1/n En ce qui concerne l'étude EPI-PHARE. Il s'agit d'une étude de cohorte sur des sujets de 50-74 ans, deux groupes de 7,7 millions appariés 1à 1 par sexe , âge et région d'origine.
2/n Le groupe des vaccinés a été sélectionné sur la base de données VAC-SI, psudonymisé et des individus vaccinés entre le 1er février et le 30 avril ont été appariés chacun avec un sujet du même sexe, âge et région d'origine.
3/n Les non vaccinés appariés à chaque vacciné ont été sélectionnés à partir de la base SNDS système national des données de santé. Le début du suivi se situait à la date de vaccination du sujet vacciné pour chaque couple.
4/n Un sujet non vacciné pouvait changer de statut s'il était vacciné sur la période d'appariement et être alors couplé à un sujet non vacciné selon le même procédé.
5/n Mais un témoin ne pouvait être apparié qu'à un seul vacciné.
Les critères de jugement étaient les hospitalisations et les décès chez des personnes vaccinées entre le 1er février et le 30 avril et suivies jusqu'au 20 juillet.
6/n Les paires n'étaient pas identiques, notamment en ce qui concerne les comorbidités et le statut de défavorsiaiton et le calcul de l'efficacité a été fait en tenant compte de l'efficacité pour chaque pair et dans un deuxième temps ajusté pr toutes les covariables (comorb etc)
7/n Les groupes étaient différents en particulier par l'indice de défavorisation et on se souvient que les plus favorisés qui voulaient se faire vacciner se sont arrangés pour accéder au vaccin plus rapidement.
8/n L'efficacité a été évaluée par vaccin, par délai après la 1ere et 2è dose et par durée de suivi. Elle était élevée entre le 1er et 6ème jour puis diminuait puis augmentait régulièrement.
9/n Les auteurs expliquent cela par une auto-sélection des sujets vaccinés qui ne se vaccinent pas s'ils sont malades ou font plus attention au moment de la vaccination.
10/n Les critères de jugement, hospitalisation et décès ont été déterminés selon les données du PMSI c'est à dire le système informatisé de recueil des données à l'hôpital.
11/n Outre les limitations d'une telle étude, qui reste une étude observationnelle, qui ne sont pas discutées; je me demande quel peut être l'effet éventuel d'avoir utilisé deux bases de données différentes pour sélectionner les vaccinés et les non vaccinés.
12/n Mais l’éléphant dans la pièce est tout de même le pré-supposé que vaccinés et non vaccinés sont testés de la même manière, selon les mêmes critères à l'hôpital.
13/n Car il ne faut pas oublier que 80% environ des patients hospitalisés pour Covid sont hospitalisés dans des services conventionnels et n'ont pas forcément de symptômes spécifiques.
14/n De même quelques 80% des patients qui décèdent à l'hôpital avec une étiquette covid décèdent dans des services conventionnels, de gériatrie, unité de soins longue durée ou autres.
15/n Parce que ce qu'on voit c'est , p exp, les patients vaccinés hospitalisés ET testés ou non vaccinés décédés ET testés.
16/n On aurait pu, avec de la bonne volonté, ôter le doute en comptant tous les patients hospitalisés d'un côté comme de l'autre et les patients décédés toutes causes d'un côté comme de l'autre.
On aurait pu le faire sur un échantillon randomisé de pairs. Mais ça n'a pas été fait
17/n Parce que si on avait trouvé que, p exp, les non vaccinés étaient davantage testés que les vaccinés cela ôterait de la valeur aux résultats et serait en faveur d'une surestimation de l'efficacité.
18/18 Mais ça n'a pas été fait.
Et donc, même si ces résultats sont concordants avec d'autres études, on gardera un doute.

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13 Oct
1/n Quelles conclusions tirer de ceci? Les plus de 50 ans représentent 39% de la pop et 21 millions d'habitants, si 2,4 millions ne sont pas vaccinés, cela veut dire que 92% sont vaccinés.
2/n Or, en novembre, avant vaccination, les plus de 44 ans représentaient 95% des hospitalisations et 98% des décès intrahospitaliers donc près de 100% des décès attribués au Covid, car le restant des décès sont essentiellement en EHPAD.
3/n Si l'efficacité des vaccins sur les hospitalisations et les décès est effectivement de plus de 90%, le risque d'avoir une remontée des hospitalisations et des décès est très faible, même en cas de circulation virale accrue.
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12 Oct
1/n D'après Reuters, les Indiens ont arrêté un essai sur le molnupiravir pour défaut d'efficacité. Ils n'avaient pas exclu de l'étude les patients déjà hospitalisés reuters.com/business/healt…
2/n Merck dit aussi que les patients inclus en Inde étaient plus sévères que les patients de son essai car la définition de Covid modéré n'est pas la même en Inde et aux US.
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12 Oct
1/n Une réponse circonstanciée de @MartinKulldorff à un article paru dans le @bmj_latest et co-écrit par David Gorski blogs.bmj.com/bmj/2021/09/13… D Gorski tenant un blog qui se veut "pro-science" et se présentant comme un pourfendeur de fakenews et fakescience.
2/n M Kulldorff met en avant des erreurs dans la qualification, càd des jugements de valeur, des postulats sans fondements mais aussi de nombreuses erreurs factuelles dans l'article du BMJ.
3/n D Gorski a aussi contribué à éloigner Vinay Prasad de Twitter en accordant du crédit et en propageant des accusations délirantes d'anti-sémitisme. Il a utilisé des méthodes qui relèvent du harcèlement.
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12 Oct
1/n Un passionnant documentaire canadien de tvW5 en deux volets (env 20 mn) sur la gestion des effets indésirables des méds et ses conséquences. Via @ColleenFuller ctvnews.ca/w5/prescriptio…
2/n Le premier volet raconte l'histoire de David Carmichael, journaliste sportif à qui on a diagnostiqué une dépression il y a 17 ans et qui a été traité par un antidépresseur très courant, la paroxétine.
3/n Dans un accès psychotique ce père de famille tua son enfant de 11 ans, l'imaginant condamné suite au diagnostic d'une épilepsie légère. Il fut considéré irresponsable et hospitalisé. La famille a souhaité pr la 1ère fois s’exprimer publiquement.
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12 Oct
1/n L'incertitude sur les dénominateurs. Un thread et article intéressants de @jburnmurdoch ft.com/content/125fba… qui montre qu'il peut exister des erreurs , p exp, sur le taux de couv vaccinale, pcq les Etats ne connaissent pas leur population avec précision.
2/n Beaucoup d'Etats n'ont pas de régistre précis de leur population, par exemple l'UK, et les recensements n'ont lieu que tous les 10 ans. Aux US qui est organisé comme une fédération d'états les résidents d'un état peuvent être vaccinés dns un autre et comptabilisés ds celui-ci
3/n Cela fausse donc le dénominateur.
Notons que JB Murdoch évoque le dernier rapport du PHE avec le tableau des infectés selon le statut vaccinal où on pourrait penser que la vaccination favoriserait l'infection. J'en parlais hier
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11 Oct
1/n Concernant les estimations du % de personnes ayant été infectées , 50% me paraît une estimation conservatoire, dans la mesure où aux US, où les écoles ont été longuement fermées, au mois de mai le CDC estimait que 1/3 de la pop avt été infectée. Image
2/n Pour les enfants, le taux était certainement sous-estimé car environ la moitié des enfants seraient asymptomatiques, ce qui n'apparaît pas dans ce tableau. Image
3/n C'est un autre grand questionnement. Que personne ne s'intéresse, ne se pose de question, ne fasse des études pour essayer de connaître le dénominateur ce qui est tt de même totalement essentiel pour prévoir la dynamique de l'épidémie medcritic.fr/?s=d%C3%A9nomi…
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