Recientemente he tenido que dar información a los medios acerca de la variante #OMICRON como afectaría la eficacia de las vacunas y si puede ser más severa o letal. Abro 🧵para hablar de estos temas pero desgraciadamente, aún no tenemos certeza de nada y las evidencias son pocas
1/ Contexto: Soy experto en Genómica y Bioinformática y desde el inicio de la pandemia he estado colaborando para caracterizar al virus desde su entrada a México. Soy investigador del @ibt_unam soy Presidente de la @ACMor_Morelos y miembro del @CoViGenMex.
2/ El 1er caso de #OMICRON en México se confirmó recientemente (3 dic) y desde entonces a levantado la alarma en todo el país. El caso (H de 51 años, vacuna Pfizer 2 dosis) fue confirmado tanto por diagnóstico de qPCR y secuenciación del genoma del virus. gob.mx/salud/prensa/5…
3/ La nueva variante fue vista por 1era vez en Sudáfrica, donde ha desplazado a #Delta y sus sublinajes. Además de que presenta un número inusual de mutaciones. Varias las comparte con las otras variantes de preocupación pero también tiene muchas únicas
covariants.org/variants/21K.O…
4/ De las posibles explicaciones de como mutó tanto y en tan poco tiempo es que pudo haber pasado por pacientes con VIH. Existen algunos estudios que reportan casos donde el virus evoluciona rápidamente en estos casos y surgen mutaciones que ayudan a escapar de los anticuerpos
5/ Algunas de esas mutaciones han sido observadas en #OMICRON y otras variantes y de manera experimental se prueba la capacidad de escape a los anticuerpos. Aquí un par de referencias:

ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P…

medrxiv.org/content/10.110…
6/ También preocupa la mayor transmisión de #OMICRON que aunque hay pocos datos y casos en el mundo, fuera de África, se advierte que puede ser 3-4 veces + transmisible que #Delta. Esto gracias a las mutaciones que aumentan la afinidad con el receptor ACE2
scienceopen.com/hosted-documen…
7/ Recientemente también se han hecho experimentos para verificar si la capacidad neutralizante de los anticuerpos generados por las vacunas han bajado su eficacia y eficiencia. Para este tema recomiendo el siguiente hilo:
8/ El resumen, lo que nos dice el hilo y las publicaciones citadas es que se espera una caída de hasta 40 veces de la capacidad neutralizante de los anticuerpos generados por varias vacunas. Sin embargo, hay que recordar que esto es a nivel experimental y...
9/ Los anticuerpos además de que no son la única respuesta del sistema inmune (recordemos los LinfocitosT) pueden ajustarse rápidamente para reconocer a #OMICRON. Lo que podriamos suponer con esto es que la eficacia de las vacunas podría reducirse ~10-14% para evitar casos graves
10/ O incluso podrían reducir la eficacia de las vacunas ~40-60% para evitar síntomas en general con lo que el número de asintomáticos sería bastante menor. De alguna manera esto podría ser buena noticia ya que con la presencia de síntomas es muy posible que la gente se resguarde
11/Evitando salir a contagiar como pasa con los asintomáticos. Pero lo más interesante de los estudios mencionados es que un refuerzo (booster) puede ayudar mucho y subir hasta un 25% la neutralización contra #OMICRON, al menos con la vacuna de Pfizer. Habrá que esperar más datos
12/ Por lo tanto, es importante recordar el modelo del queso suizo que nos recuerda que es la suma de todas las medidas de seguridad lo que nos dará mayor éxito para no contagiarnos.
14/ En el @CoViGenMex seguiremos vigilando y reportando donde y cuando aparecen más casos de #OMICRON

RT y like por favor!

mexcov2.ibt.unam.mx:8080/COVID-TRACKER/

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12 Jul
Existe mucha incertidumbre en la gente que ha sido vacunada y si estarán protegidos contra las nuevas variantes. Abro 🧵 compartir algunas reflexiones al respecto. Contexto: soy un científico experto en Genómica/Bioinformática que participa en la vigilancia genómica @CoViGenMex
1/El virus ha ido cambiando desde que salió de China. Estos cambios se llaman mutaciones y alteran la forma de sus proteínas. La proteína que más se ha estudiado es la proteína S (spike) que es la llave que usa para entrar en las células y es uno de los blancos de los anticuerpos
2/El primer cambio que se observó fue el llamado D614G. Ese cambio de aminoácido en la posición 614 de la proteína S, le permitió una mayor transmisión y generar mayores cargas virales. Fue la primera variante en todo el mundo. Cuando el virus llegó a México ya tenía dicho cambio
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28 Jun
¿Cuáles son los retos a los que nos enfrentamos actualmente con la pandemia y que debemos atender con urgencia? Abro 🧵para abordar varios flancos que se deben cubrir y para los cuales, la ciencia siempre dará información valiosa para tomar decisiones.
1/El regreso a clases es posiblemente una decisión basada más en presión social, aunque también es muy claro que no podemos dejar que los niños se retrasen en su educación y dejen de tener actividades importantes para un infante y su desarrollo mental, social y psicomotriz
2/Sin embargo, hay que atender primero lo más urgente que es la seguridad y salud de los niños y maestros. Al no haber vacunas para los menores de 12 años y que muchos de los padres de estos menores posiblemente no estén vacunados aún, podría generar un gran riesgo para ambos
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20 Jun
🧵sobre 3 edos que muestran un repunte importante de núm. de casos reportados de #SARSCoV2 hasta la fecha. Estos son resultados de la vigilancia genómica que hacemos en el @CoViGenMex para seguir el comportamiento de las variantes que circulan en todo el país. No bajen la guardia
1/#QRoo es uno de los estados que tiene un repunte importante y posiblemente donde hay mayor incremento en el número de casos con variantes. Vemos que las variantes Alfa (B.1.1.7 [UK]) y Gamma (P.1 [Brasil]) están ganando terreno a la variante que predomina en el país (B.1.1.519)
2/#Yucatan presenta una tendencia similar donde de igual manera, la variante predominante parece ser desplazada principalmente por la variante Gama (P.1). Aunque no es claro si esto se mantendrá, es algo que genera preocupación y se han solicitado más muestras de este estado
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7 May
Hilo para hablarles del trabajo en el que participo y que nos permite saber si hay variantes del virus #SARSCoV2 en México. No se preocupen, no usaré muchos términos técnicos y espero poderles transmitir la importancia del trabajo y del esfuerzo de muchos cientificos involucrados
1/En otros hilos he comentado que varios investigadores nos prepararmos para la llegada del virus desde enero del 2020. El 27 de febrero, se detectó el primer caso #COVID19 por el @RespiraINER y junto con el InDRE, se caracterizó el genoma del virus. Nota: dgcs.unam.mx/boletin/bdbole…
2/ Un genoma es el conjunto de información genética de cualquier organismo. Gracias a las tecnologías de secuenciación de ADN/ARN, podemos conocer dicha información de manera rápida y precisa. Con esa información se puede trazar su evolución y los cambios o mutaciones que acumula
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7 Jan
A petición de @G05Vi les traigo un🧵de tecnologías de secuenciación de ADN y cómo han servido para caracterizar al #SARSCoV2
(Contexto:soy investigador de la UNAM, experto en Genómica y Bioinformática. Del 2020 a la fecha dedico mucho tiempo al estudio del #SARSCoV2 y #COVID19)
1/El ADN (Ácido Desoxirribonucleico) es una molécula que se en todos los organismos biológicos. Su importancia es que en dicha molécula reside toda la información genética de dichos organismos. Básicamente el ADN es el manual que tiene todas las instrucciones de funcionamiento 🧬
2/A finales de 1800s, Friedrich Miescher, un médico/biólogo suizo fue el primero en aislsar ácidos nucleicos q los cuales llamó nucleina. Desde entonces la ciencia ha avanzado mucho, pero no quiero entrar mucho en la historia del ADN sino en como se "lee" y que info nos da
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5 Jan
Hilo acerca de las vacunas y las decisiones que se están tomando para la aplicación de las mismas.

(Contexto: soy investigador de la UNAM, experto en Genómica y Bioinformática. Durante todo 2020 he dedicado mucho tiempo al estudio del #SARSCoV2 y #COVID19)
Desde la fase 1/2 de las vacunas he seguido los avances de las mismas. Si bien la seguridad y eficacia han sido probadas en un número reducido de personas, hay que recordar que su uso es de emergencia

acmor.org/articulo/la-ca…
acmor.org/articulo/la-ca…
acmor.org/articulo/covid…
2/Por lo tanto, la seguridad y efectividad a largo plazo es algo que se continúa evaluando y seguimos en medio de la fase 3. Los resultados preliminares han permitido que las agencias regulatorias como la FDA y COFEPRIS autoricen el uso de estas vacunas. Aún así, no hay garantías
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