Carte du taux d'incidence par département (nombre de cas détectés pour 100 000 habitants sur les 7 derniers jours disponibles, ici du 2 au 8 mars).

La France était à 220,4 jeudi dernier (221,6 après consolidation), aujourd'hui elle est à 223. Image
Le taux d'incidence par classe d'âge.

germain-forestier.info/covid/ Image
Le taux d'incidence par région.

Augmentation en Corse, hausse plus légère en Bretagne, Normandie et Île-de-France. Image
Suppression à grande vitesse de l'épidémie à Mayotte, avec un nombre de cas et d'hospitalisations divisé par 2… en 6 et 5 jours (R = 0,5). Confinement avec écoles fermées depuis le 5 février. Ils commencent à déconfiner lundi prochain.

la1ere.francetvinfo.fr/mayotte/sortie… Image
La hausse des cas détectés semble cassée à La Réunion depuis quelques jours. Image
Sur le point hebdo SPF (S9).

Au 3 mars, le R était à 1 selon les 3 données utilisées.

santepubliquefrance.fr/maladies-et-tr… Image
Contribution des différentes souches aux cas détectés, d'après les données de criblage ("suspicion" de telle ou telle souche) disponibles sur SI-DEP.

B.1.1.7 continue d'augmenter en valeur absolue, les souches historiques régressent. Image
Incidence et positivité globalement en plateau depuis une semaine, cela dit le mouvement semble repartir à la hausse depuis quelques jours. Image
Les indicateurs hospitaliers.

Plateau des hospitalisations depuis 24 jours, hausse des entrées en réa (idem), décès de nouveau en baisse. Image
Les hospitalisations par région.

IDF et Normandie à la hausse. Image
Les admissions en réa par région.

Outre la catastrophe en IDF, plusieurs régions sont en augmentation, mais ça peut être bruité donc à confirmer. Image
La montée des eaux se poursuit en réanimation, inversement ça diminue pour les hospitalisations conventionnelles. Image
Ces deux dernières semaines, entre le 25 février et le 11 mars, on a recensé 4248 décès (hôpital + Ehpad), soit en moyenne 303 par jour. Image
Ça diminue essentiellement grâce à la baisse des décès chez les résidents Ehpad, qui se poursuit. Image
Synthèse.

"Des mesures supplémentaires de réduction des contacts peuvent être nécessaires dans les zones où le niveau de pression sur le système de soins progresse le plus"

Langage diplomatique/10. Image
Nombre de personnes ayant reçu au moins 1 dose de vaccin (au 9 mars) : 4 164 418
Nombre de personnes ayant reçu 2 doses : 2 032 791 Image
Désynchronisation entre les cas détectés et les entrées en réanimation depuis quelque temps. Image
L'épidémie continue d'être désynchronisée selon les classes d'âge, ce qui se retrouve aussi dans les admissions à l'hôpital (augmentation chez les 70- et diminution chez les 80+). ImageImageImage
Ces imbéciles misent tout sur la vaccination pour éviter la saturation hospitalière et donc des mesures de contrôle supplémentaires de l'épidémie, sauf que la couverture vaccinale est à moins de 10% chez les 50-74 ans qui occupent majoritairement les réas… Image
Bref, le R de B.1.1.7 est toujours supérieur à 1, cette souche a encore 20-30 points de prévalence à prendre au niveau national, et les entrées en réa reflètent ce qui se passait fin février, quand 2 zones sur 3 étaient encore en vacances scolaires.

La situation est excellente.

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25 Feb
Carte du taux d'incidence par département (nombre de cas détectés pour 100 000 habitants sur les 7 derniers jours disponibles, ici du 16 au 22 février).

La France était à 190 jeudi dernier (192 après consolidation), aujourd'hui elle est à 214.
Vue relative, pour distinguer le catastrophique du très mauvais.
Le taux d'incidence par classe d'âge.

germain-forestier.info/covid/
Read 36 tweets
25 Feb
« La compétition entre parasites est un processus plus intuitif. D'une certaine manière, les parasites "consomment" des ressources de leur hôte et si un hôte est infecté par plusieurs parasites, ceux-ci peuvent entrer en compétition pour une même ressource.
(...) Plus frappant, si l'on compare des souches de différentes virulences, on constate que plus une souche est virulente et plus elle gagne la compétition intra-hôte en s'appropriant plus de ressources.
(...) [Si une souche] est virulente et l'autre pas, la virulente se transmettra fortement, la bénigne se transmettra faiblement (...). Dans ce dernier cas, la souche moins virulente est clairement désavantagée (...).
Read 4 tweets
22 Feb
[Prépublication] Étude de cohorte (SIREN) sur 23 000 soignants au Royaume-Uni. Efficacité du Pfizer contre l'infection (symptomatique ou non) :

• 72% (95% CI 58—86) 21 jours après la première dose
• 86% (95% CI 76—97) 7 jours après la deuxième dose

papers.ssrn.com/sol3/papers.cf…
Ce résultat concerne la cohorte séronégative et sans PCR+ au départ (pas d'infection antérieure détectée, donc).

La souche dominante au moment de l'étude était B.1.1.7.
Leur modèle montre également que la cohorte séropositive avait déjà une protection de 90% (95% CI 88—92%), comparé à la cohorte séronégative, suite à l'infection naturelle.
Read 5 tweets
4 Feb
Carte du taux d'incidence par département (nombre de cas détectés pour 100 000 habitants sur les 7 derniers jours disponibles, ici du 26 janvier au 1er février).

La France était à 211,9 jeudi dernier (212,6 après consolidation), aujourd'hui elle est à 213,3.
Notez l'affaiblissement de la partition Ouest/Est (situation il y a 3 semaines à gauche, aujourd'hui à droite) : le mauvais s'est homogénéisé.
Le taux d'incidence par classe d'âge.

germain-forestier.info/covid/
Read 37 tweets
3 Feb
« Cette étude de jeunes recrues masculines des Marines trouve que la présence d'anticorps au SARS-CoV-2 confère un taux d'incidence de l'infection réduit de 82%. Le % d'infections symptomatiques était comparable entre les participants séro+ et séro- »

medrxiv.org/content/10.110…
« Parmi le groupe des séropositifs, les participants devenus infectés avaient des titres d'anticorps plus bas que les non infectés, et avaient plus de chances de ne pas avoir une activité neutralisante détectable des anticorps. »
« Nos résultats indiquent que quoique les anticorps induits par l'infection soient largement protecteurs, ils ne garantissent pas une immunité effective contre une infection ultérieure »
Read 4 tweets
2 Feb
« Dans sa foire aux questions, le ministère précise ainsi que les classes de maternelle doivent désormais fermer dès l’apparition du premier cas de Covid-19 parmi les élèves. »

lemonde.fr/planete/articl…
« Les personnels ne seront pas identifiés comme contacts à risque dès lors qu’ils portent un masque grand public de catégorie 1 ou un masque chirurgical »

Ben tiens...
« Dans l’enseignement primaire et secondaire, (...) l’apparition d’un cas confirmé parmi les enseignants ou les élèves n’entraîne pas automatiquement de contacts à risque dans la classe. »
Read 4 tweets

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