mas a nível federal o objetivo era deixar o vírus circular

Países têm banido a entrada de brasileiros, ou exigido quarentena de 14 dias, até em hotéis pagos pelos viajantes: tudo isso para evitar a importação de variantes do coronavírus.

Já o Brasil recebe novas variantes de braços abertos: um país acolhedor🛬🦠
globoplay.globo.com/v/9476417/ Para evitar a entrada de novas variantes, o que o Brasil poderia fazer?

— Colocar viajantes em quarentena em hotéis (pagos por eles); teste RT-PCR 3 dias depois; se positivo, ficam lá 11 dias extras; se negativo, quarentena em casa

Como é na Inglaterra👇
instagram.com/stories/highli…

Our study about B.1.1.7 in the US was recently published on @CellPressNews. We used flight data to predict importation risks in major urban areas, and genomic evidence revealed multiple introductions, interstate spread, and the exponential increase of B.1.1.7 in US states. #COVID Using travel data of incoming flights from the UK and other countries heavily affected by B.1.1.7, we modelled the risk of introduction and local spread of variants from this lineage.

Six states were predicted with the highest importation risks: NY, CA, FL, TX, NJ and MA. ✈️

Muitos têm questionado o fato de pessoas já vacinadas terem contraído o vírus, ou a COVID-19. Nenhuma vacina é 100% eficaz, nem blinda nosso corpo contra a entrada do vírus. Além disso, nosso sistema imunológico é complexo.

Em linhas gerais, abaixo explico como isso funciona.👇🏽 ✹ O que é o sistema imunológico?

É um conjunto de mecanismos de defesa contra elementos nocivos (antígenos) provenientes de micro-organismos (vírus, bactérias, fungos), tumores, toxinas peptídicas, etc. Ele funciona com base em componentes celulares e moleculares (humorais).

Recentemente disponibilizamos os resultados deste estudo, o qual uniu imunologia e genômica viral para entender o mecanismo de reinfecção pelo vírus SARS-CoV-2.🧬🦠

Abaixo segue um pequeno resumo. ⬇️ Como sabemos que o indivíduo foi reinfectado pelo coronavírus SRAS-CoV-2?

A primeira evidência veio de dois testes negativos ao longo de um período de mais de 200 dias entre a primeira e a segunda infecção, como mostrado na linha do tempo abaixo.

@Mon_Torreao @demori Concordo, @Mon_Torrea. Existem médicos jovens que não praticam medicina baseada em evidencia.

Busquei algumas referências sobre o assunto, para entender se a visão de que médico mais experientes são mais propensos a manter práticas ultrapassadas. Achei os textos abaixo. @Mon_Torreao @demori Evidence-based medicine has been widely adopted [...] More experienced doctors may have less familiarity with these strategies and may be less accepting of them.”

news.harvard.edu/gazette/story/…