Thread by @Pr_Logos

1/ Les commentaires sur le (très haut) plateau épidémique qui se maintient par conséquence probable du beau temps et des vacances la semaine dernière occulte l'évolution mesurée, réelle des souches mutantes.

Pour mémoire, les données de test PCR moyennées sur 7 jours.

2/ Car en parallèle, les données sur les trois souches mutantes, obtenues par criblage, montrent l'évolution suivante en proportion du nombre de tests positifs.
L'axe vertical est en % et l'axe horizontal est en jours (1, c'est le 1er janvier, 32, le 1er février, 60, le 1er mars)

3/ Les données proviennent des points hebdomadaires de Santé Publique France, donnant ce type de tableaux. Remarquez la contagion des enfants et des jeunes par la souche B1.1.7=20I/501Y.V1
santepubliquefrance.fr/recherche/#sea…

4/ Maintenant, considérez que ces souches différentes puissent être traitées comme deux épidémies distinctes (comme la gastro et la grippe, disons). En multipliant le nombre de cas par la fraction de souches mutantes, on obtient le nombre de cas de l'épidémie de mutants.

Voilà.

5/ Pour obtenir la courbe, j'ai évidemment été obligé d'interpoler entre les points de mesure en suivant la loi attendue si rigoureusement rien n'est fait pour endiguer la croissance épidémique des souches mutantes.

Voilà la courbe toujours en % vs nombre de jours de 2021.

6/ Alors, vous pouvez essayer de vous rassurer en imaginant que les modèles sont complètement faux, que Macron a raison de "tenter sa chance", qu'un chemin est encore possible vers l'extinction spontanée.

Ca, ce sont des données, pas un modèle. L'épidémie explose depuis 2 mois.

7/ Évidemment, il y a des incertitudes sur certaines mesures par criblage faites au début. Par exemple, ces deux bulletins présentant le résultat du même test flash sont intéressants à comparer.

8/ Non, le covfefeu de 18h ne permet pas d'endiguer les souches mutantes.
Oui, il y a des facteurs météorologiques (liés à la possibilité de passer du temps en plein air, à la dynamique d'évaporation des gouttes en aérosol et à des facteurs biologiques) font de l'effet.
Pas assez

9/ Pour vérification…

Voilà les data que j'ai trouvées pour la France, pour la fraction des trois variants. Avec quelques difficultés pour certains points.

10/ Question subsidiaire.
Y-a-t'il une bizarrerie dans la décroissance de la souche sauvage et de la croissance des souches mutantes?

Voyons. La souche sauvage a décru depuis un mois d'un facteur 2, soit R=0.85.

11/ Les souches mutantes ont cru pendant la même période à R=1.3 ce qui est 1.5 fois plus grand que R=0.85. Cela colle donc parfaitement avec le fait que les souches mutantes sont contagieuses pendant 50% de temps en plus.

12/ L'absence de toute mesure de sécurisation sanitaire non liberticide est d'autant plus rageante qu'on est tout près de la stratégie Zéro Covid. Il faut gagner 0.4 sur R, et on peut le faire avec des FFP2, de la ventilation, des purificateurs d'air et de l'éducation populaire.

13/ Au risque d'insister, puisque le temps de contagion est allongé, avoir des équipes de terrain (pas un call center) qui expliquent aux personnes atteintes les méthodes pour s'isoler, qui aient des tests salivaires, peut faire gagner beaucoup sur le taux de reproduction R.