Thread by @josenalencar

Uma situação muito comum em empresas é a testagem de contactantes de pacientes de COVID para liberar ou isolar seus funcionários.

Uma empresa decidiu testar todos os funcionários após 1 deles positivar para COVID. Essa estratégia os protege? Fio sobre testagem de contactantes.

Imagine que em uma empresa com 101 funcionários, 01 deles ficou sintomático, foi afastado, coletou PCR que foi positivo.

"Seguindo todos os protocolos de segurança", o chefe decidiu fazer testagem em massa e ordenou que os 100 funcionários fizessem também um PCR.

Atualmente, o Rt do Brasil (em média, isso varia de estado para estado) está em 1,12. Isso significa que cada 100 pessoas com COVID atualmente contaminam outras 112. Ou, arredondando, cada pessoa com COVID contamina 1 outra.

Em média.

Para ilustrar, digamos que esse funcionário contaminado contaminou outras 2 (acima da média) no trabalho - aquelas que sentavam nas mesas vizinhas.

Significa que em uma população de 100 pessoas (funcionários que sobraram), há 2% de prevalência de COVID.

Esses funcionários contaminados podem permanecer assintomáticos durante todo o curso da doença, contaminando outras pessoas no escritório sem que se perceba. A não ser que sejam isolados. E é aí que entra o racional (ou seria "o irracional"?) de fazer testagem em massa.

O que aconteceria com essa testagem em massa? Vamos relembrar o perfil de acurácia do RT-PCR:
- Sensibilidade (capacidade de detectar positivos entre doentes): 70%
- Especificidade (capacidade de detectar negativos entre sadios): 95%.

Esses dados são úteis? Sozinhos, não.

Não é à toa que a maioria dos leigos não sabe que testes podem ser falso-positivos e falso-negativos. Até os médicos possuem dificuldade em fazer a análise correta dos exames.

Eles acreditam que sensibilidade e especificidade são tudo o que se precisa saber de um teste.

Bem, se a sensibilidade é a capacidade de detectar doenças entre quem tem a doença e especificidade a capacidade de detectar ausência de doença em sadios, para usar esses dados, eu precisaria saber de antemão quem é doente e quem não é.

E eu não sei. Por isso pedi o exame.

É aí que entra a análise bayesiana de exames. Essa análise parte da probabilidade pré-teste ou da prevalência da doença na população. Sendo assim, veja como fica a testagem em massa desses 100 funcionários (os valores estão arredondados porque não existe meio doente).

Em um gráfico mais ilustrativo, ficaria mais ou menos assim:
Dos 100 funcionários, uma pessoa retornaria ao trabalho e contaminaria mais 1 ou 2 pessoas. Cinco receberiam diagnóstico falso positivo (PCR +, mas sem COVID).

É por isso que a OMS recomenda isolamento de contactantes que tiveram contato próximo (< 1 m) por > 15 minutos ou contato direto sem uso de máscaras.

Isso é o que, de verdade (sem "me engana que eu gosto e preciso voltar ao trabalho"), reduz a taxa de contaminações.

"Já sei o que vou fazer. Vou colher uma sorologia. Se eu for IgG + e IgM - posso retornar. Aliás, não preciso nem usar máscara".

Não, cara pálida. Você só perdeu dinheiro. Sorologia é um péssimo exame para COVID. Seja qual for a situação.

"Ah, mas eu vi na propaganda do laboratório que a sensibilidade e a especificidade da sorologia são de 100%".

Eu sei, mas sinto informar que você foi enganado porque é 100% (nem é) comparado com o PCR, que por sua vez tem uma Sense de 70% e uma Esp de 95%.

"Eu pensava que o PCR era 100% específico". Em termos analíticos, sim, mas o @lucaszanandrez pode nos explicar as razões pelas quais a especificidade cai, na vida real, para em torno de 95%.
A fonte está nesse artigo:

bmj.com/content/bmj/36…

"Você tirou aquele cálculo da cartola". Não, aquele é o teorema de Bayes simplificado. Você pode fazer também. É só entrar em:

calculator.testingwisely.com/playground/2/7…

E brincar com os números.

Resumindo, testar os contactantes para definir isolamento:
- Não protege (pessoas com doença podem não ser identificadas);
- Não é financeiramente eficiente;
- Não é uma boa conduta médica (falta conhecimento básico de bioestatística para quem não interpreta isso).

O que deve ser feito? Isolar todos os contactantes que passam por esses critérios da OMS:
- Contato < 1 metro e > 15 minutos com caso provável ou confirmado
- Contato físico direto com caso provável ou confirmado

Observe que "caso provável" deve ser isolado.

Corrigindo a árvore de valor preditivo do teste.