Thread by @mellziland

Palavras como "mutações", "variantes" assustam ,não é? Especialmente quando as mídias internacionais volta os olhos para o Brasil, para noticiar dados sobre esse tema.

Nesse fio, vou falar um pouco sobre a variante em Manaus, e também sobre algumas outras. Vamos?

As referências que eu estarei citando no fio são:
1- virological.org/t/tracking-the…
2- virological.org/t/phylogenetic…
3- virological.org/t/genomic-char…

Recomendo seguir o @CaddeProject a @atrvlncc @PaolaResende1 @nmrfaria @candido_darlan e tantos cientistas brasileiros envolvidos nessa vigilância

Cronologicamente, o governo do Japão anunciou, no dia 10/01, que detectou em seu território uma nova variante do coronavírus, em quatro viajantes que vieram do Brasil para o Japão

dw.com/pt-br/jap%C3%A…

De acordo com a reportagem do @dwnews "os quatro passageiros estavam no Amazonas e desembarcaram no aeroporto internacional de Tóquio em 2 de janeiro".

Recentemente, no dia 12/01, um estudo foi publicado mostrando semelhanças dessa variante com outras já relatadas

Trata-se de um estudo brasileiro com a participação do @GrafTiago @PaolaResende1 entre tantos outros nomes queridos.

virological.org/t/phylogenetic…

No estudo acima, comenta-se sobre as linhagens que já estamos conhecendo e ouvindo falar:

1) B.1.1.7 no Reino Unido (exclusão HV 69-70, exclusão Y144, N501Y, A570D, P681H, T716I, S982A, D1118H)
2) B.1.351 na África do Sul (L18F, D80A, D215G, R246I, K417N, E484K, N501Y e A701V)

Mell, socorro! O que são todas essas letras e números dentro dos parênteses?

Então, são as substituições (ou exclusão) de um aminoácido (representado pela 1ª letra), por outro (representado pela 2ª letra, em que os números indicam a posição na sequência em que isso aconteceu

Vejam que em ambas variantes B.1.1.7 e B.1.351 temos a presença da mutação N501Y. Essa mutação ocorre na região da Spike, mais especificamente no domínio de ligação ao receptor (RBD).

virological.org/t/preliminary-…

Em teoria, as alterações nesta parte da proteína Spike podem, fazer com que o vírus se torne mais infeccioso e se espalhe mais facilmente entre as pessoas. Mas como mencionei, somente com estudos robustos é que podemos ver se, na prática, se confirma. Portanto, cautela!

Nesse fio, comento um pouco das variantes descritas no Reino Unido e na África do Sul

https://twitter.com/mellziland/status/1346605179903352834

Num artigo publicado ainda em Dezembro (20) de 2020 (virological.org/t/preliminary-… ), relata-se a detecao da uma nova linhagem B.1.1.7 no UK.

Trabalhos associaram o rápido crescimento de casos em UK a detecao dessa nova variante, levantando indícios de que ela pode ter uma maior transmissibilidade, ainda que não tenha alterado a letalidade:

virological.org/t/transmission…

cmmid.github.io/topics/covid19…

virological.org/t/lineage-spec…

Voltando para o contexto do Brasil, a pandemia do SARS-CoV-2 aqui foi dominada por duas linhagens designadas como B.1.1.28 e B.1.1.33 que provavelmente surgiram no país em fevereiro de 2020.

No final de 2020, um estudo coordenado pela @atrvlncc descreveu uma nova variante no RJ que se distinguiu por cinco mutações, incluindo uma na proteína Spike (E484K), também detectada no B .1.351 (linhagem Sul-Africana) medrxiv.org/content/10.110…

cultura.uol.com.br/noticias/15048…

Essa variante B.1.1.28 (que contem a mutação E484K), foi posteriormente detectado em outros estados brasileiros e ainda associado a dois casos de reinfecção em pacientes originalmente infectados pela linhagem B.1.1.33.

Por isso usar máscara, mesmo nos recuperados de COVID-19

Segundo o estudo brasileiro, 148 sequências do genoma completo SARS-CoV-2 do estado do Amazonas foram analisadas, identificou-se 69 (47%) sequências B.1.1.28 de diferentes municípios entre 13/04 e 13/11/2020, sendo a linhagem viral mais prevalente em neste estado brasileiro

Após + análises no trabalho, com 18 novas cepas da região coletadas entre o mês 5 a 11/2020, suportam que as cepas SARS-CoV-2 B.1.1.28 em viajantes japoneses retornando da região amazônica brasileira provavelmente evoluíram de uma linhagem que circula no Amazonas desde Abril/2020

Inclusive, todos os parabéns ao @fnaveca e equipe por esse trabalho incrível!

bbc.com/news/uk-556661…

Ainda, os dados preliminares apontam que a rápida taxa de mutação detectada na nova linhagem é um fenômeno recente que provavelmente ocorreu entre dezembro de 2020 - janeiro de 2021.

Será que isso pode ter relação com a alta transmissão nesse período? Sabemos que quanto mais intensa e prolongada a transmissão, maior o acúmulo de mutações que o vírus pode ter

No dia 13/01, um estudo conduzido por @nmrfaria (que colaborou muito pra esse fio!) e o pessoal incrível do @CaddeProject se propôs a investigar as linhagens recém-circulantes em Manaus, em 37 amostras de pacientes entre 15-23/12/2020

virological.org/t/genomic-char…

Esse estudo foi noticiado por uma brilhante reportagem de @andre_biernath da @bbcbrasil em que, desses, 13 indivíduos (ou 42% do total) apresentavam justamente essa nova linhagem, chamada de linhagem P.1 (Manaus, "descendente" da B.1.1.28)

bbc.com/portuguese/bra…

Na P.1, dentre as alterações presentes, encontra-se 2 mutações de interesse, ocorrendo na Spike:

- E484K ocorre no domínio de ligação ao receptor (RBD) que o vírus usa para se ligar ao receptor ACE2 humano

- N501Y também ocorre no RBD do vírus (comentada anteriormente)

Ambas as mutações compartilhadas entre P1 e B.1.351 (África do Sul) parecem estar associadas a um rápido aumento nos casos em locais. Portanto, é essencial investigar se há um aumento na taxa de reinfecção em indivíduos previamente expostos.

[FIO EM CONSTRUÇÃO - MELL AT WORK]

@andre_biernath traz alguns pontos excelentes na parte final do trabalho do @nmrfaria e colaboradores. As pesquisas seguirão sendo feitas para entendermos, cada vez mais, as variantes aqui do Brasil e quais são seus impactos na pandemia da COVID-19

Recentemente, @nmrfaria @CaddeProject e colaboradores publicaram um estudo melhor caracterizando a distribuição internacional das linhagens B.1.1.7 (UK) e B.1.351 (África do Sul)

virological.org/t/tracking-the…

Em 7 de janeiro de 2021, 45 países relataram a presença de B.1.1.7 e 13 países relataram B.1.351/501Y.V2.

No trabalho, chama-se a atenção que a quantidade dessas sequências das variantes em cada país é uma consequência:

- da intensidade da vigilância genômica local;
- o nível de preocupação com a introdução de novas variantes;

- o volume de viagens internacionais entre os países afetados e
- a quantidade de transmissão local após a introdução da linhagem de outro lugar.

Os dados de voos de passageiros não incluem mudanças recentes nas viagens de férias e as restrições recentes nas viagens do Reino Unido e da África do Sul não são refletidas nos dados de mobilidade.

Mas sabemos, por exemplo, que a descoberta e rápida disseminação de B.1.1.7 e B.1.351/501Y.V2 destaca a importância de dados abertos e em tempo real para rastrear a disseminação de SARS-CoV-2 e para informar futuras intervenções de saúde pública e conselhos de viagem.

Inclusive a nova variante pode fazer com que países de várias partes do globo bloqueiem voos vindos do Brasil.

No Reino Unido, o primeiro-ministro Boris Johnson já admitiu essa possibilidade.

Veja mais na matéria de @andre_biernath bbc.com/portuguese/bra…

Aqui, um tuíte do @EricTopol que ajuda a gente a não se perder no nome das variantes e o local em que elas foram primeiramente descritas:

1. B.1.1.7 "UK"
2. 501Y.V2 (aka B.1.351) "África do Sul"
3. P.1 "Brasil"

https://twitter.com/EricTopol/status/1349509774870683649

Mell, O QUE FAREMOS??????

Já venho falando por aqui e retomarei: todas essas variantes são variações do SARS-CoV-2 (falei obviedades, mas tu vai entender onde quero chegar). Sendo assim, existem medidas de enfrentamento que funcionam muito contra o SARS-CoV-2!

Quais?

✅ Uso correto de máscara (não no queixo, não no seu bolso/sua bolsa, cobrindo adequadamente nariz e boca)
✅ Evitar aglomerações e isso inclui a sua desejada praia, parque, festinha, rolê, bar
✅ Higienização adequada e ambientes abertos/bem ventilados/arejados

Ainda que a variante possa ser mais transmissível, temos que lembrar que somos os vetores desse vírus, ou seja, nosso comportamento pode facilitar ou dificultar a transmissão dele

https://twitter.com/mellziland/status/1340357329116684293

Ainda, nada hoje nos indica que as vacinas não teriam uma capacidade abrangente para as variantes. Estudos devem ser conduzidos mostrando que anticorpos vindos da imunização com vacina são capazes de neutralizar essas variantes

https://twitter.com/mellziland/status/1341776896279916547

Inclusive, estudos da Pfizer já estão mostrando que são capazes - uhuuu!
E estaremos vendo mais estudos sendo publicados analisando isso.

biorxiv.org/content/10.110…

Para saber mais como funciona esse mecanismo de surgimento de novas variantes, o @AndersonBrito_ nos explica super bem nesse fio:

https://twitter.com/AndersonBrito_/status/1341589500435320834

E recentemente ele fez uma live com o pessoal do @olaciencia falando muito sobre!

https://twitter.com/AndersonBrito_/status/1348295579906949124

E POR FIM, FICOU COM DÚVIDA?
Vem pra nossa live pela Rede @analise_covid19 que vai ter o @AndersonBrito_ o @nmrfaria e a @atrvlncc (autores de vários artigos citados nesse fio) na Sexta-Feira, às 19h (horário de Brasília) no link

NÃO PERDE! e cuide-se 🌻

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Matéria super legal do @cienciausp sobre o trabalho do @CaddeProject !

https://twitter.com/cienciausp/status/1349793725208264713

Fio do @otavio_ranzani

https://twitter.com/otavio_ranzani/status/1349076583747899394?s=20