Thread : pourquoi a-t-on une augmentation de +508% de nouveaux cas de COVID-19 en 1 semaine au Pays-Bas ?
Leçon à prendre 🤯
▪️ Parmi les cas dont le statut vaccinal est connu (72%), 84% n'était PAS vacciné et 10% partiellement vaccinés
▪️ La plupart des cas ont moins de 30 ans
Dégradation très rapide de la situation sanitaire :
▪️ nombre de tests positifs multiplié par 6 pour la semaine 7-13 juillet 2021 par rapport à la précédente
Semaine 26 : 8 541 nouveaux cas (49,9 pour 100 000)
Semaine 27 : 51 957 nouveaux cas (301 pour 100 000)
Le graphe représente le nombre de cas pour 100 000 par classe d'age : augmentation de +856% de nouveaux cas chez les 25 à 29 ans
Le nombre de reproduction est passé de 0,97 à 2,17 !
1/3 des cas ont indiqué leur contexte probable de contamination :
37% au restaurant/horeca
28% à domicile
16% visites à domicile
15% de fêtes
7% au travail
Chez les jeunes de <30 ans, c'était principalement à des soirées et au resto
Le rapport du 9 juillet du RIVM met en avant des clusters d'une dizaine à une centaine de personnes contaminées lors de soirées étudiantes, à l'hôtel, au resto
Et pleins d'autres mesures restrictives ont été remises en place. Voici ce qui pourrait nous attendre si on a une couverture vaccinale faible en France et qu'on se relâche trop dans des situations à risque (promiscuité + faible aération + sans masque)
Comparaison des semaines 26 et 27 pour le nombre de tests positifs (Aantal positieve testen), la positivité par semaine et le nombre de reproduction (Reproductiegetallen)
"Nous pensons que les arguments en faveur de l'obligation de vaccins contre le SRAS-CoV-2 pour les travailleurs de la santé sont nettement plus convaincants que ceux de l'obligation de vaccins contre la grippe"
Ce papier tombe à pic
☠️ La mortalité pour le SARS-CoV-2 est plus importante (1 pour 100 à 250 infectés) vs 1 pour 1000 pour la grippe
Aux USA plus de 1 600 professionnels de santé sont décédés du COVID-19
"La transmission nosocomiale (à l'hôpital) du SARS-CoV-2 est commune"
Le port du masque universel permet de réduire le risque mais une adhérence parfaite n'est pas possible
✅ Les vaccins par contre confèrent une protection constante
✅ Vacciner les soignants va aider à protéger les patients non vaccinés en évitant une transmission nosocomiale
▪️ Vaccination obligatoire pour les personnes travaillant avec des personnes fragiles. Une bonne chose; A titre d'exemple l'Italie a appliqué la même mesure et on est à 97% de vaccinés chez les soignants
▪️ Possibilité d'avoir une 3è dose de rappel pour l'Automne 2021 pour ceux qui ont été vaccinés en Janvier
▪️Extension du pass sanitaire pour faire porter les contraintes aux non-vaccinés (ce qui est fait au Danemark et dans d'autres pays)
▪️En octobre, les tests seront payants
▪️ Vaccins très efficaces contre les formes sévères pour tous les variants
Les vaccins à ARNm sont efficaces à ~75% contre le variant Delta (infection asymptomatique et symptomatique)
Étude dans la UK Biobank sur 493 888 sujets suivi pendant 8 ans 🥓🥩
Ma consommation de viande transformée (bacon, jambon, saucisses, pâtés, brochettes, hamburgers, nuggets de poulet) était associée à des risques accrus de démence toutes causes et de maladie d'Alzheimer
mais par contre la consommation de viande rouge non transformée était associée à un risque diminué. Il n'y avait pas d'association avec la volaille 🐔
Avoir la mutation APOE ε4 multipliait par 3 le risque de démence et par 6 d'Alzheimer (par rapport aux-non porteurs d'APOE ε4). Le gène APOE (apolipoprotéine E) existe en effet sous trois versions : les allèles E2, E3 (le plus fréquent) et E4
J'ai vu passer des comparaison de cartes entre le revenu médian et le % de vaccinés mais il faut garder en terme qu'une corrélation n'est pas forcément causalité
Exemple très courant entre la corrélation entre les coups de soleil et les ventes de glace l'été pour illustrer ça
Pour faire de l'inférence causale en étude observationnelle, Pearl a proposé d'utiliser des diagrammes acyclique orienté("DAG"). Il s’agit d’un graphique où les variables (= points) et où les relations entre les variables seront représentées par des flèches à une pointe
On peut avoir différentes manières de voir la causalité entre X et Y
Dans l'exemple 1, la variable Z est un médiateur
Dans l'exemple 2, la variable Z est un facteur de confusion qui influe X et Y. Il faudra "ajuster" prendre en compte ce facteur
La vaccination ne favorise pas le développement de variants
Un préprint suggère que les vaccins COVID-19 restreignent fortement la diversité des lignées, les voies d'échappement évolutives du SARS-CoV-2 et empêchent le virus de muter au même rythme que chez les non-vaccinés
C'est assez logique vu que plus le virus circule, plus on a de chance de voir apparaître de nouveaux variants et nouvelles lignées, or les vaccins réduisent la circulation du SARS-CoV-2V
Sur une analyse de 1,8 millions de génomes de SARS-CoV-2, on voit que la diversité diminue
Ils ont comparé les génomes de 23 sujets vaccinés et immunisés qui ont été infectés après (percée vaccinale) avec 30 personnes non vaccinés infectées
Les non-vaccinés ont plus de mutations sur l'épitope des protéines Spike de leur SARS-CoV-2 que les vaccinés
Étude sur 508 707 participants 🇬🇧 sur le covid long (non reviewée)
Prévalence autodéclarée de COVID-19 : 19,2%
37,7% des 76 155 cas symptomatiques ont eu au moins 1 symptôme (prévalence pondérée pour la représentativité de 5,7%) et 14,8%, 3 symptômes ou + durant >11 semaines
La prévalence de symptômes persistants n'est pas nulle chez les plus jeunes
La prévalence de symptômes persistants à 12 semaines ou plus était d'environ 50 % ou plus parmi les personnes déclarant des comorbidités
Ce qui donne une prévalence pondérée (représentative de l'Angleterre) de 5,8% pour 1 symptôme persistant (potentiel COVID long) et 2,2% pour 3 symptômes ou plus
La prévalence des symptômes persistants
était plus élevé chez les femmes que chez les hommes et augmentait avec l'âge