Le Conseil scientifique vient de rendre un avis sur le variant P1 🇧🇷.

Une donnée un peu surprenante, qui tranche avec ce qu'on a pu lire récemment : selon le CS, son niveau de transmission serait plus élevé que les souches historiques, mais moins que le variant B.1.1.7 🇬🇧.
Pour arriver à cette conclusion, le Conseil scientifique cite différentes études.

Brésil : "Les données brésiliennes estiment que le variant BR-P1 serait de 1,4 à 2,2 fois plus transmissible que le virus historique."
Chili : "Les premières études de modélisation
confirment un niveau de transmission augmenté (environ +30%) par rapport au virus historique."

Italie : "Les estimations sur l’augmentation de la
transmissibilité du variant BR-P1 comparé au virus historique étaient de +12% à +39%."
La transmissibilité du variant est une question centrale, qui est loin d'être tranchée.

On peut citer deux autres publications brésiliennes, plus pessimistes :

- Une étude génomique, publiée dans Science : variant 1,7 à 2,4 fois plus transmissible.
science.sciencemag.org/content/early/…
- Autre étude en pré-print : variant 2,6 fois plus transmissible que les souches historiques.

medrxiv.org/content/10.110…

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18 Apr
Un point sur la situation sanitaire en Inde, où le système hospitalier est en voie d'effondrement.

Le taux d'incidence a grimpé à la verticale, et le nombre de décès semble suivre la même dynamique.
Pour faire face à cet afflux de patients, les hôpitaux de New Delhi, du Gujarat et du Maharashtra manquent cruellement de lits et d'oxygène.

On voit de nombreuses images de patients sous oxygène partageant le même lit, à deux voire trois personnes.
A Ahmedabad, faute de place à l'hôpital, les patients sont traités dans une centaine d'ambulances garées en file indienne dans la rue.

Read 18 tweets
16 Apr
Dans cette période d'inquiétude légitime, il faut prendre garde de ne pas lier toute information dramatique sur le Brésil au variant P1.

Exemple : cet article qui fait état d'un nombre alarmant de décès chez les bébés dans le pays (entre 500 et 1.300).

bbc.com/news/world-lat…
Le problème semble bien antérieur à la prise du pouvoir du variant P1 au début de cette année. La létalité chez les enfants hospitalisés serait même plutôt en baisse en 2021 (sans doute grâce à l'amélioration des soins).

agenciabrasil.ebc.com.br/saude/noticia/…
Sur les deux premiers mois de l'année, la proportion d'enfants et d'adolescents dans le nombre de décès au Brésil était en baisse (0,39%) par rapport à 2020 (0,62%).

(ces chiffres ne concernent que les 2 premiers mois de l'année, donc cela limite l'impact éventuel du variant)
Read 8 tweets
9 Apr
Il y a un an un article de presse rapportait un cluster dans une église de Seattle. 52 contaminations, 2 décès.

Une histoire tristement banale. Sauf que l'élément central dans notre compréhension de la Covid-19 y était contenu. La contamination aérosol.

latimes.com/world-nation/s…
Le journaliste du Los Angeles Times envisageait la possibilité d'une contamination aérosol, ce qui relevait alors du blasphème scientifique, pour ne pas dire de la fake news. L'OMS avait vivement nié que la contamination puisse être aéroportée dans un "fact check" sans équivoque. ImageImage
Pourquoi cette chorale a de l'importance ? Parce que la contamination aérosol était la seule possibilité pour expliquer que 52 personnes puissent se contaminer en 3h. Des chercheurs se sont emparés d'elle pour pousser la thèse d'un virus aéroporté, qui s'est par la suite imposée. Image
Read 5 tweets
9 Apr
L'Institut Pasteur estime que 36,5% de la population d'Ile-de-France a été infecté par le coronavirus. 28% en PACA, 22% dans les HDF, 20,5% en ARA, contre 7,5% en Bretagne.

En tout, 20,5% des Français métropolitains auraient été contaminés.

pasteur.fr/fr/espace-pres… Image
La méthode utilisée par l'Institut Pasteur pour obtenir cette estimation vient d'être publiée dans The Lancet. C'est une modélisation effectuée à partir des études de séroprévalence et des données d'hospitalisation par tranche d'âge.

thelancet.com/journals/lanpu… ImageImage
Cette méthode permet d'estimer que la France détecte un peu plus de 50% des cas réels depuis le 1er juin 2020.

Une détection logiquement plus efficace chez les personnes de plus de 50 ans que chez les jeunes, moins symptomatiques. Image
Read 4 tweets
9 Apr
L'Allemagne revient sur la gestion fédérale de la pandémie. Une modification de la loi sur les épidémies va rendre automatique un "frein d'urgence" unifié dans tout le pays, à partir d'un taux d'incidence de 100.

tagesspiegel.de/politik/corona…
Le "frein d'urgence" est l'équivalent soft du "reconfinement" français et consiste à revenir sur les ouvertures (commerces, musées...) et peut-être ajouter des restrictions de contact (voire de sortie?). Les termes de ce "frein d'urgence" restent à négocier.
L'objectif est d'en finir avec la cacophonie actuelle, où de nombreux Länder n'ont pas refermé leurs commerces malgré une incidence supérieure à 100, rompant ainsi l'accord négocié avec Merkel.
Read 7 tweets
9 Apr
Les points importants de l'avis de la Haute autorité de santé :

- utilisation pour les patients de moins de 55 ans ayant reçu une première dose d'Astra Zeneca d'une deuxième dose de Pfizer ou Moderna, à 12 semaines d'intervalle (avec leur accord)
- une décision justifiée par l'existence d'effets indésirables rares, par le caractère protecteur insuffisant d'une seule dose et l'existence d'un rationnel scientifique et de données chez l'animal (souris, macaque) concernant l'efficacité d'un mix de vaccins ARNm et adénoviral
- la Haute autorité de santé recommande de mettre en place une étude de cohorte pour évaluer la réponse immunitaire de ce schéma de vaccination mixte
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