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10 Nov, 7 tweets, 6 min read
Imaginez.
Vous êtes une équipe de chercheurs qui fait une étude sur le covid. Pour cela, vous prenez 26823 personnes et leur faites passer un test sérologique.
Ce test a une sensibilité de 87% et une spécificité de 97,5%.
La spécificité, c'est la probabilité d'avoir un test
[1/5
négatif chez un non infecté.
Combien étaient atteints selon l'étude elle-même ? Environ 4%.
Soit 1073 personnes sur les 26823.
Comme la sensibilité est de 87%, 933 auront une sérologie positive. Les autres, 140, sont des "faux-négatifs".
En tant qu'auteurs, avisés,
[2/5]
vous remarquez que les faux-négatifs ne représentent que 1% du total des sérologies négatives. 👍
Selon la valeur de spécificité, chez un non-infecté, donc chez environ 26823 - 1073 = 25750 personnes, 2,5% ne seront pas négatifs alors qu'ils auraient dû l'être.
Mais 2,5% de
[3/5]
25750, ça fait tout de même 644 personnes, hein.

Donc dans votre étude, dans les personnes qui ont une sérologie positive, il y a plus de personnes chez qui cette sérologie est un faux-positif (643), que de personnes (447) chez qui cette sérologie est un vrai positif !!!
[4/5]
Imaginez que, sans remarquer cet énorme problème de faux-positifs plus nombreux que les vrais, votre étude passe le peer-reviewing et soit publiée dans JAMA.
Imaginez. 👇
[5/5]
jamanetwork.com/journals/jamai…
Je reprends ci-dessus des éléments de F. Perry Wilson @fperrywilson, professeur de médecine agrégé de l'Université de Yale, qui a confirmé mon intuition qu'il y avait un "sophisme du procureur" sur cette étude. Et qui en a fait un très bon article :
methodsmanmd.medium.com/is-long-covid-…

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12 Nov
Un article dans Science Media Center demande à 3 experts de réagir à l'étude française du JAMA (Matta, Lemogne et al.) concernant les causes du covid long.
#covidlong #apresJ20 @LongCovid @apresj20 [thread]
sciencemediacentre.org/expert-reactio…
Sont interrogés :
🔹Dr David Strain, Maître de conférences clinique principal, Université d'Exeter
🔹Prof Kevin McConway, Professeur émérite de statistique appliquée, The Open University
🔹Dr Jeremy Rossman, Maître de conférences honoraire en virologie, Université du Kent
.../...
D. Strain : “It misses a very simple explanation. Whether the participants had COVID or not, there is no doubt that they were experiencing some illness that they attributed to COVID. There are multiple viral illness other than COVID that cause “long symptoms””.
.../...
Read 31 tweets
11 Nov
"Il y a deux défauts rédhibitoires dans la conception de l'étude [de Mappa, Lemogne et al. publiée dans JAMA], dont un seul suffirait à rendre le travail inutile".
Poke @apresj20 @Food_reward @Jerome_Larche @JMarieRenaudin
thesciencebit.net/2021/11/11/no-…
"L'expérience antérieure peut influencer les symptômes actuels, mais les symptômes actuels peuvent influencer (le souvenir) de l'expérience antérieure. Il n'y a tout simplement aucun moyen de savoir ce qui se passe."
Poke @pascale_santi @sfoucart
"les chercheurs n'ont pas vérifié d'autres infections, de sorte que leur conclusion selon laquelle les symptômes de longue durée de ces personnes doivent avoir été causés par des «croyances» tombe à plat"
"Ils ne peuvent pas déduire une explication de « croyance à la maladie »
Read 4 tweets
11 Nov
[corrélation CL/ infection - suite]
L'article du Monde sur l'étude Matta et al. publiée dans JAMA évoque un argument de C. Lemogne. ⬇️
Les auteurs disent ne pas trouver non plus de corrélation significative entre ce critère combiné et les symptômes.
Etudions l'argument. Image
C. Lemogne fait référence à ce tableau, et à la nouvelle colonne Model 7 : Image
Pour que cet argument soit décisif, il faudrait que la spécificité du critère "test biologique (PCR, test rapide) et/ou diagnostic d'un médecin" soit meilleure que celle des tests sérologiques.
Or les auteurs de l'étude n'évaluent ni la spécificité combinée de ce critère,
Read 10 tweets
10 Oct
Compte-rendu Conférence COVID à l'Institut Pasteur 29/09-01/10/2021. [thread] 👇
Après-midi du jeudi 30 septembre 2021, consacrée au covid long.
#ApresJ20 #CovidLong #LongCovid
Le compte rendu ne sera pas exhaustif : je ne vais évoquer que les aspects nouveaux/importants.
1/n
Partie 1: "Viral persistence and long Covid"
1re intervenante : Mayssam Nehme
Hôpitaux Universitaires de Genève, Suisse
"Clinical presentation of long Covid (on-site)"
2/n
Elle évoque les différentes définitions du covid long Long Covid/ PASC (post acute sequelae of covid), PACS (post-acute covid syndrome), post Covid condition,... Puis les symptômes à 7-9 mois dans son étude depuis une cohorte de malades symptomatiques, et vs groupe contrôle.
3/n
Read 61 tweets
9 Oct
#ApresJ20 *Sondage*
Pour éviter les malaises post-effort qui touchent certains malades Covid long quand ils dépassent un seuil physiologique, et qui relancent une aggravation de symptômes, les experts, avec l'expérience de l'encéphalomyélite myalgique, préconisent le "pacing".👇
Le "pacing" désigne la méthode de rééducation très progressive et prudente pour réadapter le corps à l'effort physique et intellectuel, mais en contrôlant précisément les durées et intensités limites à ne pas dépasser pour éviter les plus grosses rechutes.
👇
Mais il n'existe pas vraiment de mot en français pour traduire cette gestion des "batteries" et cet ajustement des activités à l’enveloppe énergétique
disponible.👇
Read 4 tweets
4 Oct
"Les malades Covid long ont des symptômes, mais quand on fait des examens on ne trouve rien !"
Vraiment ?
Voici un petit tour d'horizon de la physiopathologie objectivable et des biomarqueurs courants du Covid long :
[thread] #ApresJ20 #LongCovid
[1/10]
Hypométabolismes dans le système nerveux central corrélés aux troubles neurologiques, observés par PET-SCAN cérébral : doi.org/10.1016/j.medn…
[2/10]
Hypermétabolisme dans certains organes, observé par PET-SCAN corps entier :
➡️doi.org/10.1007/s00259…
[3/10]
Read 11 tweets

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