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17 Jan, 5 tweets, 3 min read
Par rapport aux remarques sur la persistance virale

L'étude initiale s'appuie sur la guérison virologique au 6ème jour comme on le voit ici

Ce qui est très critiquable est que les données aux jours 7 et 14 ne sont pas dévoilées comme indiqué dans le protocole à droite
Lien vers le protocole : clinicaltrialsregister.eu/ctr-search/tri…

Nouvelle surprise, on voit dans la lettre dans la ré-analyse sur les 42 patients (en intention de traiter), on a un jour 7 qui apparaît et on ne voit plus de différence à J4 et J7
Si on est pointilleux et qu'on applique la correction des tests multiples (puisque le test statistique est répété à chaque jour), on descend le seuil de significativité à p=0.01 pour 5 tests

J3 : pas de différence entre les groupes traités vs contrôles pour la PCR
Clairement la conclusion est encore moins certaine pour la persistance virale (déjà que l'essai comporte de nombreux autres biais qui fait qu'on ne peut absolument rien en conclure)... Rien de nouveau sous le soleil mis à part que c'est embêtant de ne pas avoir publié J7 et J14
En fait la table de la lettre n'est pas très claire pour dire si on a 2 décès (ou 1 décès et 1 soin intensif) dans les groupes traités à l'hydroxychloroquine

vs

0 dans le groupe contrôle

La taille de l'essai est tellement petit que tous les résultats pourraient être du hasard

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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
17 Jan
Live-Tweet
A regarder sur #M6 : retour sur les études et la médiatisation, l'emballement sur l'hydroxychloroquine

Le Prof Frits Rosendaal, Université de Leiden éminent épidémiologiste avait demandé la rétractation de l'étude de l'IHU (Gautret et al.)

ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P… ImageImage
Conclusion du rapport demandé par l'International Society of Antimicrobial Chemotherapy

"Il s'agit d'un manuscrit non informatif avec de grosses lacunes méthodologiques. Les résultats ne justifient pas les conclusions de grande portée sur l'efficacité de l'HCQ pour la COVID-19
Dans cette étude comportant de nombreux problèmes méthodologiques : un flagrant est le fait de ne pas publier les résultats aux jours 7 et 14 Image
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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
17 Jan
Plutôt une bonne nouvelle 🙂

Les sérums d'individus (contenant des anticorps) qui ont été infectés par B1.1.7 (variant "anglais") montrent une activité neutralisante contre les virus de d'autres lignées, et l'inverse est également vrai (niveau de confiance modéré - élevé) Image
Il existe des preuves cohérentes d'une activité de neutralisation croisée dans les sérums de convalescence, écrit le dernier rapport de Public Health England

Ce sont des résultats préliminaires

Essai en cours pour tester les anticorps provenant des personnes vaccinés
Le variant B1.1.7 croît mieux dans les cellules humaines épithéliales des voies respiratoires que dans les cellules Véro (cellules épithéliales de rein extraites d'un singe vert africain)
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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
16 Jan
Incroyable !

Le Pr Raoult qui écrit lui-même que leur 1er essai clinique non randomisé montre que l'hydroxychloroquine n'a AUCUNE efficacité sur la mortalité ou pour réduire le transfert en soins intensifs

Pour rappel, cet essai (Gautret et al.) a été cité plus de 3500 fois !
Et cet essai de très petite taille et très critiquable en méthologie a eu un impact mondial sur la recherche sur le covid-19... pour au final arriver à conclure que l'HCQ avec/sans azithromycine n'a pas d'efficacité

Ce fameux protocole qui n'a cessé de changer d'ailleurs...
Vous noterez la sélection des résultats rapportés au Jour 6 dans la publication de Gautret (à gauche) ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P…

Et les résultats rapportés à Jour 7 : non significatif sur la guérison virologique (à droite)
ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P…
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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
15 Jan
J'ai fait une petite analyse des tendances de mobilité (données Google), exprimée en variations (%) par rapport à une période pré-COVID-19

Ici on voit l'effet combiné des vacances de la Toussaint et couvre-feu/confinement : augmentation de la présence des gens chez eux
Chaque point est une variation pour un département
🔵 En bleu : ceux en couvre-feu à 18h depuis le 2 janvier 2021
⚫️ En noir : le reste en couvre-feu à 20h
Il n'y a quasiment pas de différence dans les tendances

On peut noter la variabilité régionale (dispersion des points)
Et que les gens sortent le week-end (moins de gens présents chez eux le samedi dimanche et ni au travail)

Pas de différence pour les lieux de travail comme il y a eu plutôt un assouplissement du télétravail "fortement conseillé"
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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
14 Jan
Point sur l'immunité/#COVIDー19

L'étude SIREN 🇬🇧 sur 20 000 professionnels de santé positifs pour les anticorps au SRAS-CoV-2 a conclus que l'infection confère une protection de 83% par rapport aux ré-infections

La protection durerait au moins 5 mois (l'étude va continuer)
44 réinfections identifiées entre le 18/06 et 24/11 dans le groupe de 6000 personnes déjà infectées une 1ère fois

Bcp de ré-infections sont asymptomatiques

22% de personnes sans 1ère infection étaient asymptomatiques comparées à 66% de personnes avec une infection précédente
La densité d’incidence de l’infection symptomatique dans le groupe précédemment infecté était 1.1 et 13.3 dans le groupe précédemment non infecté par 100.000 jours-personnes, soit environ 8% de personnes susceptibles d’avoir une ré-infection symptomatique
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Thibault Fiolet 🇪🇺 Profile picture
13 Jan
Point sur les variants

Description de la propagation du variant 🇬🇧B.1.1.7
A : Nb de pays signalant le variant
C : Nombre de séquences (log10) par pays du variant
D : Nombre de voyageurs aériens venant de Londres
E : Vols internationaux. Couleurs = date de détection du variant
Au 7 janvier 2021, 45 pays avaient signalé la présence de B.1.1.7 (VOC 202012/01) 🇬🇧

et 13 pays avaient signalé B.1.351/501Y.V2 🇿🇦

Sur ces 45 pays seulement 6 : le Danemark, UK, Islande, Pays-Bas, Australie, Suède font de la surveillance génomique de routine en temps réel !
Le nouveau variant du Brésil 🇧🇷

Le Japon a signalé la présence d’un nouveau variant B.1.1.28 chez quatre voyageurs arrivés au Japon en provenance de l’État d’Amazonas (Brésil) le 2 janvier 2021 qui abrite 10 mutations sur la protéine Spike !

niid.go.jp/niid/en/2019-n…
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