Luka Renko Profile picture
27 Dec, 18 tweets, 9 min read
Part III: kakšne so želje @sledilnik za 2021.

V Part I in II smo opisali trenutno stanje, v tej niti pa bom povzel naše želje po podatkih, ki smo jih izrazili že za projekt COVID vigilance.

Resnično si želimo, da te podatke uredimo za 2021.
1/15
Trenutno si vsi želijo podatke od cepljenju.

Verjamemo, da bomo te podatke lahko v sumarni obliki dobili od @NIJZ_pr preko že znanega eRCO sistema.

Ampak nas najbolj zanimajo predvsem podatki o testiranju in novih primerih...
2/15
nijz.si/sl/elektronski…
Podatki o testiranih po starosti in spolu, občini, skupinah (zdravstvo, DSO zaposleni, DSO oskrbovanci, šolstvo, podjetja...) in razlogu za test (simptomi, asimptomatski, ponovitveni, prihod iz tujine...).

Primer iz Nove Zelandije. 3/15
health.govt.nz/our-work/disea…
Tako bi bolje zastopili koliko se testira posamezne skupine in iz kje izhajajo novi primeri. Šele potem bi bili podatki o deležu pozitivnih na posamezni skupini res zanimivi.

Za antigenske teste rabimo podatke ločene tudi po tipu/proizvajalcu testa. 4/15
gov.si/assets/ministr…
Želeli bi si tudi podatke po posameznem laboratoriju, vstopni točki in/ali odvzemnem mestu saj bi lahko bolje zaznavali lokalne izbruhe in povečanja priliva novih primerov.

Do 2.12. smo imeli podatke vsaj za posamezne PCR laboratorije, žal pa te razdelitve nimamo več. 5/15
Čas od pojavitve simptoma do potrditve (poz.test). Tudi čas od os.zdravnika, brisa, rezultata testa do epidemiološke obravnave. Za vstopno točko.
Tako bi zastopili kako učinkovit je odvzem, testiranje in sledenje.
Že potrditev na dan simptoma bi izboljšala napovedne modele. 5/15
Preden se odprejo šole, želimo da @MIZS_RS začne poročati o okužbah in karantenah po razredih in po posameznih šolah. Šole to že poročajo ministrstvu, samo ti podatki se ne objavljajo.
Ljudje pa potrebujemo lokalizirano informacijo za oceno tveganja. 6/15
Potrjeni primeri po posameznem DSO, ločeno na oskrbovance in zaposlene. Te podatke smo delno prejemali do 11.10. po tem pa ne več.
S temi podatki bi lahko bolje ocenili rizike v posamezni občini: trenutno en DSO lahko prikaže občino bistveno slabše kot je v resnici. 7/15
Potrjeni primeri po drugih žariščih (podjetja, organizacije, dogodki, klastri...) in lokacijah okužbe.

NIJZ nekaj teh podatkov podaja na sumarni ravni, ampak samo tedensko.

Takšni podatki bi bili lahko uporabni tudi za analize učinkovitosti ukrepov (sprememba trenda). 8/15
Podatki o izdanih predlogih za karanteno, po možnosti tudi podatki o številu predlogov na posamezni primer.

Tako bi zastopili kako velike potencialne super prenašalce imamo in koliko potencialno rizičnih smo umaknili iz obtoka.

To je žal mogoče šele, ko imamo epi.sledenje. 9/15
Za vsakega hospitaliziranega bi si želeli podatke o spolu, starosti in občini.

Tako bi lahko ocenili kakšen delež potrjenih primerov rabi hospitalizacijo in glede na starostne skupine in dejanske podatke vgradili precej boljše predpostavke v napovedne modele. 10/15
Za poročanje po bolnišnicah (COVID in negovalne) ter oddelkov intenzivne terapije pa bi si želeli, da se poročajo podatki o prehodih med oddelki (sprejem, odpust, umrli): negovalni, akutni, EIT.
Število dni na posameznem oddelku za ozdravljene (odpust) in umrle. 11/15
Pa še nekaj malenkosti:

Poročanje o umrlih bi si ponovno želeli po občinah - od 13.12. dobivamo poročilo samo po regijah, zato ne moremo več osveževati podaktov na posamezni občini. 12/15
Oceno za aktivne primere na @sledilnik trenutno delamo sami na podlagi priporočika ECDC.

Ocena se razlikuje od @NIJZ_pr ocene, ker so tam odšteti tudi novi primeri, ki so umrli prvih 14 dneh. Ker mi tega podatka nimamo, bi želeli celotno zgodovino za aktivne in prebolele. 13/15
Vem, da smo prepozni, da bi želje napotili na Božička, zato upamo, da jih slišijo odgovorni in nas mogoče že v kratkem razveselijo s kakšnim novim podatkovnim virom.

V 2021 bomo na @sledilnik dodajali samo še strojno berljive vire. Za ročno delo počasi zmanjkuje energije. 14/15
Hvala vsem v zdravstvu, DSO in javni upravi, ki zastopite pomen dostopa do odprtih podatkov in pomena le-teh za uspešno obvladovanje epidemije.

Verjamem, da bomo v 2021 še bolj uspešno sodelovali in da skupaj obrnemo trend.

Srečno 2021 in ostanite zdravi! 15/15
Povezava na Part II: o luči na koncu tunela 👇🧵

Povezava na Part I: osmrtnica eni GSheet tabeli👇🧵

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with Luka Renko

Luka Renko Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @LukaRenko

26 Dec
Part II: prvo upanje na strojno berljive podatke so bila poročila @MinZdravje po zdravstvenih domovih.

To je bilo prvo dnevno poročilo, ki ni šlo več v GSheet ampak je bilo avtomatsko (z malo hevristike) predelano v CSV obliko (zahvala @jurijbajzelj). 1/12
Žal smo hitro ugotovili, da različni ZD različno zbirajo podatke, zato je bilo dovolj šuma in neskladij.

Iz tega razloga smo podatke sicer uvrstili na graf, ampak jih kazali samo po regijah. So pa to edini podatki o testiranjih po regijah, pa čeprav ne zelo zanesljivi. 2/12
Odprtje šol se je začelo po pričakovanjih: posamezne okužbe, karantene po razredih...
@MIZS_RS je v par tednih vzpostavilo poročanje šol, kumulativne podatke pa celo delilo preko API vmesnika: api.mizs.si/stats/

@StefanBaebler je uredil zajem za GitHub arhiv 3/12
Read 14 tweets
25 Dec
In memoriam: danes smo dokončno upokojili GSheet tabelo iz katere je nastal @sledilnik.

Postala je prevelika (272k polj) in prepočasna za resno delo, predvsem pa smo v večjem delu končno prešli na strojno obdelavo podatkovnih virov. 1/14

tinyurl.com/sledilnik
Nastala je 11. marca (en teden po prvem primeru v Slo).

Že prvi dan sem GSheet delil kot odgovor na nekaj Twitter in Facebook diskusij o COVID-19 v Sloveniji. 2/14
Ker so bili od začetka omogočeni komentarji tudi anonimnežem, so kmalu sledili pozivi za prispevek posameznikov in pa prve diskusije ob posameznih primerih od posameznikov iz cele Slovenije. V par dneh je preko 30 ljudi prispevalo podatke z viri iz lokalnih medijev. 3/14
Read 15 tweets
14 Dec
Vem, da ne vem kako se bo to končalo. Me pa zelo skrbi.

Večino ukrepov smo sprejeli skoraj dva meseca nazaj, ko smo v bolnišnici imeli 265 bolnikov in 50 na intenzivni terapiji. Od takrat smo poleteli v višave in v njih žal tudi ostali. 1/8
V bolnišnicah smo že 5 tednov na robu: včeraj smo imeli 1315 bolnikov in 201 v intenzivni terapiji.

Vsak dan sprejmejo v povprečju 120 novih pacientov - toliko postelj se mora sprostiti, saj drugih ni.

Osebje je izčrpano - oni res potrebujejo sprostitev. 2/8
Naše obnašanje ni spremenilo trenda. Nekateri se obnašajo popolnoma neodgovorno, vsi pa smo predvsem utrujeni.

Zaradi utrujenosti smo trenutne visoke številke sprejeli kot novo normalnost. Kar pa je zelo nevarno. 3/8

Read 8 tweets
8 Dec
A še kdo ne zastopi tega načina komunikacije znotraj @vladaRS?
En minister pošlje drugemu dopis o predlogu popolne zapore gospodarstva, ta naj bi mu nazaj odgovoril s sklicem na referenco, vendar se raje odloči, da bo šel v TV oddajo in tam povedal, da ima drugačno mnenje. 1/4
To se dogaja 4 dni po tem kot je PV preko tviterja sporočil kriterije za sproščanje in od takrat se vsi prebivalci pogovarjajo samo še o tem.
Pri 1500 novih primerih na dan in strašljivem vsakodnevnem računu.
A bi se lahko najprej zmenili kaj hočemo povedati prebivalcem?
2/4
Prekinitveno zaporo (circuit breaker lockdown) potrebujemo že od 8. oktobra, ko smo izbubili epidemiološko sledenje stikov.
Od takrat je širjenje virusa popolnoma prosto v populaciji, popolnoma prepuščeno obnašanju posameznikov.
medium.com/sledilnik/kako… 3/4
Read 4 tweets
28 Nov
Ker so umrli trenutno glavna tema ne smemo pozabiti, da so samo (zelo strašen) pogled v vzratno ogledalo na upostošenje, ki smo ga povzročili z našo prehitro in objestno vožnjo.
Žal še vedno vozimo 200 km/h po mestu.
Namesto, da bi nas strašen pogled na opustošenje za nami prepričal, da hitro zmanjšamo hitrost, mi samo občasno pritisnemo zavoro. Kot da nas je pri odločnem pritisku na zavoro presenetil ABS in smo spustili pedal, namesto, da bi vsi skupaj pritisnili do konca (kot v 1.valu).
Žal za nami ne puščamo samo umrle, ampak ogromno dela nalagamo tudi zdravstvenemu osebju - ta je že davno na (čez?) robu svojih zmogljivosti. Se zavedamo kaj pomeni sprejeti 160 oseb na dan? Kje najti postelje za njih? A jih uspemo vsak dan sprostiti dovolj za vse?
Read 8 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!