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THREAD Tests Je voulais donner une image de base de la raison pour laquelle #TestTraceIsolate est si important pour le contrôle de l'épidémie #COVID19 et pourquoi nous devons agir rapidement lors des tests et du suivi des contacts afin de créer une intervention efficace. 1/14
La raison pour laquelle cela est si important est que nous avons la preuve qu'une fraction substantielle de la transmission se produit dans les ~ 2 jours avant l'apparition des symptômes. Chiffre de
@lucaferrettievo
et al (science.sciencemag.org/content/early/…). 2/14
De même, He et al (nature.com/articles/s4159…) estiment que 44% (intervalle de confiance à 95% de 25% à 69%) des événements de transmission se produisent de manière présymptomatique, ces événements se produisant généralement entre 0 et 2 jours avant l'apparition des symptômes. 3/14
Si une personne est infectée, mais pas encore symptomatique, elle n'a aucun moyen de savoir qu'elle peut être contagieuse et ne saura donc pas prendre les mesures de quarantaine appropriées. 4/14
L'identification/isolement des individus présymptomatiques sont essentiels pour limiter la transmission dans une intervention #TestTraceIsolate. Et pour que cela arrive, tout doit passer très rapidement de l'alerte d'un cas confirmé à la mise en quarantaine des contacts. 5/14
Voici un scénario médian dans lequel Alice est infectée au jour 0, mais ne présente pas de symptômes jusqu'au jour 5, bien qu'elle soit infectieuse au jour 3. Cela se traduit par une transmission à Bob au jour 4 et Bob, à son tour, infecte Carol au jour 8 6/14
Pour que #TestTraceIsolate soit efficace, Bob doit être alerté au jour 7 pour quarantaine. Il s'agit d'un calendrier serré. Cela nécessite qu'Alice soit testée le jour 5 lorsqu'elle développe des symptômes et une mise en oeuvre rapide des tests de laboratoire et des alertes. 7/14
Ainsi, nous avons une fenêtre d'environ 48 heures après qu'un cas index ait développé des symptômes pour tester et alerter les contacts. Ceci est très serré, mais réalisé dans les temps, Bob est alerté et mis en quarantaine, nous pouvons rompre le cycle de transmission. 8/14
Le défi ici consiste à faire tester immédiatement une personne présentant des symptômes et à alerter rapidement les contacts. Cependant, la stratégie de base de #TestTraceIsolate a démontré son efficacité si elle est correctement pratiquée 9/14
Nous avons besoin d'un énorme coup de boost pour augmenter la vitesse et l'échelle du traçage des contacts, mais cela ne nécessite pas nécessairement des solutions «numériques». statnews.com/2020/04/15/cor… 10/14
Notre difficulté dans cette stratégie est donc la rapidité et l'interconnection entre test , enquête de traçage, et quarantaine. Nous n avons pas eu de retour de ce qui a été pratiqué par les ARS au stade 2, ni de retour d expérience sur les obstacles et difficultés 11/14
Nous ne connaissons pas la rentabilité en terme de détection de contacts positifs, mais le % de tests positifs chez les symptomatiques fait attendre moins de 10 % de positifs chez les contacts qualifiés (suffisement longs, en milieu clos préférentiellement) 12/14
Cette stratégie est dépendante dans sa mise en oeuvre et dans ses résultats de la densité de circulation virale, mais la concentration territoriale des 3000 cas/ jours évoqués a tracer implique une capacité de test rapprochés territorialement 13/14
et il est probable qu il faille développer d'autres stratégie en zone cluster : dépistage ciblé des principaux groupes vecteurs , par tests salivaires et pooling. (qui aurait aussi un interet hors cluster) 14/14
Ce thread reprend des éléments d un thread de Bedford, que j ai traduit, car il me semble fondamental que chacun intègre les impératifs temporels liés a cette stratégie de traçage, difficile à mettre en oeuvre de façon efficiente.
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