Thread by @SystemsVirology

#拡散希望 G2P-Japan🇯🇵の論文第15弾「#S375F：オミクロンBA.1を特徴づける変異」を、iScience @iScience_CP に発表しました。初代オミクロン である #BA1 の特徴が、#S375F というスパイクのたったひとつの変異で規定されることを解明しました。
以下、本研究の概要です。1/6
cell.com/iscience/fullt…

#オミクロン BA.1株は、①スパイクタンパク質の開裂効率の低下と、②低い膜融合活性、というふたつの特徴を持つことが明らかになっています。

参考：G2P-Japan🇯🇵論文第5弾↓
nature.com/articles/s4158…

しかし、スパイクタンパク質のどの変異がこれらの特徴を決めているのかは不明でした。2/6

1️⃣本研究ではまず、大規模なスクリーニング実験の結果、BA.1株の上記のふたつの特徴は、スパイクタンパク質のreceptor binding domainに規定され、その中でも特に、#S375F というたったひとつの変異によって特徴づけられることを明らかにしました。3/6

2️⃣次に、分子系統学解析の結果、南アフリカ🇿🇦での流行最初期（2021年9月頃）において、BA.1株は、S375F変異を獲得した直後に劇的に流行拡大したことを明らかにしました。この結果は、S375F変異の獲得によって、BA.1株に流行拡大に寄与する機能が付与されたことを示唆します。4/6

3️⃣そして、詳細な構造生物学解析により、スパイクタンパク質のF375残基がH505残基とπ-π相互作用を形成すること、そしてそれが、BA.1株の ①スパイクタンパク質の開裂効率の低下、および、②低い膜融合活性、につながることを解明しました。5/6

▶️ 最後に、本研究のまとめのポンチ絵です。本研究も、G2P-Japan🇯🇵の特色であるマルチスケールな学際融合（ウイルス学、細胞生物学、分子系統学、構造生物学）による研究成果になります。6/6

（余談ですが、これはこれまでのG2P-Japan論文の中でいちばん難産な論文でした...。なぜかエディターやレビュアーに嫌われ続け、いろいろな雑誌を放浪し、初投稿からアクセプトまで、結局7か月以上もかかってしまいました...。）

参考まで、この仕事のオリジナルのプレプリントに関するツイートはこちら↓　今年の4月4日のツイートでした。ちょうど8か月前…😷

https://twitter.com/systemsvirology/status/1510869099253202944