Luka Renko Profile picture
26 Dec, 14 tweets, 12 min read
Part II: prvo upanje na strojno berljive podatke so bila poročila @MinZdravje po zdravstvenih domovih.

To je bilo prvo dnevno poročilo, ki ni šlo več v GSheet ampak je bilo avtomatsko (z malo hevristike) predelano v CSV obliko (zahvala @jurijbajzelj). 1/12
Žal smo hitro ugotovili, da različni ZD različno zbirajo podatke, zato je bilo dovolj šuma in neskladij.

Iz tega razloga smo podatke sicer uvrstili na graf, ampak jih kazali samo po regijah. So pa to edini podatki o testiranjih po regijah, pa čeprav ne zelo zanesljivi. 2/12
Odprtje šol se je začelo po pričakovanjih: posamezne okužbe, karantene po razredih...
@MIZS_RS je v par tednih vzpostavilo poročanje šol, kumulativne podatke pa celo delilo preko API vmesnika: api.mizs.si/stats/

@StefanBaebler je uredil zajem za GitHub arhiv 3/12
Žal pa @MIZS_RS ni delilo podatkov po posameznih šolah. 🤷‍♂️

Ravno to pa ljudi najbolj potrebujejo, da lahko ocenijo rizike.

Zato smo se ponovno lotili crowdsourcing zbiranja podatkov o okužbah in karantenah po posameznih šolah. 4/12
Aplikacijo #OstaniZdrav smo spremljali od začetka preko medijskih objav in z uporabi scrapinga podatkov in zalednege strežnika (zahvala @StefanBaebler).

Kasneje je @mju_RS nekatere podatke delil preko #opendata portala. 5/12
podatki.gov.si/dataset/statis…

Podatki so bili zelo tehnični zato smo pripravili razlago o aplikaciji (hvala @majazalozznik in ekipa) in poskrbeli za podnapise z razlago pod grafi.

Žal je bilo uporabnikov (pre)malo in izdaja TAN kode premalo ušinkovita za eksponentno rast... 6/12
Oktobra je @MinZdravje prešlo na zbiranje bolnišničnih podatkov na presečno uro 8:00 (da je bilo usklajeno z ICU poročili).

Žal pa se je format poročila toliko spreminjal, da ni bil primeren za strojno obdelavo (uvoz)... 7/12
Zaradi obremenitve enot intenzivne terapije je @majazalozznik v imenu @sledilnik prevzela zbirno poročilo za ICU.

Vsi oddelki IT so začeli poročati v standardizirani XLS tabeli, ki je imela kontrolna polja za zanesljivost vnosa, mi pa smo pripravili zbirno poročilo. 8/12
V decembru je IMI poslal še zadnje zbirno poročilo o PCR testiranju po laboratorijih. 👏

Zaradi priprave na hitre antigenske teste je poročanje namreč prešlo na @NIJZ_pr, kjer so prešli tudi na nov informacijski sistem, ki bo kasneje omogočil strojni izvoz podatkov. 9/12
13.12. je @NIJZ_pr prešel na novo poročanje (dnevno, tedensko), ki je bilo v strojno pripravljeni XLS datoteki (👏 @pucciami).

@jurijbajzelj je spet zavihal rokave in v dobrem tednu predelal dnevna in tedenska poročila na avtomatski uvoz. 10/12
25.12. smo tako dokončno preklopili na avtomatizirano obdelavo NIJZ poročil.
Podatke o testiranju žal dobivamo samo kumulativno (4 številke na dan) tako da ostaja v (novem) GSheet, model obravnave hospitaliziranih in EIT pa zaradi kompleksnosti ostaja v (novem) GSheet. 11/12
Majhen korak za podatke, velik korak za @sledilnik podatkovno ekipo!

👏🙇‍♂️ @majazalozznik @jurijbajzelj @StefanBaebler @romunov @overlord_tm @MihaMarkic @miha_kadunc @miaerbus @fearless_bass @BojanKosir VladimirN GašperM TanjaA...

Se nadaljuje... 12/12
In še posebna zahvala: @MarusaGorisek je prevzela urejanje ukrepov na grafu (saj jih noben več ni uspel slediti), zraven pa uredila tudi GSheet z vsemi trenutno veljavnimi ukrepi iz katerih se gradi tale stran:
covid-19.sledilnik.org/sl/restrictions
12+/12+

• • •

Missing some Tweet in this thread? You can try to force a refresh
 

Keep Current with Luka Renko

Luka Renko Profile picture

Stay in touch and get notified when new unrolls are available from this author!

Read all threads

This Thread may be Removed Anytime!

PDF

Twitter may remove this content at anytime! Save it as PDF for later use!

Try unrolling a thread yourself!

how to unroll video
  1. Follow @ThreadReaderApp to mention us!

  2. From a Twitter thread mention us with a keyword "unroll"
@threadreaderapp unroll

Practice here first or read more on our help page!

More from @LukaRenko

27 Dec
Part III: kakšne so želje @sledilnik za 2021.

V Part I in II smo opisali trenutno stanje, v tej niti pa bom povzel naše želje po podatkih, ki smo jih izrazili že za projekt COVID vigilance.

Resnično si želimo, da te podatke uredimo za 2021.
1/15
Trenutno si vsi želijo podatke od cepljenju.

Verjamemo, da bomo te podatke lahko v sumarni obliki dobili od @NIJZ_pr preko že znanega eRCO sistema.

Ampak nas najbolj zanimajo predvsem podatki o testiranju in novih primerih...
2/15
nijz.si/sl/elektronski…
Podatki o testiranih po starosti in spolu, občini, skupinah (zdravstvo, DSO zaposleni, DSO oskrbovanci, šolstvo, podjetja...) in razlogu za test (simptomi, asimptomatski, ponovitveni, prihod iz tujine...).

Primer iz Nove Zelandije. 3/15
health.govt.nz/our-work/disea…
Read 18 tweets
25 Dec
In memoriam: danes smo dokončno upokojili GSheet tabelo iz katere je nastal @sledilnik.

Postala je prevelika (272k polj) in prepočasna za resno delo, predvsem pa smo v večjem delu končno prešli na strojno obdelavo podatkovnih virov. 1/14

tinyurl.com/sledilnik
Nastala je 11. marca (en teden po prvem primeru v Slo).

Že prvi dan sem GSheet delil kot odgovor na nekaj Twitter in Facebook diskusij o COVID-19 v Sloveniji. 2/14
Ker so bili od začetka omogočeni komentarji tudi anonimnežem, so kmalu sledili pozivi za prispevek posameznikov in pa prve diskusije ob posameznih primerih od posameznikov iz cele Slovenije. V par dneh je preko 30 ljudi prispevalo podatke z viri iz lokalnih medijev. 3/14
Read 15 tweets
14 Dec
Vem, da ne vem kako se bo to končalo. Me pa zelo skrbi.

Večino ukrepov smo sprejeli skoraj dva meseca nazaj, ko smo v bolnišnici imeli 265 bolnikov in 50 na intenzivni terapiji. Od takrat smo poleteli v višave in v njih žal tudi ostali. 1/8
V bolnišnicah smo že 5 tednov na robu: včeraj smo imeli 1315 bolnikov in 201 v intenzivni terapiji.

Vsak dan sprejmejo v povprečju 120 novih pacientov - toliko postelj se mora sprostiti, saj drugih ni.

Osebje je izčrpano - oni res potrebujejo sprostitev. 2/8
Naše obnašanje ni spremenilo trenda. Nekateri se obnašajo popolnoma neodgovorno, vsi pa smo predvsem utrujeni.

Zaradi utrujenosti smo trenutne visoke številke sprejeli kot novo normalnost. Kar pa je zelo nevarno. 3/8

Read 8 tweets
8 Dec
A še kdo ne zastopi tega načina komunikacije znotraj @vladaRS?
En minister pošlje drugemu dopis o predlogu popolne zapore gospodarstva, ta naj bi mu nazaj odgovoril s sklicem na referenco, vendar se raje odloči, da bo šel v TV oddajo in tam povedal, da ima drugačno mnenje. 1/4
To se dogaja 4 dni po tem kot je PV preko tviterja sporočil kriterije za sproščanje in od takrat se vsi prebivalci pogovarjajo samo še o tem.
Pri 1500 novih primerih na dan in strašljivem vsakodnevnem računu.
A bi se lahko najprej zmenili kaj hočemo povedati prebivalcem?
2/4
Prekinitveno zaporo (circuit breaker lockdown) potrebujemo že od 8. oktobra, ko smo izbubili epidemiološko sledenje stikov.
Od takrat je širjenje virusa popolnoma prosto v populaciji, popolnoma prepuščeno obnašanju posameznikov.
medium.com/sledilnik/kako… 3/4
Read 4 tweets
28 Nov
Ker so umrli trenutno glavna tema ne smemo pozabiti, da so samo (zelo strašen) pogled v vzratno ogledalo na upostošenje, ki smo ga povzročili z našo prehitro in objestno vožnjo.
Žal še vedno vozimo 200 km/h po mestu.
Namesto, da bi nas strašen pogled na opustošenje za nami prepričal, da hitro zmanjšamo hitrost, mi samo občasno pritisnemo zavoro. Kot da nas je pri odločnem pritisku na zavoro presenetil ABS in smo spustili pedal, namesto, da bi vsi skupaj pritisnili do konca (kot v 1.valu).
Žal za nami ne puščamo samo umrle, ampak ogromno dela nalagamo tudi zdravstvenemu osebju - ta je že davno na (čez?) robu svojih zmogljivosti. Se zavedamo kaj pomeni sprejeti 160 oseb na dan? Kje najti postelje za njih? A jih uspemo vsak dan sprostiti dovolj za vse?
Read 8 tweets

Did Thread Reader help you today?

Support us! We are indie developers!


This site is made by just two indie developers on a laptop doing marketing, support and development! Read more about the story.

Become a Premium Member ($3/month or $30/year) and get exclusive features!

Become Premium

Too expensive? Make a small donation by buying us coffee ($5) or help with server cost ($10)

Donate via Paypal Become our Patreon

Thank you for your support!

Follow Us on Twitter!