Bitte alle einmal durchatmen. Nach allem was ich erkennen kann handelt es sich hier um eine Non-Story aufgrund sehr schlechter Pressemeldung von @Reuters.
Lambda ist höchst wahrscheinlich WENIGER übertragbar als Delta. Hier ein kurzer Thread zur Einordnung. 1/
Bevor wir zur Studie kommen: Lambda ist schon so lange bekannt wie Delta. Hat sich in einigen Ländern Südamerikas diesen Frühjahr langsam verbreitet (Grün). Z.B. in Chile, wo es aber erst von P.1/Gamma (Orange) und jetzt von Delta (Blau) überholt wird. Also doppelte Entwarnung 2/
In keinem Land außerhalb Südamerikas, nichtmal in Brasilien wo Gamma zuerst aufgetreten war hat sich Lambda je durchgesetzt. Gamma und Delta waren immer übertragbarer. Das ist der Punkt wo man aufhören sollte sich sorgen zu machen. Hier Brasilien: Lambda < Gamma < Delta 3/
Lambda hat nichtmal gegen Gamma eine Chance, und Gamma ist Delta deutlich unterlegen. Lambda ist überall eingetragen worden (alle nicht-schraffierten Länder) und hat sich nie durchgesetzt außer Peru/Chile. Das ist epidemiologisch sehr überzeugend. Kein Grund zur Sorge. 4/
Nun zur Studie. Das erste was mir auffällt ist der schlechte Titel der stark gekürzt lautet: "Lambda shows higher infectivity". Da fehlt offensichtlich der Vergleich: infektiöser als was? Man denkt vielleicht "infektiöser als alles was wir bisher kennen?", aber nein! 5/
Wenn man sich bis zur Discussion durchliest kommt dann die Antwort: infektiöser als der Wildtyp von letztem Sommer (D614G). Vollkommen offensichtlich und zeigt wie schlecht und clickbaity der Titel ist. Das wird im Peer Review kassiert. Aber Reuters ist drauf reingefallen. 6/
Was ist das überhaupt für eine Studie? Das Team hat Pseudovirus mit dem Spike verschiedener Varianten ausgestattet, darunter auch Gamma & Delta, und dann gemessen wie infektiös die Zellen sind. Dazu kommt eine allgemeine Charakterisierung der Variante. 7/
biorxiv.org/content/10.110…
Die Ergebnisse sind klar: Lambda ist infektiöser als die alte Variante D614G, ABER nicht infektiöser als Delta, eher sogar weniger. Das heißt die Studie selbst sollte also eigentlich als zusätzliche Entwarnung gelesen werden, dass Lambda nicht gefährlicher ist als Delta. 8/
Der einzige Grund, warum wir nun von dieser Studie hören ist anscheinend, dass der Titel ein paar Journalisten ausgetrickst hat, die nur die Überschrift und nicht den ganzen Text gelesen haben. Und dazu noch keine unabhängigen Experten gefragt haben. 9/
Zum Schluss: es gibt eine neue Untervariante von Delta #AY3 die sogar wiederum eine eigene Untervariante hat AY.3.1 (AY steht für B.1.617.2 was wiederum Delta ist). Diese beiden Varianten verbreiten sich gerade im Midwest der USA (und evt in Südafrika & Österreich) 10/
Es ist zu früh um zu sagen ob es sich hier um eine wirklich übertragbarere Variante oder nur um einen Founders' Effect oder gar Missklassifikation handelt, aber das ist die Richtung in die ich schauen würde, nicht Lambda. 11/
Als Antwort auf ein paar Fragen: ja die Studie untersucht welche Mutationen erklären könnten, warum Lambda einen Immune Escape zeigt (wie Delta auch). Da sollte mal ein:e Virolog:in drüber gehen, das ist nicht mein Metier. Für mich sieht das aber nicht besorgniserregend aus. 12/
Dass Lambda gewissen Immune Escape zeigt ist bekannt, sonst hätte es sich ja nicht im relativ geimpften Chile durchsetzen können. Der verwendete Impfstoff war aber nicht der Goldstandard mRNA sondern weniger effektiver CoronaVac von Sinopharm. 13/
Dass Lambda sich in Chile bei 60% Impfquote durchsetzen konnte ist nichts besonders besorgniserregendes, weil in UK Delta mit sogar 70% Impfquote das gleiche tut. Gäbe es weder Gamma noch Delta, dann wäre Lambda kritisch. So aber nicht. 14/

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2 Aug
Gilt genau so auch für Deutschland.
Ich vers nicht, dass @jensspahn auch in der Pandemie beim @rki_de spart. Das RKI ist so dünn besetzt, dass es in den Sommerferien verkürzte Lageberichte herausgeben muss. Es mangelt an Personal vorne und hinten. Wie kann das sein?
Das Schweizer Bundesgesundheitsamt hat in der Pandemie ca. 100 temporäre (wissenschaftliche) Mitarbeiter angestellt. Auf Deutschland skaliert wären das 1000 Mitarbeiter. Soviel wie das RKI insgesamt hat.
In der Schweiz gibt es mindestens so viel Föderalismus, daran liegt's nicht
Hier eine spannende kleine Anfrage zur Thematik (IT-) Personal am RKI.
Es wurden anscheinend nur 3 temporäre Mitarbeiter eingestellt (für epidemiologische Modellierung). Das war's.
Bis zu 180 Stellen zusätzlich, ist aber nicht klar wofür.
google.com/url?sa=t&sourc…
Read 4 tweets
11 Jul
So ein Mist.
Natürlich ist die Steigung aussagekräftig. Eine Verdopplung führt weiterhin zu einer Verdopplung der schweren Fälle.
Nur ist Inzidenz 100 jetzt eben wie 25 vor 6 Monaten. 1000 wie 250.
Ein Anstieg ist weiterhin ein Anstieg
Ich kann das auch mathematisch begründen 1/6
Krankenhausaufnahmen (K) = Inzidenz (I) * Hospitalisierungsrate (R)
Die Rate ist jetzt 4 mal kleiner
Wenn die Inzidenz steigt, steigen aber weiterhin auch die Aufnahmen.
Leiten wir das Mal nach der Zeit ab.
K' = I' * R + I * R'
Teilen wir durch K für die relative Veränderung 2/6
K'/K = I' * R / (I * R) + I * R' / (I * R) weil K = I*R
R und I kürzen sich jeweils weg.
Also:
K'/K = I'/I + R'/R
Die rel wöchentliche Veränderung der Aufnahmen ist also die Summe der Tel wöchentlichen Veränderungen von Inzidenz und Hospitalisierungsrate. 3/6
Read 8 tweets
8 Jul
2 Denkfehler:
Erstens haben @HeikoMaas & #Kubicki anscheinend nicht verstanden, dass es (außer bei J&J) 2 Dosen für einen guten Schutz braucht.
Selbst wenn alle die wollen (inkl. 12-18J) bis Ende August die erste Impfung haben, dauert es nochmal 1 Monat bis zur Zweiten. 1/
Zweitens gibt es starke politische & rechtliche Gründe, warum auch nach Angebot eines vollen Impfschutzes Maßnahmen nötig sein könnten:
a) U12 haben noch keinen zugelassenen Impfstoff
b) 4. Welle kann das Gesundheitssystem so überlasten dass auch Geimpfte beeinträchtigt werden 2/
Man muss nur nach England schauen. Trotz
i) Sommer
ii) hoher Impfquote
iii) hoher Zahl Genesener
fangen Krankenhäuser an überlastet zu werden, mit der Konsequenz, dass Chemotherapien und Operationen für Unschuldige verschoben werden. 3/
independent.co.uk/news/health/le…
Read 6 tweets
11 Jun
Wenn man ein logistisches Modell an die Ausbreitung von Delta in Deutschland fittet (seit Anfang Mai) wird der momentane Delta-Anteil (in Proben von heute) auf 5-8% geschätzt.
Übertragungsvorteil 3-5% pro Tag.
Im August würde Delta dominant
Caveats: Vorteil kann sich verändern 1/
Mit steigender Impfquote könnte sich der Übertragungsvorteil von Delta erhöhen.
Eintragungen aus UK & anderen Delta-Ländern könnten zunehmen.
Neue noch fittere Varianten können jederzeit auftauchen.
Mit den Modellparametern kann man hier selbst spielen: cov-spectrum.ethz.ch/explore/German… 2/
Ein Problem, dass ich bei Delta sehe, ist dass sie eine höhere Sterblichkeit zu haben scheint.
Für die Nicht-Immunen (nicht geimpft/genesen oder Impfversager) wird das also unangenehm. 3/
Read 4 tweets
10 Jun
Wie kommt die STIKO auf die Aussage, dass die IFR bei Jugendlichen bei 0,001% liegt? Das unterschätzt um Faktor 2 bis 8!
Dieser Meta-Review zeigt folgende IFRs, und das für den Wildtyp (mit B.1.1.7 +50%, mit Delta +100%)
Alter 12: 0,002%
Alter 17: 0,004%
link.springer.com/article/10.100…
In einer Impfempfehlung für 12-17-Jährige hat die IFR von 12-17-Jährigen zu stehen. Nicht ein Durchschnitt inklusive Jüngeren.
Warum wird das Risiko untertrieben?
Nutzt man etwa die Ioannidis-Studie?
Oder zählen nur Deutsche Daten?
Tatsache. In der STIKO-Begründung wird die IFR lediglich anhand der deutschen Meldedaten abgeschätzt, so Pi mal Daumen. Der Meta-Review von oben wird überhaupt nicht zitiert. Die internationale epidemiologische Literatur wird ignoriert.
Read 4 tweets
9 Jun
Welche Bundesländer sequenzieren am meisten?
Hier ist der Anteil der Fälle von vor 15-21 Tagen, die sequenziert und auf @GISAID geteilt wurden.
HH 13.4%
NW 12.2%
BW 10.1%
SN 5.3%
BE 5.1%
TH 5.0%
RP 4.6%
HE 4.1%
NI 2.7%
SL 2.1%
BR 2.1%
HB 1.8%
MV 1.6%
ST 0.9%
BY 0.6%
SH 0.1%
Hier das Ergebnis für den Zeitraum 22-28 Tage.
Viele Bundesländer brauchen 3-4 Wochen, das ist zu langsam. Bayern ist großer Flop!
HH 17.7%
NW 13.4%
BW 11.6%
ST 8.1%
SN 8.1%
SL 7.3%
HB 5.0%
BE 5.0%
HE 4.7%
TH 4.5%
NI 3.9%
RP 3.8%
BR 2.1%
BY 2.1%
MV 1.8%
SH 1.0%
Die Ungleichverteilung ist ziemlich erschreckend für mich.
NRW und BaWü machen zusammen 65% der Sequenzen für den Zeitraum 27. Mai bis 2. Juni aus.
Da kann man die Repräsentativität total knicken.
Der Bund zahlt 220 Eur bis 10% der Fälle. Das ist viel und reicht trotzdem nicht!
Read 6 tweets

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