Thread by @Pr_Logos

1/ Quelle part de la baisse des contaminations est-elle due:
- à la vaccination
- à une saisonnalité biologique, liée à notre système immunitaire (le virus, lui ne change pas)
- au fait que nous avons développé une sociabilité d'extérieur + mesures en milieu scolaire

2/ En première dose, la baisse de charge virale doit être en gros 1/2 et 1/4 en deuxième dose -> baisse de transmissibilité. Les données exactes supposent d'aller chercher pour chaque vaccin combien ça fait…

Graphes piqués à @nicolasberrod.

3/ Il faut ajouter à la liste des effets:
- la température du nez: le virus se réplique mieux en milieu froid < 37°.
- l'effet de la lumière solaire, de l'humidité et de la température sur le temps de désactivation des particules virales aéroportées: chaud et humide = + vite.

4/ Dans l'autre sens, sur la protection vis-à-vis de la contamination (moins bonne que vis-à-vis du fait de contracter une forme grave en voie basse), on doit pouvoir prendre 90% en deux dose, et 45% en 1 dose pour avoir un ordre de grandeur.

Tranches d'âge INSEE 2021.

5/ Autre représentation (par @l_peillon ) de la couverture vaccinale, dont je répète que montre le "1 dose" est éthiquement douteux. Le vaccin, c'est 2 doses + 15 jours.

6/ Dans l'état actuel des choses:
• La vaccination complète, réelle (2 doses + 15 jours) multiplie le taux de reproduction R par 0.8 (-20% de risque)
• La vaccination partielle, peu protectrice (1 dose), ou complète, multiplie le taux de reproduction R par 0.65 (-30%)

7/ C'est intéressant de donner le facteur de réduction de R du masque porté dans les espaces publiques: entre 0.25 (-75% de risque) et 0.5 (-50% de risque). Si le masque était de qualité et bien porté, le facteur de réduction serait 0.1 (-90% de risque).

8/ Ma conclusion, c'est que la vaccination aide beaucoup à la décroissance de R en dessous de 1, QUAND ON A DE LA REDUCTION DE RISQUE EN PLUS.

Alpha=B1.1.7=anglais a un R0 de 4,5. La vaccination seule le ferait passer à R=3, en ce moment.

9/ Bien sûr, en septembre-octobre, quand Delta sera hégémonique et que nous serons reposés, la vaccination aura progressé. Le facteur vaccinal de réduction de R sera plus petit. Mais ça ne suffira pas.

Il faut investir AUSSI dans la réduction de risque.

10/ Quand le taux de reproduction R est réduit de 3,5 à 1,3 par les mesures de sociabilité en extérieur et de masque systématique en intérieur, alors -30% par la vaccination, ça nous fait du R=0,9; et c'est bien ce qui nous permet de souffler, enfin, et de pouvoir vivre un peu.

11/ Je répète le nombre pour qu'il s'ancre dans les têtes de tous ceux qui me lisent:
• réduction par les mesures de réduction de risque = x 0,37
• réduction par la vaccination = x 0,7

D'où l'explosion de Delta en Angleterre.

12/ A l'automne, avec Delta, la vaccination seule ne suffira pas. Il FAUT combiner les facteurs de réduction de risque pour sortir du cauchemar l'an prochain.

La vaccination ET l'investissement, enfin, dans la ventilation et des équipes épidémiologiques de terrain.

13/ Ah, j'ai oublié de commenter/estimer le facteur de réduction de R saisonnier. En aout dernier, nous étions autour de R=1,3 en ayant tout lâché et en vivant l'été, naturellement, et sans Ecole. Donc un facteur x 0,5 = système immunitaire + désactivation + vie en extérieur.

PS: Au tweet 6: j'ai additionné 1 dose et 2 dose -> ça réduit plus. J'ai juste été un peu lourd en insistant sur le fait que 1 dose ne protège pas bien. Mais les 1 dose apporte -10% et les 2 doses -20% aujourd'hui.

Bien plus en septembre.
Plus clair?

https://twitter.com/Pr_Logos/status/1404052178025725954

6 corrigé/ A ce jour
• La vaccination complète (2 doses + 15 jours) multiplie le taux de reproduction R par 0.8 (-20% de risque)
• La vaccination partielle, peu protectrice (1 dose), multiplie le taux R par 0.9 (-10%)
• La vaccination (1 ou 2 doses) multiplie R par 0.7 (-30%)