J'ai vu passer des débats intéressants sur la pyramide des preuves de l'EBM, je suis justement en train d'écrire sur ce sujet (dans la partie méthode de ma thèse)
Petit thread sur cette pyramide et des évolutions ⬇️
La pyramide A classe les études selon leur design mettant en avant la randomisation des essais cliniques (RCT) qui permet d'assurer une meilleure comparabilité des groupes qu'une étude non-randomisée
Cette pyramide vient de l'EBM "la médecine fondée sur les preuves", qui consiste à "à utiliser de manière rigoureuse, explicite et judicieuse les preuves actuelles les plus pertinentes lors de la prise de décisions concernant les soins à prodiguer à chaque patient"
L'EBM combine
▪️ les preuves (données de la recherche)
▪️ la connaissance du médecine (expérience clinique)
▪️ le choix du patient ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P…
L'EBM concerne initialement la médecin/recherche clinique et pas les autres domaines de recherche
L'idée de hiérarchie des preuves s'est exporté à d'autres domaines : en psychologie, épidémiologie environnementale, nutritionnelle, génétique, toxicologie... On voit mal appliquer l'EBM à l'astronomie par exemple
⚠️ Il est important de séparer l'EBM au niveau institutionnel et de santé publique de l'EBM pour la décision clinique individuelle
Déjà la santé publique =/= la médecine
Il y a des zones grises dans l'EBM 1) dans certaines situations les preuves sont absentes
2) Il est difficile d'appliquer à un patient précis les conclusion d'une étude générale
ce qui est blanc ou noir dans une revue scientifique peut rapidement devenir gris dans la pratique clinique thelancet.com/journals/lance…
Recherche clinique =/= la médecine
Cette approche "probante" des traitements s'appuie sur des modèles statistiques où la maladie n'est pas prise en compte du point de vue individuel mais d'un point de vue d'un groupe ou d'une population
Pour évaluer les données de recherche (surtout leur validité interne, leurs biais), le système de classement de preuve a été mis en place pour aider les cliniciens et concevoir des guidelines. Mais cette pyramide A est trop simpliste
Dans les années 2000, le groupe de travail Grading of Recommendations Assessment, Development and Evaluation (GRADE) a développé un nouveau cadre qui va évaluer le niveau de certitudes dans un ensemble de preuves, basé sur plusieurs facteurs et pas que le design
Ces facteurs sont le design (évaluation initiale) et
le risque de biais ou les limites de l’étude
l’incohérence des résultats
le caractère indirect des données probantes
l’imprécision
le biais de publication
l’ampleur des effets
le gradient dose-réponse
Cela définit un cadre qui va classer la qualité des données probantes et la force des recommandations
On arrive à une modification de la pyramide A vers B où les lignes séparant les designs deviennent des lignes ondulées
GRADE consistant à augmenter ou diminuer la qualité des preuves dans différents domaines
Par ex, une méta-analyse d'essais où la double aveugle et la randomisation n'ont pas été bien mené, aura une qualité de preuve diminué
Alors que l'implantation d'une prothèse de de la hanche chez un patient atteint d'arthrose invalidante de la hanche aura un niveau de preuve plus élevé en dépit d'une preuve observationnelle
Cette pyramide B a été critiquée parce qu'il place les méta-analyses/revues en haut
Une règle d'or de la méta-analyse : La méta-analyse ne peut être meilleure que la meilleure des études utilisées pour la faire
La méta-analyse ne va pas corriger les biais mais va juste augmenter la puissance statistique, augmenter la précision, permettre de faire une synthèse
d'où cette dernière représentation
A savoir que ces concepts ne s'appliquent pas forcément ou doivent être adaptés dans d'autres domaines que la recherche clinique
En Nutrition, il est difficile de faire un essai randomisé en double aveugle (pas possible)
A part pour les compléments alimentaires qu'on peut masquer en placébo
L'évaluation des maladies chroniques qui se développent sur des années et des événements rares rend impossible la réalisation de RCT ou du moins c'est très rare. En nutrition je connais le RCT PREDIMED
Dans ma méta-analyse sur les polluants persistants PCBs, on ne peut pas faire de RCT pour évaluer la mortalité ou les cancers comme ce n'est pas éthique
Et la méthode d'évaluation des biais et GRADE a été adaptée par le NTP National Toxicological Program
Des méthodes plus récents ont été développés pour simuler une randomisation et un essai cible "Target Trial" avec des méthodes sophistiquées : g-modèles, IPW...
Je viens de découvrir sur @FruitDiseases que les pommes sauvages d'Asie centrale (Malus) sont toutes petites
Notre pomme commune (Malus domestica) est issue de la pomme Malus sieversii
Deux routes évolutives majeures ont été mises en évidence :
1⃣ vers l'Ouest, la pomme a suivi la route de la soie. Des arbres poussaient à partir de graines tombées et se croisaient avec des pommettes sauvages aigres
2⃣ vers l'Est, la première pomme domestiquée s'est hybridée avec des pommes sauvages pour donner les ancêtres des pommes douces à dessert cultivées en Chine aujourd'hui
"There has been a groundswell of opinion across several countries that ivermectin might be useful in reducing the symptoms of and mortality due to COVID-19, with many citing meta-analyses that infer positive effects; however, these conclusions appear to be unreliable"
Des chercheurs dans le Lancet Infectious Diseases, Nature Medicine, Nature News, dans BMJ evidence-based medicine, dénoncent ce manque de preuve voire les blogs trompeurs ivmmeta.com thelancet.com/action/showPdf…
De quoi il se compose ? Comment l'analyser ? Quelles sont les facteurs qui peuvent influencer sa composition ? Comment évolue-t-il ?
Quelles implications en terme de santé ?
Hésitez pas à RT 🙏
Un schéma résumant l'équilibre entre microbiote et dysbiose qui n'est pas dans ma vidéo (je voulais éviter une vidéo trop longue, déjà qu'elle fait 15 min...)
Le microbiote a une fonction de protection, il est aussi à l'origine de la production d'acides gras à courte chaîne AGCC
Il peut synthétiser certaines vitamines du groupe B et de composés antimicrobiens
Des photos chez la souris à différents endroits de l'intestin grêle/colon avec les bactérie colorées en rouge
Pour Pfizer : déclin de l'efficacité contre l'infection qui passe de 93% à 53% à 4 mois ou plus après la 2nd dose
Cette baisse n'est pas sans doute due à un échappement du variant Delta pour ces raisons : fda.gov/media/152161/d…
1- L'efficacité contre les infections pour Delta était > 90 % au début 2- Ce déclin d'immunité a été observé quel que soit le variant 3- l'efficacité contre hospitalisations associées à Delta est restée élevée sur toute la période d'étude
A noter qu'en in vitro, c'est Beta qui s'échappe le plus
Effet de la 3è dose sur les titres en anticorps (2 dernières colonnes) : c'est bien boosté
En jaune/vert : 18-55 ans
Bleu/gris : 65-85 ans
A gauche : souche historique
A droite : variant Beta
Mon projet de thèse en 3 minutes, encadrée par @MKvaskoff@mancini_fr sur les Polluants Organiques Persistants et le risque de cancer du sein et la mortalité dans la cohorte Européenne EPIC (@IARCWHO)
Ce projet permettra d'en apprendre plus sur ces substances chimiques
Quelques exemples de ces contaminants dits "POPs". On a notamment des pesticides organochlorés (interdits depuis plusieurs années) que l'on retrouve encore en résidus dans l'environnement ou l'alimentation
Ici pour les polychlorobiphényles (PCBs), utilisés comme lubrifiants (turbines, pompes…) et dans la fabrication de transformateurs électriques et de condensateurs dans les années 30-70, on voit que leur temps de demi-vie peut aller jusqu'à une 20aine d'année
Il a été détecté pour la 1ère fois en France dans l'enquête #14 (6 Juillet 2021) avec 3 cas, soit 0,3% des séquences interprétables et à 0,1% dans les enquêtes #15 et #16 (20 Juillet). Détecté en Île-de-France et en Occitanie
Quel impact sur la transmission ? On ne sait pas
Quel impact sur les vaccins ? On ne sait pas
En Italie, on a un essai de séroneutralisation sur 37 individus infectés par Mu et vaccinés avec Pfizer, les anticorps de leur sérum ont neutralisé Mu