Con @AndersonBrito_ vamos a resumir lo que sabemos actualmente sobre #nCoV2019 mediante datos genéticos públicos de China, Tailandia y Estados Unidos.
Nos apoyaron con edicion @MondragonShem y @noalsilencio de @CienciaAbiertaL
#2019nCoV
1/
Nos apoyaron con edicion @MondragonShem y @noalsilencio de @CienciaAbiertaL
#2019nCoV
1/
La mayor parte de estos resultados se encuentran disponibles en la plataforma (en inglés) nextstrain.org gracias a @trvrb @richardneher @hamesjadfield @firefoxx66 @nicfelm & Misja Ilcisin y los proyectos de vigilancia que generan los datos #CienciaAbierta!
2/
2/
La evolución de virus es representada usando gráficos llamados filogenias (o árboles filogenéticos) que indican el parentesco entre los virus. Las secuencias genéticas del #nCoV2019 permiten inferir dichas filogenias.
3/
3/
Las secuencias que tienen las mismas mutaciones están más estrechamente relacionadas, por lo que estas mutaciones nos permiten agrupar (usando métodos filogenéticos) virus estrechamente relacionados que pertenecen a las mismas cadenas de transmisión.
4/
4/
Las filogenias evidencian que #nCoV2019 se agrupa con betacoronavirus parecidos al SARS-CoV pero está más estrechamente relacionado con un grupo de betacoronavirus de murciélagos (~96% idénticos) que con los SARS-CoV de humanos (~80% idénticos).
5/
5/
@arambaut, @robertson_lab & @john_jxw han reportado hallazgos similares. Li y colaboradores han reportado un betacoronavirus de murciélago que tiene una identidad de secuencia del genoma de 96.2% con #nCoV2019. biorxiv.org/content/10.110…
6/
6/
El origen del #nCoV2019 aún no está claro. Los murciélagos son un escenario plausible. Existe la posibilidad de que algún otro animal sea el intermediario responsable. Actualmente no existen secuencias de betacoronavirus de un número representativo de mamíferos.
7/
7/
@K_G_Andersen, @robertson_lab & @john_jxw han demostrado que no existe evidencia de serpientes como intermediario.
8/
8/
Todos los #nCoV2019 se agrupan juntos en las filogenias. La explicación más simple es que todos los virus descienden de una sola introducción en humanos. Sin embargo, no podemos descartar que hayan ocurrido múltiples transmisiones de virus muy similares desde algún animal.
9/
9/
Hay poca diversidad genética (pocas mutaciones) en los #nCoV2019 secuenciados y varias son idénticas (a pesar de ser de diferentes países). Esto sugiere que el antepasado común de los virus es bastante reciente (Los coronavirus generalmente acumulan 1-2 mutaciones por mes).
10/
10/
La mayor parte de los #nCoV2019 secuenciados tienen mutaciones únicas. La secuenciación de un nuevo virus durante una epidemia no es tarea fácil y algunas de estas mutaciones pueden ser errores de secuenciación. Esto puede ser verificado en una segunda secuenciación.
11/
11/
Cuatro #nCoV2019 de Guangdong provienen de una sola familia; tres de estos virus son genéticamente idénticos y comparten 3 mutaciones únicas--familia 1 en la fig. Una situación similar se observa en la familia 2. Esto proporciona evidencia de transmisión de persona a persona.
12/
12/
Diferentes investigadores han usado métodos filogenéticos sofisticados para estimar el tiempo del ancestro común más reciente de los #nCoV2019 secuenciados. El consenso general es que el antepasado común probablemente existió entre noviembre y principios de diciembre de 2019.
13/
13/
Las filogenias aquí presentadas se actualizarán en la medida que más secuencias genéticas se hagan disponibles. Actualmente existen esfuerzos para extraer la mayor parte de información posibles usando las secuencias disponibles y métodos filogenéticos más sofisticados.
14/
14/
Si tienes dudas de que es una mutación, te invitamos a ver nuestro anterior post y por supuesto a que seguir a @CienciaAbiertaL
