Living in the UK, I've heard lots of triumphalistic announcements regarding AZ approval on the radio so I think it's wise to offer a complete perspective of what happened. Here's a thread. 1/17
AZ's vaccine (AZD1222) is a chimeric viral vaccine: an engineered chimp virus that cannot replicate alone in human cells and produces the Sars-Cov2 spike protein to challenge our immune system. It's cheaper and easier to distribute than mRNA alternatives 2/17
AZ started the trial back in Autumn, with the goal of testing 40k subjects in 3 countries (UK, Brazil, S. Africa). The protocol was meant to be two shots of 5 million viral particles each with a four weeks gap. 3/17 clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04…
You may remember back in October the trial was halted because wan Brazilian subject (a doctor) died after the shot. The trial resumed after a few days when it became clear the subject had actually received the placebo control, not the vaccine. An unlucky coincidence 4/17
In November, AZ revealed the interim data on Lancet. Kudos to AZ for being the only producer who swiftly associated their press release to actual data. That was well-received from us scientists (alas can't say the same about Moderna and Pfizer). 5/17

thelancet.com/journals/lance…
From the data, something awkward and embarrassing emerged. AZ screwed up the dosage in 1/6 of the subjects. 11k were subjected to the expected dosage (SD/SD) but 2.5k received a low dose by mistake (LD/SD). AZ/Oxford came out transparently about it and admitted the mistake. 6/17
However, that led to confusing results. SD/SD had only 62% efficacy; LD/SD had 90% efficacy. @MHRAgovuk could not approve the latter dosage: sample was too small. So AZ decided to drop the first condition and pursue the latter with a second trial. 7/17
Today the announcement is that the SD/SD dosage was approved in an emergency, based (as far as we understand) on the data released back in November. No new data were communicated regarding that condition. Moreover: the approved SD/SD dosage has a gap of 12 weeks, not 4. Why? 8/17
The 12 weeks gap came from the Brazilian branch of the trial. Even though the target was set at 4, some subjects experienced a 12 weeks gap (things happen). Those numbers (how large?) apparently led MHRA to revise the protocol in the interest of a broader coverage 9/17
Now, the questions. What happened to the more promising dosage? MHRA claims data did not bourne out so we don't know if that 90% was a statistical fluke due to a small sample. Possible. Given the current situation with the new variant, probably wise to revert to plan A 11/17
Is the vaccine safe? Of course. Despite the very embarrassing screw up with dosages and missed trials, no reason to think it should not be safe to start with. 12/17
Is it going to work? God knows. Given its alleged genesis, the new variant can very possibly change everything. There is no evidence whatsoever vaccines will have the same efficacy on this new variant. AZ's dosage has a lower starting point (62%) so things are not brilliant 15/17
Why did MHRA approve before EMA? As far as we know, EMA was not even asked to be involved in all this. I suspect the very special UK situation played a role in this decision and I agree that B.1.1.7 leaves no time to waste. 14/17
What is the right course of action? Well, tricky. There are two vaccines in the UK now. One with 90%+ efficacy and one with 62% efficacy. For both, efficacy could turn out to be much lower anyway because of the variant. Tricky situation. 15/17
@IndependentSage recommended today that the country should enter a national lockdown AND to use a proper isolate & support system, alike to what Asian countries did. I personally think this is a sensible course of action. 16/17

Overall, important to say one thing: in dire straits, transparency is paramount. @MHRAgovuk should come out crystal clear about the data they reviewed to approve and about what prompted them to approve the same data that were available back in November. 17/17

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31 Dec 20
UK è stato il 1mo paese Europeo ad approvare i vaccini, saltando qualsiasi revisione dovuta dei dati. Sembrava che la scelta fosse politica, soprattutto quando si vantarono di averlo potuto fare perchè erano "paese migliore di tutti gli altri" 1/4

Gli sviluppi del mese di Dicembre suggeriscono che non era solo propaganda pro-Brexit. Possibile che già sapessero della nuova variante. Una mossa azzardata ma comprensibile. Oggi hanno deciso di cambiare ancora marcia e cambiare il protocollo in corso 2/4
In barba a ciò che è stato sperimentato ed approvato per uso emergenziale, hanno deciso (contro il consiglio di Pfizer stessa) di dare una sola dose per il momento, poi una seconda - se e forse. 3/4
Read 4 tweets
30 Dec 20
Voglio provare a chiarire cosa sta succedendo con il vaccino Astrazeneca (AZ).Non è un quadro molto chiaro perchè, come purtroppo è accaduto troppo spesso in questi mesi, i dati anche per noi scienziati sono un po' centellinati quindi la mia lettura potrebbe essere incompleta1/17
Il vaccino di AZ (AZD1222) è un vaccino virale chimerico: un virus del raffreddore molto blando che colpisce lo scimpanzè che NON può replicarsi e che porta la proteina spike del sars-cov2. Non è un vaccino a mRNA quindi non va trasportato a -80C. 2/17
AZ ha iniziato il trial per questo vaccino a Settembre con l'intenzione di testare 40k partecipanti in diversi paesi (UK, Brasile, Sud Africa). Il regime annunciato doveva essere due dosi da 5 milioni di particelle virali a distanza di 4 settimane. 3/17

clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04…
Read 16 tweets
23 Dec 20
Stamattina sono stato intervistato da dei bravi giornalisti di Radio Capital riguardo la variante virale in circolazione (Ieri da TgCom24). La domanda che ovviamente viene posta è: dobbiamo preoccuparci? 1/
La mia risposta è sì, ma solo a patto di ricordarci prima l'etimologia della parola: pre-occuparci. Occuparci di qualcosa prima che accada. Preoccuparsi vuol dire prepararsi. Preoccuparsi senza prepararsi è un concetto vuoto che non esiste e non serve a nulla. 2/
È importante che il pubblico chieda più pre-occupazione a chi ha il potere di farlo. Più preparazione per cosa si spera arriverà (es: i vaccini) e più preoccupazione per ciò che potrebbe arrivare (es: nuove varianti). Non vuol dire stare chiusi in casa col rosario in mano 3/
Read 7 tweets
21 Dec 20
Un piccolo aggiornamento che riguarda la contagiosità della nuova variante, VUI-202012/01 (non la scelta migliore per un nome). Niente di ufficiale ma uffciosamente gira attraverso le dichiarzioni di NERVTAG ed è meglio dare la notizia in maniera seria piuttosto che allarmista 1/
Il SAGE e NERVTAG (i due comitati scientifici che aiutano il PM) hanno pochi dubbi che questa variante sia effettivamente così tanto più contagiosa. Il mistero è: come è possibile che questa variantes possa essere così tanto più contagiosa in un periodo di relativo lockdown? 2/
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Read 9 tweets
21 Dec 20
La variante Inglese VUI-202012/01 è importante per due motivi. Uno è "che cosa potrebbe fare" e il secondo è "che cosa rappresenta". Sono entrambe questioni cruciali e vanno affrontate in maniera fredda e separata. Lo copro qui come traduzione di questo 1/
Inziamo da "che cosa rappresenta". Mutazioni nel virus succedono in continuazione and a migliaia sono già state caratterizzate e studiate, se non altro come metodo di tracciare i contagi a livello nazionale. Il sito sotto ne contiene i dati di migliaia 2/

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Se ci sono migliaia di varianti, perchè questa è cosi speciale? Dal punto di vista genetico, l'aspetto più unico di questa variante è che cambia MOLTO dalla linea parentale da cui si è evoluta. È come se avesse fatto un salto improvviso, piuttosto che piccoli passetti. 3/
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21 Dec 20
There are two issues with the English variant, as it is now referred. One issue is "what it could do" and the other issue is "what it could represent". They are both important and we know just enough to make hyphoteses that can drive to experiments. I'll try and explain 1/
Let's start with the latter: what does it represent? Mutations happen all the time and variants have been recorded in the thousands. The website below shows several 1000s different variants recorded in different countries. Why is this SO special? 2/

nextstrain.org/ncov/global
The most special aspect of this variant is that the number of changes it shows is a large disconnect from its parental line as if this lineage made a big sudden jump rather than the usual slow progress to which we are used. 3/
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