1/ Pour mettre en perspective l'évolution du nb de patients testés et du nb de patients positifs, j'ai calculé le % de variation sur les 6 dernières semaines du nb de patients testés et du nb de patients positifs comparativement à la semaine précédente pour chaque département. Image
2/ Version zoomée en ignorant les départements qui ont plus que doublé le nombre de patients testés sur la S51 (>+100%) Image
3/ En vert quand le nb de patients positifs décroit d'une semaine à l'autre, en orange quand le nombre de patients positifs augmente plus vite que n'augmente le nombre de patients testés, le reste en bleu.
4/ En novembre : baisse plus rapide du nb de patients positifs que du nombre de patients testés = baisse du taux de positivité.
5/ 2 premières semaines de décembre = situation contrastée dans les départements mais équilibre au niveau national = taux de positivé ~ stable au niveau national
6/ Semaine dernière = tests avant les fêtes + campagnes de tests, le nombre de patients positifs augmente dans la majorité des départements et le nombre de patients testés explose dans certains départements = chute du taux de positivité
7/ Pour y voir (un peu) plus clair, les départements de chaque région (échelles différentes pour Île-de-France, Auvergne-Rhône-Alpes et Normandie (grosse augmentation des tests en S51)) :

Île-de-France
Centre-Val de Loire
Bourgogne-Franche-Comté
Normandie ImageImageImageImage
8/ Hauts-de-France
Grand Est
Pays de la Loire
Bretagne ImageImageImageImage
9/ Nouvelle-Aquitaine
Occitanie
Auvergne-Rhône-Alpes
Provence-Alpes-Côte d'Azur ImageImageImageImage

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26 Dec
1/ Premier essai d’un « grid cartogram » ou « grid/tile map » pour la France.

Dans cette représentation chaque département a la même taille (ici un carré).

Exemple avec le taux d’incidence 👇 Image
2/ Ici avec la variation en pourcentage d’une semaine glissante à l’autre du nombre de patients positifs moyen sur 7 jours 👇 Image
3/ Et ici avec le taux d’hospitalisation (nombre hebdomadaire de nouvelles hospitalisations pour 100 000 habitants) 👇 Image
Read 8 tweets
23 Dec
Des chercheurs de SPF ont étudié l'impact du couvre-feu (pré-confinement) ds 22 métropoles françaises.

Plus fouillé que ma modeste visu de fin octobre mais utilisant sensiblement la même approche (étude des % d'augmentation des indicateurs)

L'article ➡️ bit.ly/2WFNGst Image
A noter la notion "d'effet de résonance" généralement peu mentionnée / discutée 👇 ImageImage
Read 4 tweets
6 Dec
1/ Le ralentissement de la baisse est aussi visible au niveau des nouvelles hosp.

Si on regarde pour chaque jour la diff avec J-7, c'est la 1ère fois qu'on est au dessus de 0 depuis le 9/11.

C'est un peu bruité (surtout le weekend) car les données sont par date de déclaration.
2/ A partir d'un moyenne glissante sur 7 jours ça donne ça 👇
3/ On peut aussi le voir sous la forme d’un rapport entre le nombre de nouvelles hospitalisations COVID-19 sur 7 jours à 7 jours d'intervalle (une sorte de R-effectif à partir des nouvelles hospitalisations) 👇
Read 5 tweets
5 Dec
1/ On constate ces derniers jours un ralentissement de la baisse du nb de cas de COVID-19 au niveau national.

Le nb de pers testées et le nb de pers positives semblent se stabiliser et donc également le tx de positivité.

La situation est contrastée en fonction des départements.
2/ Des exemples de départements où les taux de positivité augmentent.

Tous les départements sont disponibles ici : germain-forestier.info/covid/departem…
3/ On peut aussi regarder une visualisation que j’ai déjà utilisé il y a quelque temps.

Ici au niveau national, on voit le ralentissement (les derniers points sont moins espacés)
Read 11 tweets
3 Dec
1/ Les données sur les tests antigéniques n'étant pas encore disponibles sur Géodes et en open data, je regarde régulièrement les données sur ce site : iqvia.opendatasoft.com/pages/antigeni…

J'en ai déjà parlé ici 👇

2/ Cette semaine, j'ai été étonné par l'augmentation très importante des données des actes de prélèvement pratiqués en officine.

Le site revendique 9 133 412 actes depuis octobre.
3/ Cela correspond à ça dans les données :

FORFAIT COVID AVEC PRÉLÈV -
Les actes avec prélèv (le pharmacien procède au prélèv et l’analyse lui-même)

FORFAIT COVID SANS PRÉLÈV -
Les actes sans prélèv (un autre pro. de santé fait le prélèv mais l’analyse est faite en officine)
Read 10 tweets
13 Nov
1/ J'ai essayé de trouver des données sur la grippe pour comparer la pression hospitalière avec le covid (la comparaison revient souvent dans les commentaires) 👇
2/ La même chose pour les décès à l’hôpital 👇
3/ Sources pour les données sur la grippe :

Données 2012-2017
santepubliquefrance.fr/content/downlo…

Données 2017/2018
beh.santepubliquefrance.fr/beh/2019/28/pd…
Read 6 tweets

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