Un piccolo aggiornamento che riguarda la contagiosità della nuova variante, VUI-202012/01 (non la scelta migliore per un nome). Niente di ufficiale ma uffciosamente gira attraverso le dichiarzioni di NERVTAG ed è meglio dare la notizia in maniera seria piuttosto che allarmista 1/
Il SAGE e NERVTAG (i due comitati scientifici che aiutano il PM) hanno pochi dubbi che questa variante sia effettivamente così tanto più contagiosa. Il mistero è: come è possibile che questa variantes possa essere così tanto più contagiosa in un periodo di relativo lockdown? 2/
Due possibilità: 1) questa variante è molto più infettiva nella popolazione generale, talmente tanto da superare le regole di distanziamento sociale tenute finora in UK; 2) questa variante è più infettiva soltanto in quella frazione della popolazione che non ha fatto lockdown 3/
In UK le scuole sono rimaste aperte durante tutti questi mesi, con zero precauzioni sulla base del fatto che i sembrassero effettivamente meno sensibili al contagio. Questa variante potrebbe aver guadagnato fitness tra i bambini in quel modo. 4/
E questo spiegherebbe perfettamente un tale aumento di contagio generale e soprattutto la misteriosa capacità di prendere il sopravvento sull'altro ceppo. 5/

uk.reuters.com/article/uk-hea…
*NON* - ripeto NON - ci sono stati casi di malattia nei bambini negli ultimi mesi quindi la buona notizia è che non ci sarebbe più rischio per loro. Ma il virus potrebbe aver imparato a girare anche tra i bambini e questo avrebbe grosse ripercussioni sulla scuola 6/
Da un lato sarebbe una buona notizia. L'implicazione è che non è un virus super contagioso: è soltanto un virus un po' più contagioso o egualmente contagioso ma che sviluppa affinità per i i bambini. 7/
Il governo inglese ha inizato piani monitoraggio dei contagi nelle scuole già all'inizio di Dicembre. Oggi Johnson ha annunciato che la riapertura delle scuole in Gennaio è in discussione. Neil Ferguson ha iniziato ad avanzare le prime ipotesi in questione. 8/
Chiaramente sono notizie che vanno date senza allarmismo e spero di averlo fatto. La buona notizia è che non si tratterebbe di qualcosa di inerentemente più contagioso né di qualcosa di resistente al lockdown. La cattiva notizia è che dovremmo rivedere la politica dell'educazione

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23 Dec
Stamattina sono stato intervistato da dei bravi giornalisti di Radio Capital riguardo la variante virale in circolazione (Ieri da TgCom24). La domanda che ovviamente viene posta è: dobbiamo preoccuparci? 1/
La mia risposta è sì, ma solo a patto di ricordarci prima l'etimologia della parola: pre-occuparci. Occuparci di qualcosa prima che accada. Preoccuparsi vuol dire prepararsi. Preoccuparsi senza prepararsi è un concetto vuoto che non esiste e non serve a nulla. 2/
È importante che il pubblico chieda più pre-occupazione a chi ha il potere di farlo. Più preparazione per cosa si spera arriverà (es: i vaccini) e più preoccupazione per ciò che potrebbe arrivare (es: nuove varianti). Non vuol dire stare chiusi in casa col rosario in mano 3/
Read 7 tweets
21 Dec
La variante Inglese VUI-202012/01 è importante per due motivi. Uno è "che cosa potrebbe fare" e il secondo è "che cosa rappresenta". Sono entrambe questioni cruciali e vanno affrontate in maniera fredda e separata. Lo copro qui come traduzione di questo 1/
Inziamo da "che cosa rappresenta". Mutazioni nel virus succedono in continuazione and a migliaia sono già state caratterizzate e studiate, se non altro come metodo di tracciare i contagi a livello nazionale. Il sito sotto ne contiene i dati di migliaia 2/

nextstrain.org/ncov/global
Se ci sono migliaia di varianti, perchè questa è cosi speciale? Dal punto di vista genetico, l'aspetto più unico di questa variante è che cambia MOLTO dalla linea parentale da cui si è evoluta. È come se avesse fatto un salto improvviso, piuttosto che piccoli passetti. 3/
Read 22 tweets
21 Dec
There are two issues with the English variant, as it is now referred. One issue is "what it could do" and the other issue is "what it could represent". They are both important and we know just enough to make hyphoteses that can drive to experiments. I'll try and explain 1/
Let's start with the latter: what does it represent? Mutations happen all the time and variants have been recorded in the thousands. The website below shows several 1000s different variants recorded in different countries. Why is this SO special? 2/

nextstrain.org/ncov/global
The most special aspect of this variant is that the number of changes it shows is a large disconnect from its parental line as if this lineage made a big sudden jump rather than the usual slow progress to which we are used. 3/
Read 20 tweets
20 Dec
Rilasciati orora alcuni dettagli che hanno motivato le decisioni Inglesi di ieri. È un breve sommario di NERVTAG, la task force governativa specializzata in minacce virali emergenti. 1/

khub.net/documents/1359…
Nella sostanza, poco di nuovo ma c'è qualche numero in più - e non è incoraggiante.

L'aumento di contagio è stimato sempre al 70% (tra il 67% e il 75%) sulla base di come cresce la frequenza di questo nuovo ceppo nel tempo. 2/
Questo corrisponde ad un aumento del numero R cha va da un MINIMO di 0.4 a un massimo di 0.9. Si tratta di numeri molto grandi. Tanto per confrontare: chiudere tutte le scuole abbassa il numero R di ~0.6

3/
Read 6 tweets
19 Dec
Tra poco (alle 17 ore Italiane) Boris Johnson dovrebbe tenere una conferenza stampa straordinaria per parlare di una nuova variante di SarsCov2 isolata recentemente in Inghilterra che aumenta la contagiosità del virus del 50%. Spiego di cosa si tratta. 1/

La settimana scorsa Johnson aveva annunciato non grossi cambiamenti alle chiusure di Dicembre durante le feste natalizie, con aperture nei giorni di Natale che consentissero la riunione di fino a tre nuclei familiari. Questa nuova variante sta cambiando le carte in tavola 2/
Ora pare che verrà introdotto un livello di chiusura nuovo - il livello 4 - e che Londra e il sud ovest ripiomberanno nell'ordine di non uscire di casa, come a Marzo, senza nemmeno le scappatoie a tarallucci e vino Italiane annunciate ieri da Conte. 3/

Read 15 tweets
11 Dec
Vedo che questo paper sta facendo il giro tra i soliti noti. Fatemi spiegare cosa dice prima che si diffondano troppi fraintendimenti. Lo spiego qui sotto. 1/8
Il paper (che BTW è apparso su Nature Communication, e non Nature) racconta dei risultati sulla ricerca a tappeto fatta a Wuhan le ultime due settimane di Maggio. Circa 9.9M di persone sottoposte "volontariamente" al tampone. 2/8 nytimes.com/2020/05/26/wor…
Di questi 9.9M, 300 persone sono risultate positive ma asintomatiche. Sono state isolate loro e testati di nuovo tutti i loro contatti (1.2k persone). Nessun contatto è stato trovato positivo. Ne deduciamo che gli asintomatici non trasmettono il virus? No. 3/8
Read 9 tweets

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