1/80
Mardi dernier, O. VERAN a été auditionné au Sénat à propos du pass vaccinal.
De nombreux aspects de la situation épidémique actuelle ont été abordés, et il me semble important de revenir sur certains d'entre eux pour éviter les mauvaises surprises...
Mardi dernier, O. VERAN a été auditionné au Sénat à propos du pass vaccinal.
De nombreux aspects de la situation épidémique actuelle ont été abordés, et il me semble important de revenir sur certains d'entre eux pour éviter les mauvaises surprises...
2/80
Tout d'abord dans l'extrait suivant au début de l'audition.
O. VERAN utilise encore les éléments de langages de "progressivité de levée des mesures" pour éviter un nouveau rebond épidémique.
Après >2 ans, et 5 vagues, ces éléments de com deviennent grotesques...
Tout d'abord dans l'extrait suivant au début de l'audition.
O. VERAN utilise encore les éléments de langages de "progressivité de levée des mesures" pour éviter un nouveau rebond épidémique.
Après >2 ans, et 5 vagues, ces éléments de com deviennent grotesques...
3/80
Une épidémie est un phénomène qui s'auto-amplifie.
La levée des mesures aura beau être aussi progressive que possible, cela n'évitera pas un nouveau rebond épidémique si les conditions environnementales restent inchangées, c'est-à-dire...
Une épidémie est un phénomène qui s'auto-amplifie.
La levée des mesures aura beau être aussi progressive que possible, cela n'évitera pas un nouveau rebond épidémique si les conditions environnementales restent inchangées, c'est-à-dire...
4/80
Si les mécanismes de transmission virale ne sont pas entravés :
A) masques FFP2 contre l'émission/inhalation d'aérosols contaminés
B) ventilation normative des lieux clos
C) télétravail pour ↘️ la fréquentation des lieux clos/transports
D) Tester/tracer/isoler
...
Si les mécanismes de transmission virale ne sont pas entravés :
A) masques FFP2 contre l'émission/inhalation d'aérosols contaminés
B) ventilation normative des lieux clos
C) télétravail pour ↘️ la fréquentation des lieux clos/transports
D) Tester/tracer/isoler
...
5/80
Dans l'extrait, O. VERAN évoque aussi "la forte ↘️ de circulation virale"...
Après 2 ans de pandémie, il est étonnant de ne toujours pas comprendre que les données épidémiologiques obtenues via les tests de dépistage/diagnostic ne reflètent pas la circulation virale réelle !
Dans l'extrait, O. VERAN évoque aussi "la forte ↘️ de circulation virale"...
Après 2 ans de pandémie, il est étonnant de ne toujours pas comprendre que les données épidémiologiques obtenues via les tests de dépistage/diagnostic ne reflètent pas la circulation virale réelle !
6/80
On savait déjà, et c'est l'évidence même, que les cas recensés via ces tests ne représentent qu'une fraction des contas réelles.
L'ICL 🇬🇧 estime que les cas recensés ne représentent que le 1/3 des contaminations réelles :
On savait déjà, et c'est l'évidence même, que les cas recensés via ces tests ne représentent qu'une fraction des contas réelles.
L'ICL 🇬🇧 estime que les cas recensés ne représentent que le 1/3 des contaminations réelles :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1474214231373402131?s=20&t=woqfNjRdqtLUqN3ASugVOw
7/80
Mais les données épidémio obtenues via les tests de dépistage/diagnostic peuvent également nous induire en erreur sur les TENDANCES !
Seul le UK 🇬🇧 dispose des données permettant de documenter ce problème...
Mais les données épidémio obtenues via les tests de dépistage/diagnostic peuvent également nous induire en erreur sur les TENDANCES !
Seul le UK 🇬🇧 dispose des données permettant de documenter ce problème...
8/80
On peut critiquer la stratégie sanitaire britannique, mais il faut reconnaître l'exceptionnelle qualité et quantité de leurs données épidémiologiques et génomiques.
Littéralement "exceptionnelle" puisque c'est le seul pays à en disposer...
On peut critiquer la stratégie sanitaire britannique, mais il faut reconnaître l'exceptionnelle qualité et quantité de leurs données épidémiologiques et génomiques.
Littéralement "exceptionnelle" puisque c'est le seul pays à en disposer...
9/80
L'annonce de l'arrêt des publications ET des enquêtes épidémiologiques à partir d'avril au UK 🇬🇧 est d'ailleurs une lourde perte mondiale pour la documentation de cette pandémie et l'acquisition de nouvelles connaissances scientifiques en épidémio/virologie ! 🤷♂️
L'annonce de l'arrêt des publications ET des enquêtes épidémiologiques à partir d'avril au UK 🇬🇧 est d'ailleurs une lourde perte mondiale pour la documentation de cette pandémie et l'acquisition de nouvelles connaissances scientifiques en épidémio/virologie ! 🤷♂️
10/80
Mais avant la disparition de ces ressources, profitons-en, et tout particulièrement des enquêtes épidémiologiques ("infection survey") réalisées par l'ONS 🇬🇧 (équivalent britannique de la DREES) :
ons.gov.uk/peoplepopulati…
Mais avant la disparition de ces ressources, profitons-en, et tout particulièrement des enquêtes épidémiologiques ("infection survey") réalisées par l'ONS 🇬🇧 (équivalent britannique de la DREES) :
ons.gov.uk/peoplepopulati…
11/80
Pour bien comprendre le problème, il faut revenir aux sources des données épidémiologiques :
A) les tests de dépistage (population générale) et diagnostic (malades).
Ces tests sont limités à la seule fraction de population qui s'y soumet...
Pour bien comprendre le problème, il faut revenir aux sources des données épidémiologiques :
A) les tests de dépistage (population générale) et diagnostic (malades).
Ces tests sont limités à la seule fraction de population qui s'y soumet...
12/80
Ils sont donc intrinsèquement lacunaires (également pour des raisons logistiques... On ne peut pas tester tout le monde tout le temps).
Ils sont également dépendant de la politique de dépistage = qui doit être testé ? = biais d'échantillonnage...
Ils sont donc intrinsèquement lacunaires (également pour des raisons logistiques... On ne peut pas tester tout le monde tout le temps).
Ils sont également dépendant de la politique de dépistage = qui doit être testé ? = biais d'échantillonnage...
13/80
Ils sont également dépendant du type de tests utilisés !
La détection du virus est d'autant moins bonne qu'on utilise des tests de moins en moins sensibles :
RT-PCR nasopharyngée > RT-PCR salivaire > TAG nasopharyngé > TAG salivaire > autotest nasal...
Ils sont également dépendant du type de tests utilisés !
La détection du virus est d'autant moins bonne qu'on utilise des tests de moins en moins sensibles :
RT-PCR nasopharyngée > RT-PCR salivaire > TAG nasopharyngé > TAG salivaire > autotest nasal...
14/80
B) Les enquêtes épidémiologiques sur échantillons de population !
C'est la 2ème source de données épidémiologiques (le UK étant le seul pays à la déployer à l'échelle nationale et avec une fréquence hebdomadaire, associant RT-PCR, séquençage et sérologies) !!!...
B) Les enquêtes épidémiologiques sur échantillons de population !
C'est la 2ème source de données épidémiologiques (le UK étant le seul pays à la déployer à l'échelle nationale et avec une fréquence hebdomadaire, associant RT-PCR, séquençage et sérologies) !!!...
15/80
Ces enquêtes s'affranchissent des limitations associées aux tests de dépistage/diagnostic.
Elles reflètent la circulation virale RÉELLE, estimée à partir d'échantillons représentatifs des classes d'âges, régions, mode de vie...
Ces enquêtes s'affranchissent des limitations associées aux tests de dépistage/diagnostic.
Elles reflètent la circulation virale RÉELLE, estimée à partir d'échantillons représentatifs des classes d'âges, régions, mode de vie...
16/80
Contrairement à nous, limités à la seule source biaisée des tests de dépistage/diagnostic, le UK 🇬🇧 s'appuie aussi sur ces enquêtes épidémiologiques pour documenter le plus fidèlement possible son épidémie.
Ces enquêtes constituent leur "pillar 4" :
gov.uk/government/pub…
Contrairement à nous, limités à la seule source biaisée des tests de dépistage/diagnostic, le UK 🇬🇧 s'appuie aussi sur ces enquêtes épidémiologiques pour documenter le plus fidèlement possible son épidémie.
Ces enquêtes constituent leur "pillar 4" :
gov.uk/government/pub…
17/80
Dans l'enquête publiée ce jour par l'ONS, on trouve le % de population testée positive pour SARS-CoV-2 chaque semaine depuis février 2021, jusqu'au 16 ou 17 février 2022, avec un découpage des données pour les 4 pays du UK 🇬🇧
ons.gov.uk/peoplepopulati…
Dans l'enquête publiée ce jour par l'ONS, on trouve le % de population testée positive pour SARS-CoV-2 chaque semaine depuis février 2021, jusqu'au 16 ou 17 février 2022, avec un découpage des données pour les 4 pays du UK 🇬🇧
ons.gov.uk/peoplepopulati…
18/80
J'ai mis en parallèle l'évolution de ce % avec les taux d'incidence mesurés dans ces mêmes 4 pays, mais à partir des seuls tests de dépistage/diagnostic (ce qui correspond aux chiffres officiels publiés chaque jour)
Cf. ourworldindata.org/local-covid-uk
J'ai mis en parallèle l'évolution de ce % avec les taux d'incidence mesurés dans ces mêmes 4 pays, mais à partir des seuls tests de dépistage/diagnostic (ce qui correspond aux chiffres officiels publiés chaque jour)
Cf. ourworldindata.org/local-covid-uk
19/80
ATTENTION : l'objectif de cette comparaison n'est pas quantitatif puisqu'on compare des taux d'incidence (nouvelles infections sur une période donnée), et une prévalence (% de population positive sur une période donnée).
L'objectif est de comparer les TENDANCES...
ATTENTION : l'objectif de cette comparaison n'est pas quantitatif puisqu'on compare des taux d'incidence (nouvelles infections sur une période donnée), et une prévalence (% de population positive sur une période donnée).
L'objectif est de comparer les TENDANCES...
20/80
On commence avec l'Angleterre (pays le plus peuplé du UK, et qui pèse donc le plus lourd dans les données épidémiologiques britanniques).
En 🔵 = taux d'incidence via les seuls tests de dépistage/diagnostic (par jour / 100k hab)
En 🟠= enquête épidémio (% de pop +)
On commence avec l'Angleterre (pays le plus peuplé du UK, et qui pèse donc le plus lourd dans les données épidémiologiques britanniques).
En 🔵 = taux d'incidence via les seuls tests de dépistage/diagnostic (par jour / 100k hab)
En 🟠= enquête épidémio (% de pop +)
21/80
Plusieurs infos à tirer des données récentes (associées à Omicron) :
A) La ↘️ actuelle de la circulation virale est surestimée d'un facteur x2,7 par les données d'incidence ! (soit 170% plus marquée qu'elle ne l'est réellement)...
Plusieurs infos à tirer des données récentes (associées à Omicron) :
A) La ↘️ actuelle de la circulation virale est surestimée d'un facteur x2,7 par les données d'incidence ! (soit 170% plus marquée qu'elle ne l'est réellement)...
22/80
La circulation virale RÉELLE reste donc très nettement supérieure au plus hauts niveaux observés depuis le début de l'épidémie...
Alors que via les tests de dépistage/diagnostic, on a l'impression qu'elle est revenue à des niveaux très faibles 🤷♂️ ERREUR....
La circulation virale RÉELLE reste donc très nettement supérieure au plus hauts niveaux observés depuis le début de l'épidémie...
Alors que via les tests de dépistage/diagnostic, on a l'impression qu'elle est revenue à des niveaux très faibles 🤷♂️ ERREUR....
23/80
B) On voit également que l'expansion d'Omicron dans la population n'est pas aussi forte qu'on pouvait le prétendre.
Avec les tests 🔵, le pic Omicron a été 3,96x plus haut que le pic Delta.
Avec l'enquête 🟠, il n'est que 3,39x plus élevé...
B) On voit également que l'expansion d'Omicron dans la population n'est pas aussi forte qu'on pouvait le prétendre.
Avec les tests 🔵, le pic Omicron a été 3,96x plus haut que le pic Delta.
Avec l'enquête 🟠, il n'est que 3,39x plus élevé...
24/80
La "surexpansion" d'Omicron a donc été surestimée de 23,3% à cause des tests de dépistage/diagnostic, et il n'y a pas eu de contamination massive de toute la population (cf. story telling sur l'immunité collective)...
La "surexpansion" d'Omicron a donc été surestimée de 23,3% à cause des tests de dépistage/diagnostic, et il n'y a pas eu de contamination massive de toute la population (cf. story telling sur l'immunité collective)...
25/80
Ceci renforce aussi la remise en cause du story telling sur la "bénignité" d'Omicron, qui n'a finalement pas induit un ratio cas graves/infections aussi faible qu'on a pu le prétendre !
On en reparlera plus loin...
Ceci renforce aussi la remise en cause du story telling sur la "bénignité" d'Omicron, qui n'a finalement pas induit un ratio cas graves/infections aussi faible qu'on a pu le prétendre !
On en reparlera plus loin...
26/80
On continue avec le Pays de Galles.
Là, le biais est encore plus marqué.
La ↘️ apparente de circulation virale est surestimée d'un facteur x5,9 (soit 491% !!!) 🤷♂️.
Alors qu'elle semble revenue à bas niveau🔵, elle reste en fait supérieure à toutes les vagues précédentes 🟠
On continue avec le Pays de Galles.
Là, le biais est encore plus marqué.
La ↘️ apparente de circulation virale est surestimée d'un facteur x5,9 (soit 491% !!!) 🤷♂️.
Alors qu'elle semble revenue à bas niveau🔵, elle reste en fait supérieure à toutes les vagues précédentes 🟠
27/80
On note aussi que les tests ont conduit à surestimer la surexpansion d'Omicron de 60% !
Ratio pic Omicron/Delta via tests 🔵 = 3,48
Ratio pic Omicron/Delta via enquête 🟠 = 2,17
Omicron n'a pas non plus "infesté" toute la population Galloise ! 🤷♂️
On note aussi que les tests ont conduit à surestimer la surexpansion d'Omicron de 60% !
Ratio pic Omicron/Delta via tests 🔵 = 3,48
Ratio pic Omicron/Delta via enquête 🟠 = 2,17
Omicron n'a pas non plus "infesté" toute la population Galloise ! 🤷♂️
28/80
On passe à l'Irlande du Nord.
Là encore, biais important qui fausse la perception de circulation virale RÉELLE, dont la ↘️ est surestimée d'un facteur x2,6 (soit 156%) !
Alors qu'elle semble se rapprocher des niveaux "historiques" via 🔵, elle reste en fait très élevée 🟠
On passe à l'Irlande du Nord.
Là encore, biais important qui fausse la perception de circulation virale RÉELLE, dont la ↘️ est surestimée d'un facteur x2,6 (soit 156%) !
Alors qu'elle semble se rapprocher des niveaux "historiques" via 🔵, elle reste en fait très élevée 🟠
29/80
Quant à la surexpansion d'Omicron, elle semblait être 4,34x plus importante que celle de Delta via les tests 🔵 ; alors qu'elle n'a été que 3,39x plus importante 🟠.
Soit une surestimation de 28,3%.
Là aussi, Omicron n'a pas du tout infecté/immunisé toute la population.
Quant à la surexpansion d'Omicron, elle semblait être 4,34x plus importante que celle de Delta via les tests 🔵 ; alors qu'elle n'a été que 3,39x plus importante 🟠.
Soit une surestimation de 28,3%.
Là aussi, Omicron n'a pas du tout infecté/immunisé toute la population.
30/80
Puis on passe à l'Ecosse où le biais est encore plus grave puisque la circulation virale semble ↘️↘️ via les tests 🔵, alors qu'en réalité elle ↗️↗️ 🟠
(il faudra voir si cela est lié aux "nouveaux" lignages BA.1.1 et BA.2)...
Puis on passe à l'Ecosse où le biais est encore plus grave puisque la circulation virale semble ↘️↘️ via les tests 🔵, alors qu'en réalité elle ↗️↗️ 🟠
(il faudra voir si cela est lié aux "nouveaux" lignages BA.1.1 et BA.2)...
31/80
Quant à la surexpansion d'Omicron, elle n'a pas été surestimée (seulement 3% d'écart entre les ratios des pics Omicron/Delta via tests 🔵 et via enquête 🟠).
Donc là non plus, Omicron n'a pas massivement infecté la population écossaise.
Quant à la surexpansion d'Omicron, elle n'a pas été surestimée (seulement 3% d'écart entre les ratios des pics Omicron/Delta via tests 🔵 et via enquête 🟠).
Donc là non plus, Omicron n'a pas massivement infecté la population écossaise.
32/80
D'ailleurs à ce propos, on ne voit absolument pas d'accélération de séroconversion (immunisation) anti-N dans la population britannique ! 🤷♂️
Anticorps anti-N = acquis uniquement via infection.
ATTENTION : décalage de ~10 jours entre infections et impact sur séroprévalence
D'ailleurs à ce propos, on ne voit absolument pas d'accélération de séroconversion (immunisation) anti-N dans la population britannique ! 🤷♂️
Anticorps anti-N = acquis uniquement via infection.
ATTENTION : décalage de ~10 jours entre infections et impact sur séroprévalence
33/80
Cette 1ère partie montre à quel point on peut se méprendre sur la circulation virale réelle, si on se base uniquement sur les données issues des tests de dépistage/diagnostic.
Autant de pertinence en moins pour les modélisations... et les décisions politiques.
Cette 1ère partie montre à quel point on peut se méprendre sur la circulation virale réelle, si on se base uniquement sur les données issues des tests de dépistage/diagnostic.
Autant de pertinence en moins pour les modélisations... et les décisions politiques.
34/80
Il faut bien garder à l'esprit que la circulation virale se poursuit donc à haut niveau, avec une nouvelle vague en cours de construction avec de nouveau variants, notamment BA.1.1 (équivalent de "Detla Plus" pour Omicron), et BA.2 ("cousin" d'Omicron)...
Il faut bien garder à l'esprit que la circulation virale se poursuit donc à haut niveau, avec une nouvelle vague en cours de construction avec de nouveau variants, notamment BA.1.1 (équivalent de "Detla Plus" pour Omicron), et BA.2 ("cousin" d'Omicron)...
35/80
La France ne dispose pas de données génomiques robustes (d’autant plus qu'elle ne s'appuie que sur les tests de dépistage/diagnostic dont l'activité est revenue aux niveaux les plus faibles observés uniquement durant l'été jusqu'ici) :
La France ne dispose pas de données génomiques robustes (d’autant plus qu'elle ne s'appuie que sur les tests de dépistage/diagnostic dont l'activité est revenue aux niveaux les plus faibles observés uniquement durant l'été jusqu'ici) :
36/80
C'est à nouveau du côté du UK qu'on trouve des données, dans les "technical briefing" du UKHSA 🇬🇧, montrant que le variant Omicron (BA.1) est désormais minoritaire, en voie de remplacement par BA.1.1 et surtout BA.2
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl…
C'est à nouveau du côté du UK qu'on trouve des données, dans les "technical briefing" du UKHSA 🇬🇧, montrant que le variant Omicron (BA.1) est désormais minoritaire, en voie de remplacement par BA.1.1 et surtout BA.2
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl…
37/80
Je rappelle que BA.2 est aussi distant du variant Omicron (BA.1), qu'Omicron était distant de Delta !!!
Je vous recommande vivement la lecture de l'excellent billet de blog du Dr. Marc GOZLAN à propos de BA.2... Tout y est !
Je rappelle que BA.2 est aussi distant du variant Omicron (BA.1), qu'Omicron était distant de Delta !!!
Je vous recommande vivement la lecture de l'excellent billet de blog du Dr. Marc GOZLAN à propos de BA.2... Tout y est !
https://twitter.com/MarcGozlan/status/1494707181060599812?s=20&t=Zjr2Mod4kXmo3XffIg1bmQ
38/80
Outre une transmissibilité > à celle d'Omicron, BA.2 est aussi plus pathogène que lui (infecte les alvéoles pulmonaires et provoque de grands syncytia comme Delta).
Non monsieur VERAN, les virus n'évoluent pas pour "devenir plus transmissible mais nous faire moins mal"...
Outre une transmissibilité > à celle d'Omicron, BA.2 est aussi plus pathogène que lui (infecte les alvéoles pulmonaires et provoque de grands syncytia comme Delta).
Non monsieur VERAN, les virus n'évoluent pas pour "devenir plus transmissible mais nous faire moins mal"...
39/80
BA.2 dispose aussi d'un échappement immunitaire accru...
Ce qui nous amène au 2ème (et dernier) extrait de l'audition d'O. VERAN au Sénat...
BA.2 dispose aussi d'un échappement immunitaire accru...
Ce qui nous amène au 2ème (et dernier) extrait de l'audition d'O. VERAN au Sénat...
40/80
Cet extrait résume bien la problématique actuelle : la population "en a marre"... Mais la biologie, le virus et notre système immunitaire s'en fichent pas mal 🤷♂️
Plusieurs points importants à garder à l'esprit pour la suite...
Cet extrait résume bien la problématique actuelle : la population "en a marre"... Mais la biologie, le virus et notre système immunitaire s'en fichent pas mal 🤷♂️
Plusieurs points importants à garder à l'esprit pour la suite...
41/80
Nous faisons face à un Coronavirus à transmission et tropisme respiratoires.
C'est la combinaison la plus délicate à gérer pour notre système immunitaire car elle implique une immunité muqueuse très peu robuste et un virus hautement évolutif...
Nous faisons face à un Coronavirus à transmission et tropisme respiratoires.
C'est la combinaison la plus délicate à gérer pour notre système immunitaire car elle implique une immunité muqueuse très peu robuste et un virus hautement évolutif...
42/80
Je ne redévelopperai pas ces points mais on sait que la protection contre les formes graves de COVID nécessite environ 2x moins d'anticorps neutralisants que la protection contre les formes ORL simples.
Déjà évoqué notamment ici :
Je ne redévelopperai pas ces points mais on sait que la protection contre les formes graves de COVID nécessite environ 2x moins d'anticorps neutralisants que la protection contre les formes ORL simples.
Déjà évoqué notamment ici :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1445483363523960839?s=20&t=-Pe8MiFsbueyXor3gEDb2A
43/80
Notre production d'anticorps neutralisants ↘️ à mesure qu'on s'éloigne de la date d'immunisation (c'est un phénomène physiologique incontournable d'auto-régulation de notre système immunitaire).
A mesure que cette production ↘️ notre protection disparaît...
Notre production d'anticorps neutralisants ↘️ à mesure qu'on s'éloigne de la date d'immunisation (c'est un phénomène physiologique incontournable d'auto-régulation de notre système immunitaire).
A mesure que cette production ↘️ notre protection disparaît...
44/80
Et comme le seuil de protection contre les formes ORL simples est ~2x plus élevé que celui contre les formes graves, la protection contre les formes ORL simples disparaît plus vite que la protection contre les formes graves 🤷♂️
Déjà évoqué ici :
Et comme le seuil de protection contre les formes ORL simples est ~2x plus élevé que celui contre les formes graves, la protection contre les formes ORL simples disparaît plus vite que la protection contre les formes graves 🤷♂️
Déjà évoqué ici :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1398320081420099585?s=20&t=gMb9jqJZavbbTL9UyDY3bw
45/80
A l'échelle populationnelle (niveau auquel on évalue l'efficacité vaccinale), cela se traduit par une ↘️ bcp plus rapide de l'efficacité contre les formes ORL simples, que contre les formes graves.
Les données du PHE 🇬🇧 illustrent cela :
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl…
A l'échelle populationnelle (niveau auquel on évalue l'efficacité vaccinale), cela se traduit par une ↘️ bcp plus rapide de l'efficacité contre les formes ORL simples, que contre les formes graves.
Les données du PHE 🇬🇧 illustrent cela :
assets.publishing.service.gov.uk/government/upl…
46/80
Cela était également annoncé par les modélisations de l'ICL 🇬🇧, montrant une ↘️ plus lente d'efficacité contre les formes graves/décès, que contre les formes symptomatiques (simples), tant vis-à-vis de Delta que d'Omicron.
imperial.ac.uk/media/imperial…
Cela était également annoncé par les modélisations de l'ICL 🇬🇧, montrant une ↘️ plus lente d'efficacité contre les formes graves/décès, que contre les formes symptomatiques (simples), tant vis-à-vis de Delta que d'Omicron.
imperial.ac.uk/media/imperial…
47/80
Ces modélisations montraient aussi ce que provoque l'échappement immunitaire d'Omicron : non pas une perte abrupte d'efficacité vaccinale à l'échelle populationnelle, mais un raccourcissement de la durée de protection !
Ces modélisations montraient aussi ce que provoque l'échappement immunitaire d'Omicron : non pas une perte abrupte d'efficacité vaccinale à l'échelle populationnelle, mais un raccourcissement de la durée de protection !
48/80
Ces modélisations de l'ICL sont loin d'être "farfelues" puisqu'elles correspondent exactement aux données observées en vie réelle actuellement !
Ces modélisations de l'ICL sont loin d'être "farfelues" puisqu'elles correspondent exactement aux données observées en vie réelle actuellement !
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1492261169368862723?s=20&t=uBjS6fQCU2w75sgXUiWMyw
49/80
La protection immunitaire n'est donc pas pérenne, même après la 3ème dose, car elle dépend des anticorps neutralisants dont la caractéristique est de se raréfier à distance de l'immunisation, et d'être rendus inopérants par l'échappement immunitaire du virus...
La protection immunitaire n'est donc pas pérenne, même après la 3ème dose, car elle dépend des anticorps neutralisants dont la caractéristique est de se raréfier à distance de l'immunisation, et d'être rendus inopérants par l'échappement immunitaire du virus...
50/80
Ces données ont été confirmées par Israël, avec une ↘️ du taux de COVID graves/décès d'un facteur x3 à x4 chez les vaccinés 4 doses VERSUS 3 doses datant depuis plus de 4 mois ! 🤷♂️
Ces données ont été confirmées par Israël, avec une ↘️ du taux de COVID graves/décès d'un facteur x3 à x4 chez les vaccinés 4 doses VERSUS 3 doses datant depuis plus de 4 mois ! 🤷♂️
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1488301648745271301?s=20&t=9FSAf_SdLK9DIpYnFijQtw
51/80
Si Israël avait déployé ses 4ème doses, elle n'aurait pas subi une vague Omicron aussi sévère (la plus sévère des 5 vagues israéliennes).
Leurs 3èmes doses étaient trop anciennes quand Omicron est arrivé, déjà évoqué ici :
Si Israël avait déployé ses 4ème doses, elle n'aurait pas subi une vague Omicron aussi sévère (la plus sévère des 5 vagues israéliennes).
Leurs 3èmes doses étaient trop anciennes quand Omicron est arrivé, déjà évoqué ici :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1489345233531936774?s=20&t=LWkdUUCJDi75jXHDy_O0OA
52/80
Le Danemark a fait le choix d'arrêter sa campagne vaccinale (en tout cas d'annoncer cela), et un retour à la "vie d'avant", malgré un record de surcharge hospitalière, et de mortalité par COVID 🤷♂️
Ce retour à la "vie d'avant" ne sera donc que virtuel et transitoire...
Le Danemark a fait le choix d'arrêter sa campagne vaccinale (en tout cas d'annoncer cela), et un retour à la "vie d'avant", malgré un record de surcharge hospitalière, et de mortalité par COVID 🤷♂️
Ce retour à la "vie d'avant" ne sera donc que virtuel et transitoire...
53/80
Le UK est plus réaliste, et prépare déjà sa population à la nouvelle campagne vaccinale :
A) au printemps, 4ème dose pour les plus à risque
B) à l'automne, 4ème dose en population générale
bbc.com/news/uk-604659…
Le UK est plus réaliste, et prépare déjà sa population à la nouvelle campagne vaccinale :
A) au printemps, 4ème dose pour les plus à risque
B) à l'automne, 4ème dose en population générale
bbc.com/news/uk-604659…
54/80
Cette décision est inévitable en raison de la ↘️ rapide de protection contre les formes graves liées à Omicron après la 3ème dose (de 90% à 73% en seulement 10 à 14 semaines), ce qui nous amènera à une ↘️ au moins aussi forte qu'après la 2ème dose à ~25 semaines !...
Cette décision est inévitable en raison de la ↘️ rapide de protection contre les formes graves liées à Omicron après la 3ème dose (de 90% à 73% en seulement 10 à 14 semaines), ce qui nous amènera à une ↘️ au moins aussi forte qu'après la 2ème dose à ~25 semaines !...
55/80
Il sera donc nécessaire de protéger les hôpitaux d'une surcharge de cas graves simultanés, via une nouvelle dose vaccinale dès le printemps, sans attendre les vaccins mis à jour...
Il sera donc nécessaire de protéger les hôpitaux d'une surcharge de cas graves simultanés, via une nouvelle dose vaccinale dès le printemps, sans attendre les vaccins mis à jour...
56/80
Du point de vue quantitatif, le "stock" de cas graves potentiels sera plus sensiblement ↘️ en ciblant les plus vulnérables MAIS, à l'échelle individuelle, il y aura des cas graves chez des "non-vulnérables", et qui auraient pu être évité via ce rappel vaccinal...
Du point de vue quantitatif, le "stock" de cas graves potentiels sera plus sensiblement ↘️ en ciblant les plus vulnérables MAIS, à l'échelle individuelle, il y aura des cas graves chez des "non-vulnérables", et qui auraient pu être évité via ce rappel vaccinal...
57/80
Les autorités font probablement le choix d'attendre les vaccins mis à jour pour le déploiement des 4èmes doses en population générale.
Je ne sais ni quand elles seront disponibles en quantité, ni s'il sera possible d'attendre jusque-là...
Les autorités font probablement le choix d'attendre les vaccins mis à jour pour le déploiement des 4èmes doses en population générale.
Je ne sais ni quand elles seront disponibles en quantité, ni s'il sera possible d'attendre jusque-là...
58/80
Surtout, il y a 2 erreurs qui sous-tendent cette attente :
A) confondre un rappel vaccinal (avec les vaccins actuels) et le vaccin mis à jour (= nouveaux épitopes donc besoin d'un schéma vaccinal complet à 3 doses)...
Surtout, il y a 2 erreurs qui sous-tendent cette attente :
A) confondre un rappel vaccinal (avec les vaccins actuels) et le vaccin mis à jour (= nouveaux épitopes donc besoin d'un schéma vaccinal complet à 3 doses)...
59/80
Ce problème a déjà été évoqué plusieurs fois : un vaccin mis à jour n'est pas un simple "rappel".
Il génère une nouvelle réponse immunitaire contre de nouveaux épitopes (ici spécifiques d'Omicron), et nécessite donc à nouveau un schéma vaccinal complet...
Ce problème a déjà été évoqué plusieurs fois : un vaccin mis à jour n'est pas un simple "rappel".
Il génère une nouvelle réponse immunitaire contre de nouveaux épitopes (ici spécifiques d'Omicron), et nécessite donc à nouveau un schéma vaccinal complet...
60/80
Si 1 seule dose est utilisée, on obtient alors un effet booster sur les épitopes déjà rencontrés avec le vaccin 1.0, mais seulement un amorçage de réponse immunitaire face aux nouveaux épitopes = pas de gain de protection, ni de durabilité par rapport au vaccin actuel
Si 1 seule dose est utilisée, on obtient alors un effet booster sur les épitopes déjà rencontrés avec le vaccin 1.0, mais seulement un amorçage de réponse immunitaire face aux nouveaux épitopes = pas de gain de protection, ni de durabilité par rapport au vaccin actuel
61/80
Ceci avait déjà été évoqué dans ce thread sur ce qui est souvent appelé à tort, "pêché antigénique originel", ou "effet Hoskins" :
Ceci avait déjà été évoqué dans ce thread sur ce qui est souvent appelé à tort, "pêché antigénique originel", ou "effet Hoskins" :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1469033508949659653?s=20&t=H4r4KGaBGOvqAlpzdidRUA
62/80
Et depuis, l'absence de gain de protection/durabilité d'une dose mise à jour par rapport au vaccin actuel, commence à être confirmée 🤷♂️
Et depuis, l'absence de gain de protection/durabilité d'une dose mise à jour par rapport au vaccin actuel, commence à être confirmée 🤷♂️
https://twitter.com/Gab_H_R/status/1491559200543195144?s=20&t=asTNuJs1eegPDuTwS9lqRw
63/80
Alors psychologiquement, vous gérez ça comme vous voulez/pouvez, mais je ne fais qu'enfoncer des portes ouvertes (en tout cas si on connaît un peu l'immunologie).
Ce n'est pas une marque d'inefficacité vaccinale, c'est le résultat de notre biologie immunitaire.
Alors psychologiquement, vous gérez ça comme vous voulez/pouvez, mais je ne fais qu'enfoncer des portes ouvertes (en tout cas si on connaît un peu l'immunologie).
Ce n'est pas une marque d'inefficacité vaccinale, c'est le résultat de notre biologie immunitaire.
64/80
Et si on veut conserver un semblant de vie normale, en espérant protéger les hôpitaux d'une surcharge importante et durable, il sera nécessaire de maintenir l'immunité de population via des rappels réguliers.
D'autant plus réguliers que la circulation virale est forte...
Et si on veut conserver un semblant de vie normale, en espérant protéger les hôpitaux d'une surcharge importante et durable, il sera nécessaire de maintenir l'immunité de population via des rappels réguliers.
D'autant plus réguliers que la circulation virale est forte...
65/80
Il ne faut pas oublier que si la vague Omicron a paru moins létale, c'est principalement parce que l'échappement immunitaire d'Omicron lui a permis de circuler plutôt chez des immunisés, donc à moindre risque de forme grave 🤷♂️
Il ne faut pas oublier que si la vague Omicron a paru moins létale, c'est principalement parce que l'échappement immunitaire d'Omicron lui a permis de circuler plutôt chez des immunisés, donc à moindre risque de forme grave 🤷♂️
66/80
Sa sévérité intrinsèque n'était ↘️ que de 25% par rapport à celle de Delta (et donc tjs nettement supérieure à celle des variants antérieurs) :
Sa sévérité intrinsèque n'était ↘️ que de 25% par rapport à celle de Delta (et donc tjs nettement supérieure à celle des variants antérieurs) :
https://twitter.com/yaneerbaryam/status/1489251231474147331?s=20&t=xBWJju3Aj3TwRHn5KvgL5A
67/80
Il ne faut pas oublier non plus que les variants qui arrivent, notamment BA.2, sont à la fois plus transmissibles, plus pathogènes et moins neutralisés par nos anticorps qu'Omicron.
Le maintien d'immunité via les rappels vaccinaux restera donc crucial à l'avenir...
Il ne faut pas oublier non plus que les variants qui arrivent, notamment BA.2, sont à la fois plus transmissibles, plus pathogènes et moins neutralisés par nos anticorps qu'Omicron.
Le maintien d'immunité via les rappels vaccinaux restera donc crucial à l'avenir...
68/80
Ce qui m'amène à la dernière partie de ce thread.
On entre en phase d'abandon des mesures barrières/freinage.
On va donc fortement faciliter la circulation virale, comme jamais depuis le début de la pandémie...
Ce qui m'amène à la dernière partie de ce thread.
On entre en phase d'abandon des mesures barrières/freinage.
On va donc fortement faciliter la circulation virale, comme jamais depuis le début de la pandémie...
69/80
On entend aussi, "désormais, il faut focaliser les mesures barrières sur les immunodéprimés, vulnérables"...
C'est peut-être plus facile à gérer psycho-socialement (pour les non-vulnérables), mais c'est épidémiologiquement absurde...
On entend aussi, "désormais, il faut focaliser les mesures barrières sur les immunodéprimés, vulnérables"...
C'est peut-être plus facile à gérer psycho-socialement (pour les non-vulnérables), mais c'est épidémiologiquement absurde...
70/80
D'une part, vous ne pouvez pas protéger les plus vulnérables, souvent les moins aptes à bénéficier de la protection immunitaire, si le reste de la population est touchée par une circulation virale intense.
Les vulnérables ne vivent pas en vase clos...
D'une part, vous ne pouvez pas protéger les plus vulnérables, souvent les moins aptes à bénéficier de la protection immunitaire, si le reste de la population est touchée par une circulation virale intense.
Les vulnérables ne vivent pas en vase clos...
71/80
D'autre part, si le virus circule intensément et durablement dans la population (considérée comme non-vulnérable), il continue son évolution vers toujours plus de transmissibilité, et tjs plus d'échappement immunitaire ; ce qui ↗️ encore le risque des vulnérables...
D'autre part, si le virus circule intensément et durablement dans la population (considérée comme non-vulnérable), il continue son évolution vers toujours plus de transmissibilité, et tjs plus d'échappement immunitaire ; ce qui ↗️ encore le risque des vulnérables...
72/80
C'est un cercle vicieux dont on croira toujours pouvoir se sortir en détournant le regard du danger, mais il se rappellera toujours à notre bon souvenir 🤷♂️
Et c'est aussi pour cette raison que la scénarisation sur le modèle grippal ne tiendra pas...
C'est un cercle vicieux dont on croira toujours pouvoir se sortir en détournant le regard du danger, mais il se rappellera toujours à notre bon souvenir 🤷♂️
Et c'est aussi pour cette raison que la scénarisation sur le modèle grippal ne tiendra pas...
73/80
Pourquoi croyez-vous qu'on n'ait qu'un seul rappel vaccinal par an pour la grippe ? Et limité à <50% des seuls vulnérables ?
Tout simplement parce que la grippe est bcp moins sévère que la COVID, et surtout, les virus Influenza ne circulent que très peu de temps...
Pourquoi croyez-vous qu'on n'ait qu'un seul rappel vaccinal par an pour la grippe ? Et limité à <50% des seuls vulnérables ?
Tout simplement parce que la grippe est bcp moins sévère que la COVID, et surtout, les virus Influenza ne circulent que très peu de temps...
74/80
Quand vous perdez votre protection vaccinale contre les formes sévères de grippe en 2/3 mois, on s'en fiche pas mal car vous n'êtes alors plus exposé au virus jusqu'à l'année suivante ! 🤷♂️
On a alors tout le temps d'attendre l'automne suivant pour le rappel...
Quand vous perdez votre protection vaccinale contre les formes sévères de grippe en 2/3 mois, on s'en fiche pas mal car vous n'êtes alors plus exposé au virus jusqu'à l'année suivante ! 🤷♂️
On a alors tout le temps d'attendre l'automne suivant pour le rappel...
75/80
Les virus Influenza ne circulent que quelques semaines durant la saison froide ; touchent rarement plus de 10% de la population nationale par an...
Ce n'est absolument pas le cas pour SARS-CoV-2 qui diffuse largement et circule sans discontinuer...
Les virus Influenza ne circulent que quelques semaines durant la saison froide ; touchent rarement plus de 10% de la population nationale par an...
Ce n'est absolument pas le cas pour SARS-CoV-2 qui diffuse largement et circule sans discontinuer...
76/80
Il est alors nécessaire de rapidement compenser la perte de protection immunitaire au bout de quelques mois, par un nouveau rappel vaccinal, car vous être alors encore exposé au virus qui continue de circuler, voire sous une nouvelle forme (variant)...
Il est alors nécessaire de rapidement compenser la perte de protection immunitaire au bout de quelques mois, par un nouveau rappel vaccinal, car vous être alors encore exposé au virus qui continue de circuler, voire sous une nouvelle forme (variant)...
77/80
J'avais déjà fait ce comparatif grippe/covid pour montrer à quel point il était inapproprié :
D'une part à cause de cette modalité de circulation épidémique très différente :
J'avais déjà fait ce comparatif grippe/covid pour montrer à quel point il était inapproprié :
D'une part à cause de cette modalité de circulation épidémique très différente :
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1482036225317949450?s=20&t=XEXL9Th_qbNBQ8iAyZ83cA
78/80
D'autre part à cause d'un impact sanitaire incomparable.
La COVID envoie à l'hôpital/en réa/à la morgue, en 1 seule semaine, autant de gens que la grippe en une année entière !
D'autre part à cause d'un impact sanitaire incomparable.
La COVID envoie à l'hôpital/en réa/à la morgue, en 1 seule semaine, autant de gens que la grippe en une année entière !
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1482036791767179267?s=20&t=XEXL9Th_qbNBQ8iAyZ83cA
79/80
Et ceci alors que la COVID est couverte par un vaccin administré à >80% de pop, avec efficacité de 80-90% contre formes graves ;
alors que pour la grippe = administré qu'à 47% des seuls vulnérables, avec efficacité <20% contre les formes graves
Et ceci alors que la COVID est couverte par un vaccin administré à >80% de pop, avec efficacité de 80-90% contre formes graves ;
alors que pour la grippe = administré qu'à 47% des seuls vulnérables, avec efficacité <20% contre les formes graves
https://twitter.com/C_A_Gustave/status/1482036808347234304?s=20&t=XEXL9Th_qbNBQ8iAyZ83cA
80/80
Je me fiche que ce thread déplaise, paraisse pessimiste.
Je préviens simplement que la biologie n'est pas dépendante du récit socio-politique et se fiche pas mal de l'état de "fatigue psychologique".
Ne pas regarder les choses en face et ne pas anticiper restera une erreur.
Je me fiche que ce thread déplaise, paraisse pessimiste.
Je préviens simplement que la biologie n'est pas dépendante du récit socio-politique et se fiche pas mal de l'état de "fatigue psychologique".
Ne pas regarder les choses en face et ne pas anticiper restera une erreur.
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