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26 Dec, 5 tweets, 2 min read
J'ai mis à jour mon article avec les essais de phase 3 et une section (en bas) sur la mutation D614G, les variants de SRAS-CoV-2 du UK 🇬🇧 et en Afrique du Sud 🇿🇦

J'ai aussi trouvé des publis intéressants sur les mutations et leurs impacts sur les vaccins

quoidansmonassiette.fr/vaccins-et-cov…
Dans les études préliminaires sur le vaccin de Pfizer, on avait eu une neutralisation de l'infection de 1
6 variants (dont D614G), ce qui laisse penser que celui-ci pourrait avoir un spectre d'efficacité plus large (et pas que sur le virus d'origine de Wuhan) Image
Ici une étude dans Cell qui a évalué l'affinité de liaison au récepteur ACE2 (humain) de 4000 mutants. On voit en rouge que la plupart du temps, ces mutations ne confèrent pas d'affinité plus élevée (quelques exceptions en bleu) Image
Un autre article plus ancien de septembre qui estime que le SRAS-CoV-2
présente une faible variabilité génétique par rapport à d'autres virus et que cela ne devrait pas impact un éventuel vaccin

pnas.org/content/117/38…
Quelques cas du variant anglais ont été détectés et importés au Japon (ils sont en quarantaine)

niid.go.jp/niid/ja/diseas…

Pour en savoir plus sur l'effet de ces mutations sur la réponse immunitaire, il va falloir attendre les résultats des tests en labo

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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
28 Dec
Je trouve ça dommage d'instiller le doute sur une supposition avec un compte à 22k abonnés (cf. les sources en histoire)

J'ai déjà été dans un EHPAD pour un proche et ils leur parlent du vaccin depuis des semaines + flyer d'information et ils en ont bien parlé aux familles
Le soucis est que ce type de propos va être amplifié sur les réseaux en mode "on ne nous dit pas tout"

Quand on creuse, j'ai lu que le Dr Samir Tine, le médecin de Mauricette, a confirmé qu'on a bien demandé son consentement éclairé
Et oui, la mise en scène n'est pas forcément terrible mais de là à laisser penser qu'on "vaccine de force"

La France est en bas dans les intentions des gens d'aller se faire vacciner (44%) vs 81% au Royaume-Uni

On n'était déjà pas très haut dans le dernier sondage de Nature 59% ImageImage
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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
28 Dec
Point sur les réactions anaphylactiques et vaccin :
▪️ Événement ultra-rare
Aux USA 🇺🇸 au 19 Décembre : 6 cas d'anaphylaxie sur 272 000 doses administrées, soit 0,002%

Au Royaume-Uni 🇬🇧, plus de 600 000 personnes vaccinées - 2 cas rapportés, soit 0,0003%

▪️ Coupable : le PEG ? Image
Aujourd'hui, plus de 2 millions de personnes ont reçu une dose de vaccin à ARNm : pas de signalements particuliers

Il est très facile de rapporter un événement indésirable :
vaers.hhs.gov/esub/index.jsp
Il y aura la même chose sur le site de l'ANSM en France ImageImage
Pour rappel, dans l'essai clinique de phase III sur 37 000 sujets : 1 réaction anaphylactique dans CHAQUE groupe (contrôle et vaccin)
✅ Pas de déséquilibre particulier entre les groupes

Composé suspecté lié aux réactions allergiques : le PEG qui permet de stabiliser les LNPs Image
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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
26 Dec
Interviewé sur LCI par @IderNabili

"Restons prudents, les tests avec des anticorps sur ce nouveau variant sont en cours de réalisation, afin de voir s'ils neutralisent l'infection, ou non"
lci.fr/sante/covid-19…
"Toutefois, une publication sur le vaccin de Pfizer montrait qu'il avait été testé sur différents variants du Covid-19 - pas celui du Royaume-Uni ni d'Afrique du Sud - et le vaccin restait efficace. C'est plutôt rassurant." Image
La relation observé au Royaume-Uni entre une proportion accrue du variant VOC 202012/01 et un R plus élevé (transmission), c'est une relation observée mais qui pourrait être expliquée par d'autres facteurs Image
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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
22 Dec
Thread sur le variant en Afrique du Sud 🇿🇦

La nouvelle lignée #SARSCoV2 (501Y.V2) est caractérisée par 8 mutations définissant la lignée dans la protéine de pointe, dont trois à dans le domaine de liaison au récepteur (K417N, E484K et N501Y)

N501Y est commune au variant du UK
La 2ème vague épidémique de SRAS-CoV-2 en Afrique du Sud a commencé vers octobre 2020. Le
le nombre de reproduction effective estimé du pays, Re, est passé à plus de 1 à la fin de Octobre, indiquant une épidémie croissante

EC Eastern Cap
WC Western Cap
KZN KwaZulu-Natal
Dans ce préprint, 2 589 génomes ont été analysés entre le 5 Mars et le 25 novembre 2020. Début Novembre, la lignée 501Y.V2 (en ROSE) avait remplacé la lignée 3 principales lignées sud-africaines (B.1.1.54, B.1.1.56 et C.1) qui circulaient pendant la 1ère vague épidémique
Read 14 tweets
Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
22 Dec
Dernier briefing de l'OMS : les rapports préliminaires du Royaume-Uni indiquent que le variant est plus transmissible avec une augmentation estimée entre 40% et 70% de la transmissibilité (ajoutant 0,4 au nombre de reproduction de base R0, l'amenant à une fourchette de 1,5 à 1,7)
Des études en laboratoire sont en cours pour déterminer si ces variants ont des propriétés biologiques différentes ou modifient l'efficacité du vaccin

Des enquêtes épidémiologiques sont en cours pour évaluer davantage la transmissibilité, la gravité de l'infection
Il n'y a pas suffisamment d'informations à l'heure actuelle pour déterminer si cette variante est associée à une modification de la gravité de la maladie clinique, de la réponse anticorps ou de l'efficacité du vaccin

who.int/csr/don/21-dec…
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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
21 Dec
🇿🇦 L'ECDC écrit que le variant 501.V2 d'Afrique du Sud contient 3 mutations sur le site de liaison au récepteur (RBD) dont une mutation commune N501Y (commune à celui du UK) et plusieurs mutations sur la protéine Spike

Rapport intéressant
ecdc.europa.eu/sites/default/…
🇿🇦 501.V2 est associé à une charge virale plus élevée (hypothèse : associé à une transmission plus élevée) comme pour le variant anglais

fr.scribd.com/document/48861…
🇬🇧 Le variant anglais VUI 202012/01 a été identifié dans des séquences datant de Novembre 2020 du Danemark et en Australie laissant penser qu'une propagation internationale a déjà commencé + des cas signalés de ce variant aux Pays-Bas et en Belgique
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