« La compétition entre parasites est un processus plus intuitif. D'une certaine manière, les parasites "consomment" des ressources de leur hôte et si un hôte est infecté par plusieurs parasites, ceux-ci peuvent entrer en compétition pour une même ressource.
(...) Plus frappant, si l'on compare des souches de différentes virulences, on constate que plus une souche est virulente et plus elle gagne la compétition intra-hôte en s'appropriant plus de ressources.
(...) [Si une souche] est virulente et l'autre pas, la virulente se transmettra fortement, la bénigne se transmettra faiblement (...). Dans ce dernier cas, la souche moins virulente est clairement désavantagée (...).
In fine, on s'attend donc à ce que les infections par plusieurs souches favorisent la souche la plus agressive. » — Samuel Alizon, "Évolution, écologie et pandémies"

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25 Feb
Carte du taux d'incidence par département (nombre de cas détectés pour 100 000 habitants sur les 7 derniers jours disponibles, ici du 16 au 22 février).

La France était à 190 jeudi dernier (192 après consolidation), aujourd'hui elle est à 214. Image
Vue relative, pour distinguer le catastrophique du très mauvais. Image
Le taux d'incidence par classe d'âge.

germain-forestier.info/covid/ Image
Read 36 tweets
22 Feb
[Prépublication] Étude de cohorte (SIREN) sur 23 000 soignants au Royaume-Uni. Efficacité du Pfizer contre l'infection (symptomatique ou non) :

• 72% (95% CI 58—86) 21 jours après la première dose
• 86% (95% CI 76—97) 7 jours après la deuxième dose

papers.ssrn.com/sol3/papers.cf…
Ce résultat concerne la cohorte séronégative et sans PCR+ au départ (pas d'infection antérieure détectée, donc).

La souche dominante au moment de l'étude était B.1.1.7.
Leur modèle montre également que la cohorte séropositive avait déjà une protection de 90% (95% CI 88—92%), comparé à la cohorte séronégative, suite à l'infection naturelle.
Read 5 tweets
4 Feb
Carte du taux d'incidence par département (nombre de cas détectés pour 100 000 habitants sur les 7 derniers jours disponibles, ici du 26 janvier au 1er février).

La France était à 211,9 jeudi dernier (212,6 après consolidation), aujourd'hui elle est à 213,3.
Notez l'affaiblissement de la partition Ouest/Est (situation il y a 3 semaines à gauche, aujourd'hui à droite) : le mauvais s'est homogénéisé.
Le taux d'incidence par classe d'âge.

germain-forestier.info/covid/
Read 37 tweets
3 Feb
« Cette étude de jeunes recrues masculines des Marines trouve que la présence d'anticorps au SARS-CoV-2 confère un taux d'incidence de l'infection réduit de 82%. Le % d'infections symptomatiques était comparable entre les participants séro+ et séro- »

medrxiv.org/content/10.110…
« Parmi le groupe des séropositifs, les participants devenus infectés avaient des titres d'anticorps plus bas que les non infectés, et avaient plus de chances de ne pas avoir une activité neutralisante détectable des anticorps. »
« Nos résultats indiquent que quoique les anticorps induits par l'infection soient largement protecteurs, ils ne garantissent pas une immunité effective contre une infection ultérieure »
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2 Feb
« Dans sa foire aux questions, le ministère précise ainsi que les classes de maternelle doivent désormais fermer dès l’apparition du premier cas de Covid-19 parmi les élèves. »

lemonde.fr/planete/articl…
« Les personnels ne seront pas identifiés comme contacts à risque dès lors qu’ils portent un masque grand public de catégorie 1 ou un masque chirurgical »

Ben tiens...
« Dans l’enseignement primaire et secondaire, (...) l’apparition d’un cas confirmé parmi les enseignants ou les élèves n’entraîne pas automatiquement de contacts à risque dans la classe. »
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28 Jan
Carte du taux d'incidence par département (nombre de cas détectés pour 100 000 habitants sur les 7 derniers jours disponibles, ici du 19 au 25 janvier).

La France était à 195,9 jeudi dernier (196,7 après consolidation), aujourd'hui elle est à 211,9.
Vue relative. Ça ne va toujours pas dans le bon sens à l'Ouest.
Le taux d'incidence par classe d'âge.

germain-forestier.info/covid/
Read 19 tweets

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