Thread by @giorgiogilestro

La variante Inglese VUI-202012/01 è importante per due motivi. Uno è "che cosa potrebbe fare" e il secondo è "che cosa rappresenta". Sono entrambe questioni cruciali e vanno affrontate in maniera fredda e separata. Lo copro qui come traduzione di questo 1/

https://twitter.com/giorgiogilestro/status/1340968725902716931

Inziamo da "che cosa rappresenta". Mutazioni nel virus succedono in continuazione and a migliaia sono già state caratterizzate e studiate, se non altro come metodo di tracciare i contagi a livello nazionale. Il sito sotto ne contiene i dati di migliaia 2/

nextstrain.org/ncov/global

Se ci sono migliaia di varianti, perchè questa è cosi speciale? Dal punto di vista genetico, l'aspetto più unico di questa variante è che cambia MOLTO dalla linea parentale da cui si è evoluta. È come se avesse fatto un salto improvviso, piuttosto che piccoli passetti. 3/

Ci sono pochissimi motivi che possono giustificare questo salto. Uno di questi, considerato il più probabile, è che il salto sia avvenuto perchè il virus cercava di scappare da un organismo che avesse una risposta immune statica (non adattiva) e relativamente debole 4/

Un organismo di questo tipo è un paziente immunodepresso che viene trattato con mix anticorpali donati da pazienti guariti (il famoso plasma). Qualcuno che non produce anticorpi di suo e se li fa iniettare in ospedale. Ovviamente il mix iniettato è costante. Non si adatta 5/

In seguito a questo trattamento si verifica pressione evolutiva: la maggiorparte del virus in corpo viene fermato dall'iniezione di plasma. Se esiste però in circolo una variante che riesce a scappare per puro caso, allora questa si affina 6/

Come si scappa da un mix anticorpale? 1) Cambiando la affinità verso gli anticorpi, attraverso mutazioni sulla proteina spike che viene riconosciuta dagli stessi; 7/

2) aumentando la velocità di crescita per cercare di vincere la gara di velocità o 3) con un mix di entrambi. Il ceppo in questione mostra di avere, sulla carta, entrambe le caratteristiche a sostegno della ipotesi della sua genesi. 8/

Ora che è chiaro come potrebbe essere nato, si capisce meglio cosa potrebbe fare. Potrebbe portare a re-infezione e potrebbe crescere più velocemente della linea parentale 9/

I dati sulla prevalenza mostrano che questa nuova linea ha, nel giro di due tre settimane, preso il sopravvento su quella precedente. I virus competono tra di loro, non solo contro di noi. Questo ceppo ha sbaragliato la concorrenza 10/

https://twitter.com/alanmcn1/status/1340352022244188162

Era già successo che un ceppo prendesse il sopravvento, per esempio questa estate con quello spagnolo. Era però una circostanza diversa perchè si veniva da lockdown e il ceppo spagnolo, importato dai vacanzieri, aveva praterie su cui correre, senza concorrenza di altri ceppi. 11/

In questo caso però il sopravvento si è verifcato 1) velocemente e in tutto il paese 2) in un periodo in cui altri ceppi giravano sostenuti 3) durante un lockdown relativo. Tutto molto molto diverso dall'estate /12

Quindi, l'ipotesi di lavoro è che questa variante si propaghi velocemente e riesca a scappare alla difesa immune esistente. È anche più virulenta? Non lo sappiamo. È troppo presto per dire se sia più O MENO virulenta ma lo sapremo presto perchè è ormai l'unica in circolazione 13/

Può portare a re-infezioni? In principio, sì. Però in soggetti reinfetti non troverebbe il confort di un plasma che non cambia, ma un vero sistema immunitario che risponde adattandosi quindi sarebbe trattata come qualsiasi altro virus. 14/

È immune al vaccino? Ricordiamoci che i vaccini sono stati tutti disegnati per produrre quell'esatto mix anticorpale che questa variante ha imparato ad eludere, quindi sì potrebbe essere almeno parzialmente immune. 15/

Difficile che sia completamente immune ma molto possibile che riduca l'efficacia rispetto a quel 95% che abbiamo accolto in trionfo. Questo ci deve far riflettere su come dovremo disegnare e selezionare vaccini futuri. 16/

Una efficacia più bassa insieme a un numero R più alto vorrebbe dire che diventa molto più complicato raggiungere la famosa immunità di gregge. 17/

Quindi, andiamo avanti con i vaccini ma considerando che non saranno la fine dei giochi. Stiamo entrando in uno scenario simile a quello influenzale in cui ci si potrebbe dover vaccinare ogni anno. 18/

Per ora questo virus è piu contagioso dell'influenza e molto meno stagionale quindi ha dalla sua la velocità. 19/

Un'ultima nota. Questo episodio dimostra che cambiamenti repentini nel comportamento virale possono capitare e man mano che applicheremo pressione evolutiva potranno essere più frequenti. Più il virus gira, più gli diamo possibilità di cambiare. 20/

Questa credo sia la pietra tombale delle dichiarazioni che dicono che bisogna lasciarlo correre. Più corre, maggiore è la probabilità che nasca una prossima variante ed è una lotteria che non vale la pena giocare 21/FINE

Aggiungo in appendice: hanno fatto bene a chiudere le frontiere? È quasi sicuramente troppo tardi ma visto il periodo natalizio hanno sicuramente fermato una grossa fetta di movimenti e rallentato. È comunque una di quelle decisioni di real-politik in cui come ti muovi, sbagli.