Thread by @deborahciencia

¿Qué es el umbral de ciclo (Ct) de la PCR?
¿Puede usarse para determinar si una persona es contagiosa?
Dentro hilo 🧵

🧬La PCR es una técnica de amplificación de material genético. Esto significa que si en la muestra hay una secuencia específica del material genético del virus, la PCR (reacción en cadena de la polimerasa) hará varios ciclos de copias hasta llegar a una cantidad detectable.

🧬🧬🧬Así, el umbral de ciclo (Ct) es la cantidad mínima de ciclos necesaria para alcanzar un nivel de copias detectable.

Aunque la Ct no es una medida directa de la carga viral, en términos generales puede decirse que menor Ct 📉implica mayor carga viral📈. Por eso es aconsejable presentar el resultado de la PCR acompañado del valor de Ct.

⌛El problema de las PCR es que si se hacen ciclos suficientes pueden dar positivo hasta 80 días después de la infección. En la mayoría de los casos son falsos positivos, pues lo que se detecta son restos de material genético de virus no viables.

Lo que se está estudiando es si el Ct es un buen marcador del tiempo transcurrido tras la infección. La evidencia científica actual es que el Ct no es un buen marcador: el Ct es tan voluble que no permite establecer una fecha de contagio.

🧐Ahora mismo la pregunta es: ¿Una PCR positiva con Ct ≥ 35 significa que esa persona ya no es contagiosa? La respuesta a esta cuestión es difícil y todavía no hay consenso.

📊El problema es que no todos los laboratorios trabajan con las mismas variaciones en el valor de Ct, es decir, no hay un estándar internacional, ni siquiera dentro de un mismo laboratorio.

👩🏼‍🔬Hay métodos de extracción de material genético del virus más eficientes que dan valores más bajos de Ct:

Los volúmenes de extracción más altos pueden producir valores de Ct más bajos, ciertas dianas genéticas producen valores de Ct diferentes, y algunos ensayos realizan una etapa de preamplificación produciendo valores de Ct más bajos en comparación con otros.

Esto significa que los valores de Ct no son comparables entre sí porque dependen de cómo se haga la PCR.

📊Así que el Ct no debe usarse como marcador absoluto para descartar la infectividad. Cuanto menor sea el Ct, más probable es que esa persona sea contagiosa, pero no se puede afirmar que una persona con una PCR positiva con Ct ≥ 35 no es contagiosa.