6 amostras de pacientes sintomáticos tiveram o dado de PCR negativo, c/ a confirmação da presença da A.Y.33 ("subvariante" da Delta) por sequenciamento. Isso pode acontecer, por uma alteração na detecção do alvo na amostra por conta das mutações presentes no material genético 👇
https://twitter.com/prefeiturabelem/status/1451700808815452166
Para fazer a PCR, que explico no fio abaixo como funciona, precisamos de "iniciadores" ou primers para parear (interagir) com o material genético alvo da nossa amostra (uma região do vírus, como a região que origina a spike p. ex.)
https://twitter.com/mellziland/status/1293586320846131201
Esses primers vão reconhecer regiões específicas do material genético alvo, e esse reconhecimento precisa ser feito com um pareamento muito bem feito entre as duas estruturas. Cada letrinha é importante pra isso
Mas dependendo se meu primer está reconhecendo uma região que apresenta mutações (como deleções - como se uma pequena partezinha fosse "deletada" da sequência - ou substituições - ao invés de AT temos um AG p.ex) dependendo do caso, isso pode não gerar um pareamento tão bom
Conversando com o @AndersonBrito_, em geral, a PCR buscará a detecção de dois alvos: genes S e outros (N, ORF1ab). E nesse vídeo maravilhoso, ele explica o surgimento de várias sublinhagens da Delta e suas modificações
https://twitter.com/AndersonBrito_/status/1451706603091156995?t=bRWbM6dVncSzs37vVudZ3g&s=19
É possível que nessas 6 amostras de pacientes, alguma questão envolvendo o pareamento dos primers possa ter acontecido, e o resultado portanto ter acusado um negativo. Isso pode ser resolvido construindo um conj. de primers com maior chance de abranger essas regiões
Ainda, também poderia ser possível considerar o tempo em que a amostra foi colhida + a pcr foi feita
Sabemos que depois de algum tempo, é possível que a pcr já não consiga detectar tão bem a presença do RNA viral na amostra. A janela de testagem é muito relevante portanto
Sabemos que depois de algum tempo, é possível que a pcr já não consiga detectar tão bem a presença do RNA viral na amostra. A janela de testagem é muito relevante portanto
Mas me chamou a atenção ter essa questão com os testes de antigeno. Vou chamar aqui alguns especialistas para acompanhar mais discussões: @AndersonBrito_ @LeSarturiP @LaroccaRA @bardinidouglas @EthelMaciel @PaolaResende1 @GrafTiago
De qualquer forma, o aviso da @prefeiturabelem é importante: se tiver suspeita, algum sintoma gripal ou possibilidade de exposição, faça um isolamento bem feito, e notifique as agências de sua cidade para testagem e maiores informações
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