イギリスの変異株について、イギリス政府からのテクニカルレポート第三弾が出ていますね👶
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl…
接触調査の解析がでてきました👶
「Secondary attack rates estimated from contact tracing data are observed to be higher where the index case has the variant strain, from around 11% to 15% of named contacts」として、二次感染率が変異なしで11%程度、変異ありで15%程度であると。
過去のブリーフィング資料と、今回の解析のデータセットが見られる、元のページはここね👶
gov.uk/government/pub…
そうそう UpToDate の変異に関する部分の書き方は冷静ですき👶
uptodate.com/contents/coron…
JAMANetwork👶新型コロナウイルスSARS-CoV-2の変異について端的にまとまっている。
Genetic Variants of SARS-CoV-2—What Do They Mean? ja.ma/3hZar4G @JAMA_current part of @JAMANetworkより

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9 Jan
はい、ごくごく簡単に(実は正確に説明すると大変な部分が多いので)説明いたします👶
ウイルスにおける「種」や「株」などの用語。
生物学的には、「種」(species)というのは様々な定義の仕方(交配して増えられる物など)がありますが、生物分類上の基本単位になります👶(Wiki を参考に)
例えばヒトは、ヒト科ヒト亜科ヒト属ホモ・サピエンス種であり一種です。

ja.wikipedia.org/wiki/%E7%A8%AE…
ただ、この「生物学の種」をウイルスにそのまま当てはめるのではなく、ウイルスについてはちょっと特別に分類がなされています👶(Wiki を参考に)
ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%A6…
Read 21 tweets
6 Jan
【速報・在米大使館情報】ワシントンD.C. 全域に対し、本日午後6時から明日午前6時まで、外出禁止令が発令されました👶mayor.dc.gov/release/mayor-…
大使館から気をつけるようにメールあり👶D.C.関係のメーリングリストも緊迫気味。職場からも注意喚起あり。今回の暴動はかなり大きい。
CNN を見ながら紅茶を飲む…👶これは結構大きい暴動だなぁ…
Read 6 tweets
1 Jan
変異ウイルスが怖い!もっと警告しなくてよいの?というマシュマロが来ていますが…慎重に見ています👶今回のファーガソン博士は「ロックダウン教授」と呼ばれていますが、これまでしてきた予測や推測、結構…「外れて」いますし、数理モデリングだけで強くモノを言うのは結構危ういと思っています。
もちろん、リスクに対するマージンの取り方として、対策を強化するのは大事ですが、変異ウイルス「だから」というのは言い過ぎないことも重要と思っています👶流行がひろがっている「から」対策強化でしょう。
変異ウイルスに対しても、なんども繰り返しますが、個人レベルでの予防の対策は変わりません👶しっかり予防すること、接触を減らすことが大事ですよね。これは流行拡大していれば当然ですね。
Read 5 tweets
1 Jan
WHO のページに大晦日付で変異ウイルス(variant)についてのわかりやすいサマリーが出ています👶
who.int/csr/don/31-dec…
新型コロナウイルス SARS-CoV-2 の変異が、感染のひろがりやすさ、臨床症状、重症度(致死率)にどのような影響を及ぼすか、診断、治療、ワクチンにどう影響を与えるかを定期的に評価しているよ、ということですね👶
2020年1月下旬から2月に出現した D614G 変異についてまず触れています👶このD614Gは中国武漢の最初のウイルスに急速に取って代わりましたね。細胞と動物モデルの研究でも、「感染性」が上がることなどが複数の研究で示されました。
Read 26 tweets
30 Dec 20
I think it is not appropriate for a scientist to "argue" in the atmosphere without defining the terms properly👶
I think it is a kind of agitator. I strongly believe that this is an unacceptable attitude for an information provider.
This is a collection of tips from the WHO on vaccine reporting, but I think it can be applied to all scientific reporting and scientific information dissemination, not just vaccines👶
who.int/news-room/feat…
Are you easily using terms like "airborne" without defining them? In order to convey a concept accurately, the term needs to be well defined👶 I don't know the definition of "aerosol infection", but it can be defined without dividing by particle size. Let's define the term!
Read 13 tweets
28 Dec 20
夏頃にすごく話題になった新型コロナウイルスのスパイクタンパク質の変異である D614G について、今回の変異についての解析も熱心にしているイギリスのグループから論文が出ているのよね👶Cell
cell.com/cell/fulltext/…
Growth rate の差などもみられるものの、感染の広がりやすさには関連していない模様。ただし、ウイルスのコピー数が多いこと、若い人により感染していることが見られる、としていますね👶
この論文の後にはこのような論文も出ています👶
No evidence for increased transmissibility from recurrent mutations in SARS-CoV-2
Nature Communications volume 11, Article number: 5986 (2020)
…nature-com.ezproxy.nihlibrary.nih.gov/articles/s4146…
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