RT @ajsadauskas@aus.social
The thing about Twitter is that it really lacks a lot of the features you'd expect from a true Mastodon replacement.

For example, there's no way to edit your toots (which they, confusingly call "tweets"—let's face it, it's a bit of a silly name (1/4) that's difficult to take seriously).

"Tweets" can't be covered by a content warning. There's no way to let the poster know you like their tweet without also sharing it, and no bookmark feature.

There's no way to set up your own instance, and you're basically stuck on a (2/4)

Die neuesten Daten vom @BAG_OFSP_UFSP zeigen, dass der Peak der BA.5-Welle (“Sommerwelle”) mit grosser Wahrscheinlichkeit überschritten ist und der R-Wert wieder auf 0.9 gefallen ist (90% KI: 0.8-1.1; Methode: EpiNow2). 1/4 Während den letzten 7 Wochen wurden in der Schweiz rund 230’000 Fälle bestätigt. Bei einer vermuteten Dunkelziffer von ungefähr 5 ergibt dies 1,15 Millionen Infektionen bzw. 13% der Bevölkerung. 2/4

In Switzerland, the effective reproduction number R_e of #SARSCoV2 increased from around 0.8 to 1.4 due to BA.5 replacing BA.2. What does this mean in terms of population immunity and the proportion of the population that will catch BA.5? 🧵 1/4 The intrinsic transmissibility of BA.2 and BA.5 is arguably similar to Delta (doi.org/10.1038/s41586…) with a basic reproduction number R_0 of around 6 and 4 during winter and summer in Switzerland, respectively. 2/4

Great thread by @adamjkucharski on what to expect with respect to endemicity of #SARSCoV2. A couple of months ago, I gave a presentation about ‘the end of the pandemic’ at the Collegium generale at @unibern. Let’s go through some slides. 1/10

https://twitter.com/adamjkucharski/status/1536613148010201088

A standard SIR model can be used to explore how #SARSCoV2 reaches an endemic equilibrium (constant incidence and prevalence of infection) in a country like Switzerland. 2/10

Important #COVID19 lessons to learn from Japan. Japan has recorded relatively low case numbers and no significant excess mortality during the pandemic, despite having the world’s oldest population and being densely packed. Why? 1/7 doi.org/10.1038/d41586… via @alexvespi “Japan has sought to understand the spread and risks of the disease and apply that to minimizing deaths and hospitalizations while maintaining social and economic activities.” 2/7

The mutational profile of Omicron suggests a potentially significant transmission advantage. But can we already say something about increased transmissibility or immune evasion? I'll give it a try. Warning: Preliminary and based on VERY limited data. 1/15 The observed rapid replacement of Delta by Omicron in the province of Gauteng in South Africa is suggestive of a transmission advantage. 2/15

https://twitter.com/tuliodna/status/1463911571176968194

Hansueli Schöchli präsentiert in der @NZZ einen interessanten Vergleich der Pandemiebewältigung in sechs europäischen Ländern und der Schweiz. Was in meinen Augen jedoch vergessen geht ist, dass die Pandemie stark sozioökonomisch getrieben ist.🧵1/n nzz.ch/wirtschaft/sch… Länder mit einem hohen BIP pro Kopf benötigen weniger einschneidende Massnahmen und kommen mit einer deutlich tieferen Übersterblichkeit durch die Pandemie. 2/n

Winter is coming. With the current drop in temperature, Switzerland enters a period of 6 months with daily average temperatures typically below 10-15 °C. -> Closed windows and more time indoors. What does that mean with respect to #SARSCoV2 transmission? 🧵 1/n @meteoschweiz Seasonal effects on the transmission of respiratory infections are well-known. For example, we previously estimated that seasonal effects increased influenza transmission (i.e., the R value) in Switzerland from 2003 to 2015 by 37% (95% CrI: 14-54%). 2/n doi.org/10.1016/j.epid…

Our new preprint on the spread of the #SARSCoV2 variant Alpha in Geneva, Switzerland, and Beta in South Africa is online. We used clinical and epidemiological data to better understand the mechanisms that lead to a transmission advantage of the #VOCs. 1/8 doi.org/10.1101/2021.0… When analyzing viral load in 950 individuals, we found that Alpha infections exhibit a higher viral load and longer viral shedding compared to non-VOC. 2/8

Bundesrat Alain Berset behauptet, dass er während der Pandemiebekämpfung “am Anfang die Wissenschaft zu wenig hinterfragt” habe. Doch was ist “die Wissenschaft” und handelt es sich dabei um bewusstes Framing? Ein 🧵1/11 srf.ch/news/schweiz/b… Der Nutzen von Masken für die allgemeine Bevölkerung wurde primär von der eigenen Gesundheitsbehörde und dem ehemaligen Leiter der Abteilung für übertragbare Krankheiten bestritten. Man widersprach damit sogar den eigenen Empfehlungen. 2/11 nzz.ch/schweiz/corona…

Die Schweiz steht erneut vor einem Entscheid zu weiteren Lockerungen der Corona-Massnahmen. Einige Gedanken zum Verlauf der Epidemie, den Massnahmen, dem Bundesrat und den modellierten Szenarien der Task Force. Ein 🧵. 1/17 srf.ch/news/schweiz/c… Auch ich bin etwas überrascht über den positiven Verlauf der Epidemie. Aufgrund der Lockerungen vom 19. April hätte ich durchaus erwartet, dass die Zahl der #COVID19-Patienten auf den Intensivstationen nochmals auf etwa 300 bis 400 ansteigen könnte. 2/17 tagesanzeiger.ch/dieser-entsche…

Der Gastkommentar von Frank Scheffold (@unifr) in der heutigen @NZZ wird meiner Meinung nach der wissenschaftlichen Arbeit während dieser Pandemie nicht gerecht. Ein kritischer Thread. 1/n

https://twitter.com/nzz/status/1381544374119583748

Wie erwähnt prognostizierte Report 9 des @MRC_Outbreak am @imperialcollege 410’000 bis 550’000 Todesfälle für Grossbritannien. Dies jedoch im Falle einer komplett unkontrollierten Ausbreitung von #SARSCoV2. 2/n imperial.ac.uk/mrc-global-inf…

Einzelne Beobachtungen von Corona-Infektionen in Pflegeheimen sind weder ein “Wunder” (Elgg) noch “rätselhaft”. Was hat es mit diesen Zahlen zur Impfung auf sich? Ein kurzer 🧵 1/5 @fstraum tagesanzeiger.ch/trotz-impfung-… In einem Pflegeheim im Kanton Zug wurden 5 von 11 geimpften Bewohnern positiv auf #SARSCoV2 getestet (45%). Unter den 4 ungeimpften Bewohnern wurden 3 positiv getestet (75%). Das relative Risiko (RR) für geimpfte Personen sich zu infizieren ist also 45%/75% = 61%. 2/5

Vor einem Jahr durfte ich im Bundesamt für Gesundheit die aktuellen Forschungsergebnisse zur Ausbreitung und Gefährlichkeit von #COVID19 vorstellen. 1/4 Die Resultate liessen sich zu diesem Zeitpunkt (18. Februar 2020) folgendermassen grob zusammenfassen. 2/4

Wichtiger Kommentar von Christian Speicher in der @NZZ zur Zusammenarbeit von Wissenschaft und Politik. 1/n nzz.ch/meinung/in-der… “Statt im Dialog eine langfristige und faktenbasierte Strategie zur Eindämmung der Pandemie zu entwickeln, wurstelten sich der Bundesrat und die Kantone durch die Krise.” 2/n

Leichte Konfusion bezüglich des Anstiegs (Verdoppelung?) und der Verbreitung der neuen Varianten von #SARSCoV2 am heutigen Point de Presse. Ein🧵. 1/6

https://twitter.com/bag_ofsp_ufsp/status/1361601717230575617

Die neue Variante (501Y bzw. B.1.1.7) verdrängt die bisherigen Varianten in der Schweiz mit einer mehr oder weniger konstanten Rate. Genaueres dazu findet sich in unserer Analyse. 2/6 ispmbern.github.io/covid-19/varia…

Update on our near real-time analysis of the spread of 501Y and B.1.1.7 in Switzerland. Now including additional data from Bern and Winterthur. ispmbern.github.io/covid-19/varia… @EpiPose 1/4 The proportion of 501Y and B.1.1.7 increases at a strikingly similar pace in different regions of Switzerland. Geneva appears to be around two weeks ahead of the rest of Switzerland. 2/4

We updated our near real-time analysis of the spread of 501Y and B.1.1.7 now including - next to Geneva - Zurich, Switzerland overall, and a comparison with Denmark. @EpiPose 1/5
ispmbern.github.io/covid-19/varia… We estimate that the proportion of 501Y has reached 67% (95% CI: 57%-75%) in Geneva and 35% (95% CI: 25%-47%) in Zurich. 2/5

Near real-time tracking the spread of N501Y (B.1.1.7, B.1.351) in Geneva, Switzerland. We project that N501Y will reach a frequency of 82% (95%CI: 53%-95%) by 1 March 2021. @EpiPose 1/4 ispmbern.github.io/covid-19/varia… We estimate a 33% (95% CI: 15%-56%) and 47% (95% CI: 21%-78%) increased transmissibility of N501Y variants, assuming a generation time of 5 and 7 days, respectively. 2/4

There is lots of talk about #COVID19-related excess mortality. How does the situation look like in Switzerland? 🧵1/5 2020 started with a mild influenza season and Switzerland was on its way to a year with negative excess mortality. Then came the pandemic and a relatively early ‘lockdown' limited the number of #COVID19-related death to around 2,000 during spring. 2/5

There is great concern about the potential spread of the new #SARSCoV2 variant (B.1.1.7) outside the UK. How many cases do we have to expect in Switzerland and will they spread further? Let's do some back-of-the-envelope calculations. 1/n ecdc.europa.eu/en/publication… Around 10,000 British visitors have arrived in Switzerland since December 14. Many of them are visiting Switzerland for their ski holidays. 2/n tagesanzeiger.ch/auf-der-suche-…