La mutation N501Y correspond à une substitution de l'acide aminé asparagine Asn501 (N) par une tyrosine Tyr501 (Y) à la 501è position des acides aminés de la protéine Spike
Des chercheurs ont créé un variant avec la mutation N501Y (substitution surlignée en jaune sur le schéma)
Ils ont pris le sérum contenant des anticorps de 20 individus vaccinés (il y a 2-4 semaines) et ils ont mis ces anticorps sur une suspension virale pour voir si ceux-ci arrivent à neutraliser le mutant 501Y. C’est un test de séroneutralisation par réduction des plages de lyse
La solution d’anticorps, à tester est diluée et mélangée à une suspension virale. Le tout est ensuite incubé, afin de permettre à l’anticorps de réagir avec le virus, puis réparti sur une culture cellulaire de l’hôte du virus
Chaque virus qui déclenche une infection productive produit une zone localisée d’infection (une plaque), qui peut être détecté de diverses manières. Les plaques sont comptées et comparées à la concentration initiale du virus pour déterminer la réduction en % de l’infectivité
La concentration de sérum nécessaire pour réduire le nombre de plaques de 50% (PRNT50) par rapport au virus seul donne la mesure de la quantité d’anticorps et de leur efficacité
Ici cette concentration nécessaire est la même pour le SRAS-CoV-2 avec N501 ou Y501
Ils ont calculé le ratio Y501/N501 des titres d'anticorps nécessaires pour une réduction de 50% des plaques infectées. Plus le ratio est proche de 1, plus ça indique qu'il n'y a pas de différence de réponse entre les deux variants
Ici Ratio=1,46
Même efficacité du vaccin
Une des limites de ce petit test en préprint (NOT PEER-REVIEWED) n'a testé qu'une seule mutation et n'a pas inclus les 23 mutations du variant B.1.1.7 (appelé VOC 202012/01)
⚠️ ça peut marcher pour 16 mutations différentes et ne pas marcher pour une 17è
Cependant les essais antérieurs ont montré qu'on avait une réponse immunitaire ciblant plusieurs parties de la protéine Spike comme je vous en avais parlé dans mes précédents tweets
Le test n'a pas été fait sur la mutation E484K spécifique du variant Sud-Africain
Le nombre de cas qui décolle au Royaume-Uni avec le variant B.1.1.7 plus transmissible
🇩🇰 Au Danemark, la surveillance génomique montre qu'on est passé de 0.2% de présence de B.1.1.7 début décembre à 2.3%, 3 semaines plus tard
🇮🇪 En Irlande, il représente 25% des séquences
Carte intéressante qui montre la différence du nombre de reproduction R parmi les cas atteints du variant et ceux non-atteint par le variant B.1.1.7
Zone orange : transmission plus importante pour le variant B.1.1.7
Zone verte : transmission plus importante chez les non-B.1.1.7
🇺🇸 Estimation pour la proportion du variant anglais aux Etats-Unis : autour de 0.5% parmi les patients avec un CT de RT-PCR inférieur à 25 (une des limites pour la représentativité de l'échantillon)
Figure mettant en relation les mutations sur la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 présentes chez l'Homme/les animaux🐈
🔴Variant du Royaume-Uni
🔵Variant Sud-africain
🟣Variant UK/SA
🟡Variants animaux
Les mutations RBD sont à surveiller
RBD= domaine de liaison au récepteur ACE2
Elles peuvent favoriser l'évasion immunitaire et des transferts interspécifiques
Par exemple, la mutation N501T est commune au vison et au furet. La mutation N501Y est présente chez l'Homme et chez la souris 🐁 virological.org/t/mutations-ar…
L'ANSES avait fait un point sur les transferts interspécifiques :
🐔🦃🦆🐄🐖 Non sensibles, ni réceptifs au SARS-CoV-2
🐇🦮+ furet : Réceptifs mais sensibilité à confirmer ?
🐈🐹Réceptifs et sensibles (pas de transmission vers l'homme)
Visons : transmission possible vers l'Homme
24 millions d'habitants et pas un cas local de COVID-19 en huit mois !
Comment expliquer ça ?
✅Transparence
✅Inclusion
✅Réactivité
✅Anticipation
Vidéo sur les différentes politiques de santé publique mises en place en Asie :
1- Forte expérience avec le SRAS et le H1N1, ce qui a permis à Taïwan d'avoir une excellente coordination entre le centre dédié Central Epidemic Command Center ré-activé, les collectivités territoriales et des citoyens
vs peu de coordination européenne avec l'ECDC
2- Adaptation très rapide des infrastructures :
- indépendance dans la production des masque en passant de 2 à 23 millions de masques produits dès le 31 janvier ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P…
- mise au point de test de dépistage très rapidement par l'ITRI
Je trouve ça dommage d'instiller le doute sur une supposition avec un compte à 22k abonnés (cf. les sources en histoire)
J'ai déjà été dans un EHPAD pour un proche et ils leur parlent du vaccin depuis des semaines + flyer d'information et ils en ont bien parlé aux familles